MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	AAC	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019774	CTA	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019774	CAT	2	6	187	192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019774	AAG	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019774	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019774	GTT	2	6	258	263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019774	TTC	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019774	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019774	ATC	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019774	ATA	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019774	CCG	2	6	5370	5375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019774	TCA	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019774	TCT	2	6	5469	5474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019774	TGG	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019774	GTG	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019774	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019774	AAC	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019774	TGA	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019774	TGT	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019774	GTT	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019774	TTC	2	6	7577	7582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019774	TAT	2	6	7595	7600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019774	TTC	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019774	TAA	2	6	7628	7633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019774	CTG	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019774	TAA	2	6	7741	7746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019774	TCT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019774	ATT	3	9	7783	7791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019774	TTA	2	6	7877	7882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019774	ATT	2	6	7976	7981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019774	ATT	2	6	8087	8092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019774	TAT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019774	AAT	2	6	8423	8428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019774	CAG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019774	TCT	2	6	11519	11524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019774	GCT	2	6	11582	11587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019774	AAC	2	6	11688	11693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019774	TGA	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019774	ATA	2	6	11755	11760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019774	TCA	2	6	11790	11795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019774	GGT	2	6	11815	11820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019774	ATC	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019774	TGC	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019774	GAT	2	6	12377	12382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019774	GTT	2	6	13136	13141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019774	TAG	2	6	13255	13260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019774	AGG	2	6	13283	13288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019774	TGT	2	6	14217	14222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019774	AGA	2	6	14439	14444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019774	TAA	2	6	14456	14461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019774	TAA	2	6	14567	14572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019774	TAA	2	6	14667	14672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019774	TAA	3	9	14757	14765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019774	GAA	3	9	14782	14790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019774	TTA	2	6	14803	14808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019774	GAA	2	6	14823	14828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019774	CAG	2	6	14884	14889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019774	ATT	2	6	14915	14920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019774	ATA	2	6	14949	14954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019774	GAA	2	6	14967	14972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019774	ACA	2	6	15215	15220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019774	TCA	2	6	15318	15323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019774	GTT	2	6	15352	15357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019774	ATA	2	6	15502	15507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019774	CCA	2	6	15546	15551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019774	ACC	2	6	15560	15565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019774	AGA	2	6	15654	15659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019774	ATG	2	6	15675	15680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019774	GCG	2	6	15752	15757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019774	ATT	2	6	15759	15764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019774	GAT	2	6	15822	15827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019774	ATT	2	6	18766	18771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019774	ATT	2	6	18776	18781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019774	TCA	2	6	20329	20334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019774	AGC	2	6	20741	20746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019774	TAC	2	6	20899	20904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019774	CAT	2	6	23535	23540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019774	CTA	2	6	23600	23605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019774	ATT	2	6	26049	26054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019774	TAA	2	6	26082	26087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019774	TCT	2	6	26819	26824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019774	AAT	2	6	26870	26875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019774	ATT	2	6	26890	26895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019774	AAT	2	6	26947	26952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019774	TCA	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019774	GAG	2	6	26963	26968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019774	GAA	2	6	31407	31412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019774	CAT	2	6	31750	31755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019774	CTC	2	6	31762	31767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019774	CTT	2	6	31782	31787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019774	CAA	2	6	31798	31803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019774	ATC	2	6	32769	32774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019774	TAA	2	6	33928	33933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019774	AAC	2	6	33947	33952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019774	TAT	2	6	35224	35229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019774	GAG	2	6	35235	35240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019774	TAA	2	6	35317	35322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019774	AAT	2	6	35400	35405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019774	TAA	2	6	35496	35501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019774	ATT	2	6	35505	35510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019774	TTC	2	6	35527	35532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019774	ATT	2	6	35763	35768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019774	ATT	2	6	38699	38704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019774	AAG	2	6	48867	48872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019774	TAA	2	6	48981	48986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019774	TCT	2	6	49172	49177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019774	ACA	2	6	49201	49206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019774	CAG	2	6	50342	50347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019774	TTA	2	6	50350	50355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019774	GAT	2	6	51463	51468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019774	CAA	2	6	51558	51563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019774	TAA	2	6	51589	51594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019774	ATT	2	6	52589	52594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019774	TCA	2	6	54266	54271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019774	TGG	2	6	54302	54307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019774	TTG	2	6	56727	56732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019774	AGC	2	6	56815	56820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019774	TCA	2	6	58682	58687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019774	CAC	2	6	58704	58709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019774	GGT	2	6	58728	58733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019774	TTA	2	6	58740	58745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019774	GGA	2	6	58841	58846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019774	TGC	2	6	58869	58874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019774	GAC	2	6	58958	58963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019774	ATT	2	6	59093	59098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019774	TAG	2	6	59108	59113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019774	AGG	2	6	59136	59141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019774	TTG	2	6	62411	62416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019774	TTC	2	6	62418	62423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019774	AAT	2	6	62466	62471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019774	TAA	2	6	62614	62619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019774	AAT	2	6	62708	62713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019774	ATT	2	6	62845	62850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019774	TCT	2	6	62867	62872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019774	CAT	2	6	63410	63415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019774	GCA	2	6	63448	63453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019774	GGA	2	6	63465	63470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019774	CTT	2	6	63504	63509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019774	ATA	2	6	65444	65449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019774	CTG	2	6	65944	65949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019774	GTT	2	6	65950	65955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019774	TCC	3	9	66773	66781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.