MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019771	TGTTAA	2	12	11570	11581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019771	TAACGC	2	12	46774	46785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019771	TAAATT	2	12	52906	52917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019771	TAAATT	2	12	60945	60956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019771	GGGGTT	2	12	72164	72175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019771	AATCCA	2	12	84263	84274	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019771	ATCTTT	2	12	87357	87368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019771	GATTAA	2	12	87972	87983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019771	TATAAA	2	12	88468	88479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019771	CCCAAA	2	12	93795	93806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019771	CCCCTG	2	12	103266	103277	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019771	TTTACC	2	12	104531	104542	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019771	AACCAC	2	12	115575	115586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019771	TAATAT	2	12	116035	116046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019771	GTTAAA	2	12	117817	117828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019771	ATTACA	2	12	125996	126007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019771	CAGCAT	2	12	130780	130791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019771	TCTCAC	2	12	132805	132816	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019771	TGTGAA	2	12	154356	154367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019771	CTGAGT	2	12	154841	154852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019771	TATAAA	2	12	165722	165733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019771	GTTTTA	2	12	165813	165824	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019771	TATATT	2	12	172632	172643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019771	TACCCC	2	12	256492	256503	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019771	TATTCC	2	12	300872	300883	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019771	GATTTT	2	12	318189	318200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019771	AAATTT	2	12	322899	322910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019771	TTTATG	2	12	323306	323317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019771	TTAAAT	2	12	399444	399455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019771	TTAATT	2	12	406181	406192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019771	TCAAAA	2	12	420797	420808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019771	GTACTT	2	12	425971	425982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019771	GCAGGG	2	12	430440	430451	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019771	TTTCCC	2	12	433680	433691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019771	GTACTA	2	12	453250	453261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019771	CATTGA	2	12	466397	466408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019771	TCAGTT	2	12	496353	496364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019771	GATTAA	2	12	496827	496838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019771	TCACCC	2	12	501785	501796	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019771	CACACT	2	12	508779	508790	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019771	TAAAAT	2	12	532040	532051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019771	TAATTT	2	12	547700	547711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019771	ATTTAC	2	12	554145	554156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019771	GTGGTT	2	12	556109	556120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019771	TTATAT	2	12	572389	572400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019771	TGATCC	2	12	600290	600301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019771	AAGCGC	2	12	622845	622856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019771	AGCCAA	2	12	666446	666457	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019771	GTATAA	2	12	675779	675790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019771	ATTAAA	2	12	709951	709962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019771	AAAATG	2	12	720910	720921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019771	AATTAA	2	12	736609	736620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019771	TATTTT	2	12	752105	752116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019771	TTTTTA	2	12	766218	766229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019771	AGCAGA	2	12	779355	779366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019771	AACCCC	2	12	790218	790229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019771	TAGCTA	2	12	799456	799467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019771	TTAGAT	2	12	804570	804581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019771	CTTCGG	2	12	811342	811353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019771	TCACAT	2	12	812163	812174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019771	TCCATA	2	12	824629	824640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019771	CAAAAT	2	12	835433	835444	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019771	AAATAT	2	12	850379	850390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019771	TACAAA	2	12	893254	893265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019771	TACAGG	2	12	903778	903789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019771	CTACGC	2	12	904343	904354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019771	AGAGAA	2	12	917142	917153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019771	CTGCCT	2	12	936924	936935	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019771	AATAAA	2	12	941434	941445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019771	TACAGG	2	12	961771	961782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019771	TATAGC	2	12	984640	984651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019771	GGTAAA	2	12	1005028	1005039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019771	CTCTGC	2	12	1018400	1018411	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019771	GTTTAA	2	12	1027762	1027773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019771	CCCAAA	2	12	1027869	1027880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019771	TACAAC	2	12	1067979	1067990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019771	TGTTTT	2	12	1071047	1071058	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019771	TATTTA	2	12	1071101	1071112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019771	AAAGTT	2	12	1115512	1115523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019771	TACCAA	2	12	1119563	1119574	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019771	GCGTTC	2	12	1175463	1175474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019771	ACTAGA	2	12	1205313	1205324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019771	TGAAAT	2	12	1205447	1205458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019771	ACTACC	2	12	1216340	1216351	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019771	TTATAT	2	12	1232863	1232874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019771	TTCTAT	2	12	1269260	1269271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019771	GCCAAA	2	12	1278047	1278058	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019771	TAAGTT	2	12	1287703	1287714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019771	CTGGAA	2	12	1300855	1300866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019771	AAATAG	2	12	1310724	1310735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019771	ACAGTC	2	12	1317190	1317201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019771	CGGGTA	2	12	1318790	1318801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019771	ATTTTG	2	12	1340532	1340543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019771	TTTGAC	2	12	1353685	1353696	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019771	CAGAAC	2	12	1360543	1360554	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019771	CTTGCC	2	12	1373012	1373023	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019771	CAGAAC	2	12	1399006	1399017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019771	ATCTCA	2	12	1400524	1400535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019771	CATCCC	2	12	1440930	1440941	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019771	CTGCAT	2	12	1441233	1441244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019771	CAAAAT	2	12	1447670	1447681	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019771	CTTTCT	2	12	1462583	1462594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019771	CATCAG	2	12	1463177	1463188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019771	TTGCTC	2	12	1466580	1466591	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019771	ACGTGG	2	12	1478549	1478560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019771	AATAAA	2	12	1478580	1478591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019771	CAATAA	2	12	1496201	1496212	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019771	ACTTTA	2	12	1539051	1539062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019771	TAATTC	2	12	1559418	1559429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019771	TTTTAT	2	12	1564096	1564107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019771	CAAATT	2	12	1564894	1564905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019771	ACATTT	2	12	1565386	1565397	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019771	TTATGG	2	12	1570055	1570066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019771	TATTTT	2	12	1581262	1581273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019771	CTTAAA	2	12	1592589	1592600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019771	AGAAAA	2	12	1598340	1598351	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019771	ATTATG	2	12	1618123	1618134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019771	TATTGA	2	12	1635173	1635184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019771	GCTTTA	2	12	1636858	1636869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019771	AGCATC	2	12	1671734	1671745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019771	TTGTGA	2	12	1683642	1683653	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019771	TACTCA	2	12	1740351	1740362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019771	ATTAAG	2	12	1741775	1741786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019771	ATGCAG	2	12	1759455	1759466	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019771	AATTGC	2	12	1761852	1761863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019771	TGATCA	2	12	1780892	1780903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_019771	TTAGTT	2	12	1781459	1781470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_019771	CAAATT	2	12	1816395	1816406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_019771	AAATTA	2	12	1868594	1868605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.