MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019773	ATCT	2	8	2053	2060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019773	ATAA	2	8	2202	2209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019773	AAAC	2	8	2489	2496	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019773	TAAG	2	8	2837	2844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019773	CTTT	2	8	3909	3916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019773	GATA	2	8	4485	4492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019773	CCAA	2	8	5767	5774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019773	TTAT	2	8	9517	9524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019773	TAAA	2	8	10232	10239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019773	ACCA	2	8	11188	11195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019773	ATTC	2	8	18143	18150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019773	CTTT	2	8	23231	23238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019773	TTAT	2	8	23301	23308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019773	CTAA	2	8	23335	23342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019773	AAAT	2	8	23402	23409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019773	TGTT	2	8	24108	24115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019773	TAGT	2	8	25375	25382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019773	CGCC	2	8	34841	34848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_019773	TACT	2	8	43032	43039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019773	TTAA	2	8	45967	45974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019773	ATTT	2	8	46286	46293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019773	TCTT	2	8	46845	46852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019773	ATTT	2	8	46973	46980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019773	ACTG	2	8	46996	47003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019773	ATTA	2	8	47021	47028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019773	TAAG	2	8	47289	47296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019773	AATT	2	8	47736	47743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019773	TTTA	2	8	47912	47919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019773	AACG	2	8	47975	47982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019773	TCGG	2	8	48302	48309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019773	CTTT	2	8	48381	48388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019773	GGTT	2	8	48395	48402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019773	CTTT	2	8	48407	48414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019773	ATGG	2	8	48669	48676	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019773	TTCT	2	8	48827	48834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019773	TGAC	2	8	48861	48868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019773	AAGA	2	8	48935	48942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019773	ATTT	2	8	49246	49253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019773	GGCT	2	8	53274	53281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019773	TCGC	2	8	53685	53692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019773	TGTA	2	8	54839	54846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019773	TCTG	2	8	61157	61164	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019773	TAAA	2	8	61200	61207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019773	GCTG	2	8	63105	63112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019773	GTGG	2	8	63185	63192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019773	CTGG	2	8	63869	63876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019773	TGGG	3	12	63903	63914	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019773	CCGC	2	8	65264	65271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_019773	ATCG	2	8	65286	65293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019773	CCCT	2	8	66385	66392	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_019773	ACCC	2	8	67878	67885	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_019773	AACT	2	8	68984	68991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019773	GGCT	2	8	69121	69128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019773	TGGG	3	12	69162	69173	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019773	AATT	2	8	72738	72745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019773	CAAC	2	8	72768	72775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019773	TTTA	2	8	73035	73042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019773	GGTT	2	8	76315	76322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019773	AATT	2	8	76346	76353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019773	ATTT	2	8	79921	79928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019773	AAAG	2	8	80446	80453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019773	TTTG	2	8	83574	83581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019773	AACC	2	8	83607	83614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019773	CAAT	2	8	83708	83715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019773	TACA	2	8	84202	84209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019773	AAAT	2	8	85458	85465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019773	CAAA	2	8	87610	87617	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019773	TGCT	2	8	87625	87632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019773	GTTT	2	8	87777	87784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019773	GACT	2	8	93849	93856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019773	ATTA	2	8	94038	94045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019773	CTGG	2	8	94078	94085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019773	ACAG	2	8	107120	107127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019773	AACT	2	8	107195	107202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019773	TGAT	2	8	107514	107521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019773	ATTG	2	8	108010	108017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019773	TGGA	2	8	108076	108083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019773	CAGC	2	8	108145	108152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019773	AGAT	2	8	108600	108607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019773	AATT	2	8	108934	108941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019773	CAAC	2	8	108964	108971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019773	TTTA	2	8	109231	109238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019773	GGTT	2	8	112511	112518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019773	AATT	2	8	112542	112549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019773	TGAA	2	8	120715	120722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019773	CGCT	2	8	121680	121687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019773	AATA	2	8	127150	127157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.