MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.02

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020157	CTTT	2	8	23	30	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020157	CGCA	2	8	317	324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020157	AACC	2	8	1906	1913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020157	GCAA	2	8	6657	6664	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020157	AAGT	2	8	6736	6743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020157	CAAA	2	8	6904	6911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020157	GTAG	2	8	6915	6922	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020157	TTCC	2	8	10181	10188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020157	TTAA	2	8	11746	11753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020157	TATC	2	8	12385	12392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020157	TTTC	2	8	13519	13526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020157	AAGC	2	8	13785	13792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020157	GATG	2	8	13860	13867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020157	TAAT	2	8	13915	13922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020157	CAAA	2	8	13942	13949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020157	TGAT	2	8	13995	14002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020157	AATT	2	8	14013	14020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020157	TGGT	2	8	14541	14548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020157	TTGC	2	8	16532	16539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020157	AATA	2	8	20304	20311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020157	TAGA	2	8	20414	20421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020157	TAAT	2	8	20522	20529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020157	GGAG	2	8	20858	20865	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020157	ATTT	2	8	21212	21219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020157	GTAA	2	8	23259	23266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020157	GTAG	2	8	28280	28287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020157	TAAT	2	8	28360	28367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020157	AAGT	2	8	30263	30270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020157	TTAC	2	8	30381	30388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020157	ATAA	2	8	31502	31509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020157	ATTT	2	8	32552	32559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020157	TTGG	2	8	35877	35884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020157	ATCT	2	8	38207	38214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020157	GTTT	2	8	38258	38265	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020157	AATC	2	8	38398	38405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020157	ATAA	2	8	39111	39118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020157	TTTA	2	8	39161	39168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020157	TATT	2	8	41593	41600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020157	ATCT	2	8	41623	41630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020157	CTTT	2	8	47641	47648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020157	ATCT	2	8	48515	48522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020157	GTAG	2	8	48698	48705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020157	TACT	2	8	49135	49142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020157	ATGG	2	8	49183	49190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020157	AAAT	2	8	49875	49882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020157	ATTT	2	8	51689	51696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020157	ATTT	2	8	51700	51707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020157	TTAA	2	8	52034	52041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020157	TAGA	2	8	53581	53588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020157	AGAA	2	8	53664	53671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020157	AATC	2	8	53838	53845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020157	TTTC	2	8	54642	54649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020157	GTAA	2	8	54666	54673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020157	GCTC	2	8	54949	54956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020157	ATCA	2	8	56761	56768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020157	GTTA	2	8	59489	59496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020157	CGCA	2	8	62553	62560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020157	CAAT	2	8	69244	69251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020157	TAAG	2	8	76533	76540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020157	CCTA	2	8	76622	76629	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020157	TTTG	2	8	76735	76742	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020157	AAGC	2	8	78685	78692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020157	TTTA	2	8	79456	79463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020157	TTGG	2	8	79524	79531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020157	TTTA	2	8	79640	79647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020157	AATA	2	8	82872	82879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020157	GCTT	2	8	83551	83558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020157	TGAT	2	8	83652	83659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020157	AGTG	2	8	83742	83749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020157	AAAT	2	8	84461	84468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020157	GAAA	2	8	84566	84573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020157	ATTT	2	8	84708	84715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020157	TGTA	2	8	84754	84761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020157	CATT	2	8	90203	90210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020157	ACAG	2	8	93618	93625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020157	TAAT	2	8	94961	94968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020157	TGGC	2	8	95133	95140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020157	ATTA	2	8	95230	95237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020157	TAAT	2	8	95295	95302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020157	TTAC	2	8	95312	95319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020157	AAAG	2	8	95385	95392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020157	ATCC	2	8	96278	96285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020157	ATCC	2	8	97080	97087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020157	CCTA	2	8	102159	102166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020157	AAAC	2	8	104086	104093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020157	ATGA	2	8	106300	106307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020157	AGAC	2	8	107360	107367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020157	TATT	2	8	108505	108512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020157	TGTC	2	8	109557	109564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020157	GCTT	2	8	113338	113345	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020157	TAGA	2	8	115626	115633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020157	ATTG	2	8	115679	115686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020157	AGGA	2	8	115726	115733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020157	TTAT	2	8	117217	117224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020157	TGAC	2	8	117348	117355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020157	TTTA	2	8	118910	118917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020157	TCAA	2	8	118972	118979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020157	TCTA	2	8	119418	119425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020157	TTTA	2	8	121100	121107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020157	ATCA	2	8	124942	124949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020157	AAAC	2	8	125075	125082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020157	ATTT	2	8	135313	135320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020157	TCTT	2	8	144692	144699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020157	TAGA	2	8	144894	144901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020157	AATT	2	8	147967	147974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020157	TAAA	2	8	150136	150143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020157	TATG	2	8	150385	150392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020157	TAAT	2	8	150512	150519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020157	TCGC	2	8	151947	151954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020157	AATT	2	8	153463	153470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020157	AATT	2	8	153598	153605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020157	ATCT	2	8	154056	154063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020157	ATTT	2	8	159115	159122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020157	TTTA	2	8	160812	160819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020157	ATTA	2	8	160866	160873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020157	TTGA	2	8	160880	160887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020157	AGAT	2	8	161119	161126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020157	GCTT	2	8	164604	164611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020157	ATTT	2	8	164952	164959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020157	TATG	2	8	165150	165157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020157	TGGT	2	8	165454	165461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020157	CTTA	2	8	165642	165649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020157	CTAA	2	8	165709	165716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020157	ATTT	2	8	169403	169410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020157	ATTA	2	8	169423	169430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020157	GAAT	2	8	169458	169465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020157	ATTT	2	8	169591	169598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020157	CAGT	2	8	171105	171112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020157	AATA	2	8	171485	171492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020157	TGGA	2	8	171506	171513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020157	AGAT	2	8	171539	171546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020157	AAAT	2	8	172908	172915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020157	TTTA	2	8	175160	175167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.