MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA02

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019439	TTCTC	2	10	108	117	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019439	AAATA	2	10	451	460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019439	ATCTT	2	10	16838	16847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019439	GTAAA	2	10	20131	20140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019439	TAATT	2	10	20328	20337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019439	ATCTT	2	10	21315	21324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019439	ACTTA	2	10	22455	22464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019439	ATTTA	2	10	23829	23838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019439	AAGAT	2	10	29075	29084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019439	AGGGA	2	10	33691	33700	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019439	GGGAA	2	10	44967	44976	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019439	TAGCG	2	10	55580	55589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019439	AATGA	2	10	55723	55732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019439	ATATC	2	10	61214	61223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019439	CCCAC	2	10	61731	61740	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_019439	TTTCT	2	10	67230	67239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019439	AAATT	2	10	73998	74007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019439	AATAA	2	10	74098	74107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019439	AAGGG	2	10	82055	82064	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019439	TCAAA	2	10	89141	89150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019439	ATCAA	2	10	91070	91079	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019439	GTTGA	2	10	95362	95371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019439	AAATC	2	10	96150	96159	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019439	ACAAA	2	10	101592	101601	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019439	TAATG	2	10	102874	102883	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019439	CCTAC	2	10	122372	122381	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_019439	AAAGA	2	10	127428	127437	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019439	AATTT	2	10	145072	145081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019439	GGTTG	2	10	152995	153004	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019439	TCTCA	2	10	163228	163237	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019439	ATTTG	2	10	168787	168796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019439	TAGCG	2	10	168800	168809	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019439	ATAGC	2	10	173810	173819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019439	TGGTC	2	10	177778	177787	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019439	GTTCT	2	10	182888	182897	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019439	TAATA	2	10	193715	193724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019439	AATTC	2	10	195418	195427	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019439	GGTTG	2	10	198903	198912	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019439	TTAAT	2	10	203958	203967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019439	ATAAA	2	10	204144	204153	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019439	TCTTT	2	10	211853	211862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019439	CAATC	2	10	219706	219715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019439	TACAT	2	10	224227	224236	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019439	TTTTA	2	10	230205	230214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019439	GGTAA	2	10	231044	231053	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019439	AGGTA	2	10	232332	232341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019439	CTAAT	2	10	243964	243973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019439	CTGAA	2	10	246163	246172	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019439	AATTC	2	10	251499	251508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019439	TTATG	2	10	253619	253628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019439	GTATA	2	10	258416	258425	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019439	AAGTT	2	10	262824	262833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019439	GATTG	3	15	267238	267252	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019439	TGGCT	2	10	285583	285592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019439	AATTT	2	10	288525	288534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019439	GGTTG	2	10	295866	295875	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019439	CAAGA	2	10	298482	298491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019439	ACCCC	2	10	299893	299902	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
59	NC_019439	CATGA	2	10	311354	311363	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019439	AAACT	2	10	313829	313838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019439	AAAAT	2	10	314853	314862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019439	TAAAT	2	10	320586	320595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019439	TTTAT	2	10	321822	321831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019439	AAAAT	2	10	332828	332837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019439	TTGGT	2	10	333304	333313	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019439	TTTAC	2	10	337771	337780	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019439	TAAAT	2	10	348751	348760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019439	TAGCG	2	10	354396	354405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019439	GAAGA	2	10	366718	366727	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019439	GAAAG	2	10	366729	366738	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019439	GGGGT	2	10	379115	379124	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019439	TTTAA	2	10	379985	379994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019439	TACTT	2	10	380066	380075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019439	ATCTA	2	10	380392	380401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019439	TAAAA	2	10	380466	380475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019439	GTATT	2	10	389465	389474	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019439	ACTTA	2	10	389947	389956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019439	TCCTG	2	10	390703	390712	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_019439	AAATG	2	10	391018	391027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019439	AAACA	2	10	391870	391879	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019439	TAAAT	2	10	395666	395675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019439	ATTTG	2	10	405993	406002	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019439	TAGAA	2	10	408626	408635	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019439	TGAAT	3	15	409161	409175	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019439	AAATT	2	10	411326	411335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019439	TGAAG	2	10	415814	415823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019439	TAATT	2	10	435748	435757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019439	ATGGA	2	10	447852	447861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019439	TGGAA	2	10	450955	450964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019439	AAATT	2	10	459931	459940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019439	TCTCG	2	10	464424	464433	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019439	GCTTG	2	10	465490	465499	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019439	TGGTT	2	10	466446	466455	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019439	CAACC	2	10	472711	472720	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_019439	ACGCT	2	10	479980	479989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019439	ATTTA	2	10	483169	483178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019439	AGCCA	2	10	486796	486805	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019439	CAATC	2	10	486845	486854	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019439	GACCA	2	10	489404	489413	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019439	ACTTA	2	10	496122	496131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019439	GTCAG	2	10	499520	499529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019439	GGAAG	2	10	502129	502138	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019439	CAACC	2	10	507185	507194	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_019439	ACAAG	2	10	509955	509964	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019439	AGTCA	2	10	517572	517581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019439	GTTCT	2	10	535738	535747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019439	CAAAT	2	10	554250	554259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019439	AACCA	2	10	567556	567565	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019439	GGTTG	2	10	580355	580364	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019439	ATGGG	2	10	593774	593783	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019439	GTTGT	2	10	593956	593965	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019439	AAATG	2	10	603286	603295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019439	GGTAA	2	10	607844	607853	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019439	AAATT	2	10	620327	620336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019439	AAAAT	2	10	620400	620409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019439	TTTTG	2	10	621380	621389	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019439	ACTTA	2	10	624385	624394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019439	ATTCA	2	10	624537	624546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019439	CATAT	2	10	627868	627877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019439	TTTAT	2	10	628943	628952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019439	ACCCC	2	10	632122	632131	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
122	NC_019439	ACGCT	2	10	639837	639846	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_019439	ATTTT	2	10	643238	643247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019439	AATTA	2	10	648024	648033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019439	TATCA	2	10	648977	648986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019439	CTTGC	2	10	658482	658491	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019439	AATAT	2	10	666195	666204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019439	AGAAT	2	10	667647	667656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019439	CTTTT	2	10	680247	680256	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019439	ACTTA	2	10	680368	680377	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019439	CATAA	2	10	681098	681107	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019439	GGAAA	2	10	681201	681210	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019439	ATTTA	2	10	681897	681906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019439	CACGC	2	10	689280	689289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_019439	GTTTG	2	10	694160	694169	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019439	TAAAT	2	10	700807	700816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019439	TTTAG	2	10	700859	700868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019439	TTAAA	2	10	707953	707962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019439	TTCAC	2	10	710112	710121	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_019439	CAATC	2	10	711247	711256	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_019439	ATAAC	2	10	713735	713744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019439	GTAGC	2	10	714110	714119	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019439	TATAT	2	10	720705	720714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019439	AAAAT	2	10	723594	723603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019439	CTAAA	2	10	728425	728434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019439	TATCC	2	10	729562	729571	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019439	GGTTG	2	10	739078	739087	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019439	ATCTG	2	10	739891	739900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_019439	ACTTT	2	10	757284	757293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_019439	ATTTT	2	10	757530	757539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019439	ACTTT	2	10	758943	758952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_019439	TATGC	2	10	815942	815951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.