MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019772	TCAA	2	8	19	26	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019772	AATC	2	8	894	901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019772	AAAC	2	8	1325	1332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019772	TTGA	2	8	1458	1465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019772	TTTA	2	8	6873	6880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019772	ATAC	2	8	16124	16131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019772	ATAC	2	8	16167	16174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019772	AATA	2	8	16185	16192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019772	GACC	2	8	21543	21550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019772	CAAG	2	8	24279	24286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019772	TAAA	2	8	24288	24295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019772	CAAA	2	8	25282	25289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019772	CATT	2	8	25307	25314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019772	AAAT	2	8	28744	28751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019772	AATT	2	8	28798	28805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019772	TTGT	2	8	28850	28857	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019772	GAAA	2	8	28887	28894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019772	ATTT	2	8	31852	31859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019772	TGAT	2	8	32829	32836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019772	TAAA	2	8	35137	35144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019772	TCTA	2	8	35278	35285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019772	CTGT	2	8	48940	48947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019772	ATTA	2	8	48971	48978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019772	TTTA	2	8	49008	49015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019772	ATTA	2	8	49262	49269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019772	TCAA	2	8	58746	58753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019772	CAAT	2	8	59295	59302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019772	TTTC	2	8	60235	60242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019772	AGTT	2	8	60740	60747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019772	TATC	2	8	60963	60970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019772	TCAA	2	8	61033	61040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019772	AAAT	2	8	61125	61132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019772	TTCG	2	8	61408	61415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019772	GTCT	2	8	61422	61429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019772	ATAA	2	8	67180	67187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019772	AATT	2	8	67611	67618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019772	TCAG	2	8	70729	70736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019772	AAAT	2	8	70849	70856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019772	TCCC	2	8	70886	70893	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_019772	ATTA	2	8	72083	72090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019772	CTTC	2	8	73127	73134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019772	AAGG	2	8	73162	73169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019772	ACCC	2	8	76494	76501	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_019772	TATT	2	8	79708	79715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019772	TAAA	2	8	79984	79991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019772	TAAA	2	8	80003	80010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019772	CTAT	2	8	85714	85721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019772	TACT	2	8	90813	90820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019772	CTTT	2	8	91303	91310	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019772	TCAA	2	8	91442	91449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019772	TAAC	2	8	91924	91931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019772	TTGA	2	8	92051	92058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019772	AATC	2	8	92460	92467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019772	TAAC	2	8	93755	93762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019772	ATTT	2	8	95916	95923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019772	ATAG	2	8	96052	96059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019772	TAGA	2	8	96138	96145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019772	TCCA	2	8	97994	98001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019772	TAAA	2	8	98247	98254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019772	ATTA	2	8	99183	99190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019772	ATAC	2	8	99240	99247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019772	AAAT	2	8	99464	99471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019772	TTAT	2	8	99775	99782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019772	TCAA	2	8	106065	106072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019772	ACAA	2	8	113379	113386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019772	CTTT	2	8	113422	113429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019772	ATTT	2	8	113712	113719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019772	CTTT	2	8	114525	114532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019772	GATT	2	8	114655	114662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019772	TCTT	2	8	117179	117186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019772	ACTG	2	8	118108	118115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019772	GTAG	2	8	118309	118316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019772	AAAG	2	8	118348	118355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019772	AGTA	2	8	122823	122830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019772	AATT	2	8	122840	122847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019772	GAAT	2	8	122887	122894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019772	GGGT	2	8	122939	122946	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019772	ATCT	2	8	125380	125387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019772	TTTA	2	8	125532	125539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019772	GCAA	2	8	127904	127911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019772	GGGA	2	8	130701	130708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019772	TAAA	2	8	132080	132087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019772	AATG	2	8	132088	132095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019772	CTTA	2	8	134269	134276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019772	CTAG	2	8	134342	134349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019772	AAGT	2	8	134905	134912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019772	ATGG	2	8	137492	137499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019772	AATT	2	8	141344	141351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019772	CATA	2	8	141403	141410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019772	AAAT	2	8	141422	141429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019772	TAGT	2	8	141502	141509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019772	TATT	2	8	143686	143693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019772	TTTA	2	8	144424	144431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019772	AGAA	2	8	148252	148259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019772	ATTT	2	8	148286	148293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019772	GATT	2	8	148337	148344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019772	TTGA	2	8	149436	149443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019772	TTGG	2	8	152286	152293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019772	ACAA	2	8	153608	153615	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019772	CAAC	2	8	153843	153850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019772	TTAA	2	8	155489	155496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019772	CTTT	2	8	155556	155563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019772	TCTT	2	8	156042	156049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019772	TCTT	2	8	156077	156084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019772	TTCA	2	8	157089	157096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019772	TCTT	2	8	157146	157153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019772	CTTT	2	8	157894	157901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019772	TTGA	2	8	158004	158011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019772	AGAT	2	8	167762	167769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019772	CAGC	2	8	167816	167823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019772	TTAC	2	8	169236	169243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019772	CTTC	2	8	202824	202831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019772	TTCT	2	8	206116	206123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019772	TGAT	2	8	206235	206242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019772	ATCT	2	8	206447	206454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019772	CCAA	2	8	206882	206889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019772	GAAC	2	8	207229	207236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019772	TAAG	2	8	209711	209718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019772	AAAG	2	8	209972	209979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019772	GTAG	2	8	210471	210478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019772	AGCA	2	8	212341	212348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019772	TTAA	2	8	212395	212402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019772	TTCC	2	8	212420	212427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019772	TTAA	2	8	212773	212780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019772	TTTA	2	8	212825	212832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019772	ATCT	2	8	212851	212858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019772	ACTT	2	8	214829	214836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019772	AATT	2	8	219018	219025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.