MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019942	TACC	2	8	36	43	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019942	GAAA	2	8	2171	2178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019942	TCCG	2	8	15667	15674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019942	AGGT	2	8	16835	16842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019942	TGGG	2	8	17309	17316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019942	AAAG	2	8	33495	33502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019942	TAAA	2	8	52082	52089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019942	CCCG	2	8	57897	57904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019942	CACT	2	8	57970	57977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019942	TCGT	2	8	57978	57985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019942	ATAA	2	8	66050	66057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019942	TATT	2	8	70143	70150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019942	ACCC	2	8	75159	75166	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_019942	AATA	2	8	75178	75185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019942	ATCA	2	8	90902	90909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019942	CCCG	2	8	96696	96703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_019942	CACT	2	8	96769	96776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019942	TCGT	2	8	96777	96784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019942	AAAT	2	8	106477	106484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019942	ATTT	2	8	109685	109692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019942	GGTA	2	8	125870	125877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019942	CTTA	2	8	128035	128042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019942	GTGA	2	8	132797	132804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019942	TAAA	2	8	145809	145816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019942	CCGT	2	8	161358	161365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019942	AAGA	2	8	169944	169951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019942	TAAA	2	8	172647	172654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019942	ACTC	2	8	176444	176451	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019942	CCGT	2	8	178879	178886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019942	TAAA	2	8	190169	190176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019942	TGCC	2	8	268098	268105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019942	GAAT	2	8	268138	268145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019942	GTAT	2	8	268198	268205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019942	GGAA	2	8	268209	268216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019942	TTCG	2	8	268768	268775	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019942	CCTT	2	8	269082	269089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019942	GCCA	2	8	269190	269197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019942	TTTC	2	8	269315	269322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019942	ATTG	2	8	269795	269802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019942	TATT	2	8	269820	269827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019942	GCCC	2	8	275793	275800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_019942	AGGT	2	8	281702	281709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019942	ATTG	2	8	284491	284498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019942	TTTA	2	8	289714	289721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019942	GAAA	2	8	293270	293277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019942	AATA	2	8	293288	293295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019942	CCAA	2	8	294308	294315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019942	TCAG	2	8	294435	294442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019942	ATAA	2	8	299998	300005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019942	ATGC	2	8	300012	300019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019942	CCTA	2	8	310717	310724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019942	TAAA	2	8	321100	321107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019942	AATC	2	8	327636	327643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019942	TTTA	2	8	366631	366638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019942	AGCG	2	8	374818	374825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019942	GAAA	2	8	374843	374850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019942	TACA	2	8	379862	379869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019942	AAAT	2	8	383460	383467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019942	ATTT	2	8	384273	384280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019942	GCCC	2	8	390646	390653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_019942	ATTT	2	8	390718	390725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019942	GAAC	2	8	392998	393005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019942	TATC	2	8	402442	402449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019942	ATGA	2	8	419723	419730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019942	CAAC	2	8	419774	419781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019942	TCTT	2	8	426516	426523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019942	TAAA	2	8	426594	426601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019942	TAAT	2	8	433395	433402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019942	GCAT	2	8	433407	433414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019942	TTAT	2	8	434253	434260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019942	CCCT	2	8	436342	436349	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_019942	ATAA	2	8	439863	439870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019942	GGAT	2	8	443199	443206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019942	TAAA	2	8	466771	466778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019942	CTGG	2	8	470257	470264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019942	AATA	2	8	470730	470737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019942	ATAC	2	8	472183	472190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019942	TGCA	2	8	477282	477289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019942	CCCA	2	8	477308	477315	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_019942	AAAT	2	8	488924	488931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019942	GTTG	2	8	502457	502464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019942	TACA	2	8	503458	503465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019942	CCAA	2	8	503853	503860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019942	CCGG	2	8	504066	504073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019942	CCCG	2	8	506116	506123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_019942	CTTT	2	8	508966	508973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019942	AATC	2	8	525053	525060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019942	TTAA	2	8	531842	531849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019942	TTTA	2	8	537040	537047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019942	ATTT	2	8	543818	543825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019942	ATAA	2	8	549491	549498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019942	AGTA	2	8	553807	553814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019942	ATAA	2	8	553815	553822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019942	TGGG	2	8	565558	565565	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019942	GTGG	2	8	569987	569994	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019942	CGAA	2	8	570047	570054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019942	AAAG	2	8	579828	579835	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019942	GCAG	2	8	579862	579869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019942	AGCA	2	8	583721	583728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019942	ATCT	2	8	600439	600446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019942	TCTA	2	8	600472	600479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019942	ACAT	2	8	604165	604172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019942	ATTC	2	8	606121	606128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019942	AGCG	2	8	617536	617543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019942	CAAA	2	8	617599	617606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019942	GTTG	2	8	617741	617748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019942	GAGC	2	8	617777	617784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019942	CATG	2	8	636459	636466	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019942	TTTA	2	8	636525	636532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019942	AGAA	2	8	643504	643511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019942	GCAG	2	8	643514	643521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019942	TAGG	2	8	643950	643957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019942	CATT	2	8	683002	683009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019942	TAAC	2	8	692241	692248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019942	ATAC	2	8	692423	692430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019942	TCAT	2	8	693550	693557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019942	ATTT	2	8	693586	693593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019942	AAAC	2	8	693920	693927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019942	ATAA	2	8	694950	694957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019942	ATTA	2	8	699927	699934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019942	TAAT	2	8	702977	702984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019942	TTTC	2	8	703133	703140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019942	GAGC	2	8	703156	703163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019942	GAAT	2	8	703362	703369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019942	TGAG	2	8	707382	707389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019942	ATTT	2	8	709367	709374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019942	CTTT	2	8	709493	709500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019942	AGAA	2	8	710077	710084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019942	AGAA	2	8	710113	710120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019942	ATTA	2	8	718243	718250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019942	TTTC	2	8	726512	726519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019942	TAAT	2	8	728706	728713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019942	TAGA	2	8	728742	728749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019942	ATTT	2	8	728778	728785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019942	TTAT	2	8	728897	728904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019942	TTAT	2	8	741371	741378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019942	AAAT	2	8	753755	753762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019942	AGAA	2	8	760931	760938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019942	TCCC	2	8	765217	765224	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_019942	CCCA	2	8	792899	792906	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019942	CATA	2	8	810224	810231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019942	CATA	2	8	810236	810243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019942	TTTC	2	8	818649	818656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019942	TTGG	2	8	819046	819053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019942	AATA	2	8	845524	845531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019942	GGAA	2	8	845541	845548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019942	TAAA	2	8	859114	859121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019942	TTTG	2	8	866296	866303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019942	TGAA	2	8	866350	866357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019942	ATTT	2	8	879744	879751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019942	ATAA	2	8	884931	884938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_019942	TATC	2	8	1423928	1423935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.