MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	ATTT	2	8	178	185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019774	GCAA	2	8	4310	4317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019774	CTTT	2	8	5602	5609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019774	GGAC	2	8	5833	5840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019774	CATA	2	8	5894	5901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019774	TCTA	2	8	7415	7422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019774	TCTT	2	8	7966	7973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019774	GTAG	2	8	8153	8160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019774	CCAA	2	8	11625	11632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019774	ACTT	2	8	11763	11770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019774	CCAA	2	8	11779	11786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019774	TAGT	2	8	12415	12422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019774	CTAC	2	8	14389	14396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019774	AAAG	2	8	14575	14582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019774	CAGA	2	8	14937	14944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019774	ATAG	2	8	15126	15133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019774	TTAT	2	8	15222	15229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019774	GTCC	2	8	15288	15295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019774	AAAG	2	8	15519	15526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019774	TATT	2	8	19327	19334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019774	TAAT	2	8	20305	20312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019774	ATAC	2	8	20371	20378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019774	GCCA	2	8	20654	20661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019774	TAAT	2	8	20884	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019774	CTTG	2	8	25991	25998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019774	TGAA	2	8	31739	31746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019774	AATC	2	8	31810	31817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019774	TGAA	2	8	32687	32694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019774	TGAG	2	8	35620	35627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019774	AAAC	2	8	35739	35746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019774	TCAA	2	8	35748	35755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019774	AACA	2	8	48796	48803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019774	TTAC	2	8	51374	51381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019774	AACT	2	8	51394	51401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019774	AATC	2	8	51528	51535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019774	GATT	2	8	52573	52580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019774	ATTT	2	8	54324	54331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019774	TATG	2	8	56616	56623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019774	CCAA	2	8	58692	58699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019774	TAAT	2	8	58847	58854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019774	ATCA	2	8	59072	59079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019774	ATTG	2	8	62659	62666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019774	GATG	2	8	62681	62688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019774	AACC	2	8	62699	62706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019774	AAGC	2	8	62760	62767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019774	TATT	2	8	62890	62897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019774	AAGT	2	8	63402	63409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019774	AAAG	2	8	65502	65509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019774	AAAT	2	8	65522	65529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019774	TAAA	2	8	65550	65557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019774	CTTG	2	8	66841	66848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019774	GTTT	2	8	70885	70892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019774	TTCT	2	8	71020	71027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019774	AATT	2	8	71147	71154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019774	AAAT	2	8	71159	71166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019774	AGCC	2	8	73685	73692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019774	AGAA	2	8	73701	73708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019774	GAAT	2	8	73723	73730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019774	AAAG	2	8	73888	73895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019774	AATT	2	8	80604	80611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019774	CAAC	2	8	80634	80641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019774	TAAA	2	8	83915	83922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019774	GGTT	2	8	84181	84188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019774	AATT	2	8	84212	84219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019774	TAAT	2	8	95995	96002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019774	GGTT	2	8	96155	96162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019774	TTAT	2	8	96211	96218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019774	AATA	2	8	96223	96230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019774	GCTT	2	8	96798	96805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.