MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.02

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020157	ATA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020157	AGA	2	6	179	184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020157	TCC	2	6	252	257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_020157	TGG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020157	CTG	2	6	303	308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020157	GAA	2	6	1611	1616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020157	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020157	TTA	2	6	1980	1985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020157	ATT	2	6	1996	2001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020157	AAT	2	6	2005	2010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020157	TAA	2	6	2083	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020157	TAA	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020157	TCT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020157	GTG	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020157	GAT	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020157	GCG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020157	TTG	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020157	AGA	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020157	ATA	2	6	6612	6617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020157	TAA	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020157	AAT	2	6	7107	7112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020157	AGA	2	6	7627	7632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020157	TTC	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020157	CAA	2	6	11565	11570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020157	TGA	2	6	11611	11616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020157	AAC	2	6	12363	12368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020157	TCT	2	6	12429	12434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020157	CTA	2	6	12469	12474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020157	ATA	2	6	13075	13080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020157	TGT	2	6	13144	13149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020157	AGT	2	6	13260	13265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020157	CAA	2	6	13541	13546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020157	CTG	2	6	13582	13587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020157	CTA	2	6	13609	13614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020157	ATT	2	6	13617	13622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020157	ATG	2	6	13956	13961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020157	ATT	2	6	14227	14232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020157	ATA	2	6	14508	14513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020157	TCT	2	6	16505	16510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020157	AGC	2	6	18711	18716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020157	TTA	2	6	18820	18825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020157	AGT	2	6	18828	18833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020157	CTG	2	6	18836	18841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020157	ATT	2	6	18853	18858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020157	TCA	2	6	18901	18906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020157	TGA	2	6	19028	19033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020157	ATG	2	6	19106	19111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020157	TAA	2	6	20187	20192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020157	ATT	2	6	20195	20200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020157	AAG	2	6	20312	20317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020157	ATT	2	6	20368	20373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020157	GCT	3	9	20495	20503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020157	CTA	2	6	20597	20602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020157	TCT	2	6	20725	20730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020157	GAA	2	6	20734	20739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020157	TGA	2	6	20792	20797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020157	GAT	2	6	20992	20997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020157	GAT	2	6	21260	21265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020157	CCA	2	6	21300	21305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020157	GCA	2	6	23249	23254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020157	ACC	2	6	23267	23272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020157	TTG	2	6	23363	23368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020157	AAT	2	6	26717	26722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020157	AGC	2	6	26764	26769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020157	ACC	2	6	28354	28359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_020157	ATT	2	6	30051	30056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020157	ATG	2	6	30077	30082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020157	TAT	2	6	30106	30111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020157	GGT	2	6	30406	30411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020157	TCC	2	6	31467	31472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020157	GAT	2	6	31525	31530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020157	AAC	2	6	31667	31672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020157	AGC	2	6	32412	32417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020157	CTT	2	6	32456	32461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020157	GTT	2	6	35863	35868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020157	TTA	2	6	35885	35890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020157	GTT	2	6	35891	35896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020157	ATT	2	6	35898	35903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020157	AGG	2	6	35920	35925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020157	TAT	2	6	36036	36041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020157	ATA	2	6	36118	36123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020157	TTG	2	6	37911	37916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020157	CTT	2	6	38044	38049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020157	TTA	2	6	38101	38106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020157	AAC	2	6	38109	38114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020157	TAA	2	6	38299	38304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020157	TGC	2	6	38317	38322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020157	AAT	2	6	38476	38481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020157	ATT	2	6	38486	38491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020157	CAA	2	6	38502	38507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020157	TTG	2	6	39131	39136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020157	CAA	2	6	39150	39155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020157	TGC	2	6	42399	42404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020157	TGT	2	6	42683	42688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020157	TAA	2	6	45847	45852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020157	GAA	2	6	45924	45929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020157	AAC	2	6	45934	45939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020157	AAT	2	6	45983	45988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020157	CAA	2	6	46007	46012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020157	AGG	2	6	47414	47419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020157	CAC	2	6	47517	47522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020157	CAT	2	6	47586	47591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020157	TAA	2	6	48533	48538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020157	TTA	2	6	48712	48717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020157	GAA	2	6	48810	48815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020157	AGA	2	6	48873	48878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020157	AAG	2	6	48898	48903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020157	GCA	2	6	48912	48917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020157	TGA	2	6	48952	48957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020157	AGG	2	6	49028	49033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020157	CAT	2	6	49034	49039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020157	ATG	2	6	49071	49076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020157	TGC	2	6	49208	49213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020157	GCA	2	6	49248	49253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020157	ATT	2	6	49277	49282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020157	TCA	2	6	49294	49299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020157	TAT	2	6	49323	49328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020157	CTG	3	9	49333	49341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020157	GAA	2	6	49485	49490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020157	AGT	2	6	49550	49555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020157	TAT	2	6	49812	49817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020157	AAT	2	6	49827	49832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020157	TGT	2	6	49837	49842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020157	TGA	2	6	49912	49917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020157	TTA	2	6	51986	51991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020157	ATC	2	6	52118	52123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020157	CTA	2	6	53506	53511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020157	TCT	2	6	53523	53528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020157	ATG	2	6	53544	53549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020157	TAA	2	6	53653	53658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020157	AAT	2	6	53680	53685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020157	ACA	2	6	53712	53717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020157	TTA	2	6	53734	53739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020157	TAA	2	6	53831	53836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020157	TAA	2	6	54038	54043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020157	CAA	2	6	54525	54530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020157	ACA	2	6	54533	54538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020157	AAT	2	6	54588	54593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020157	ACT	2	6	54789	54794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020157	TTA	2	6	54838	54843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020157	AAG	2	6	54847	54852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.