MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA01

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019427	TCAAAT	2	12	1559	1570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019427	CTTTTT	2	12	9693	9704	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019427	TTTGAT	2	12	18614	18625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019427	GTTTTT	2	12	23161	23172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019427	TTATTT	2	12	35991	36002	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019427	ACTTCG	2	12	41447	41458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019427	TTATAT	2	12	52065	52076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019427	AATATC	2	12	67087	67098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019427	TTCTAC	2	12	103388	103399	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019427	GAGACA	2	12	123558	123569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019427	GAGACA	2	12	123716	123727	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019427	GAGACA	2	12	123875	123886	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019427	AGATTT	2	12	136840	136851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019427	GCTATC	2	12	147425	147436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019427	ATAGAG	2	12	231531	231542	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019427	TTACAT	2	12	231926	231937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019427	GATTTA	2	12	232812	232823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019427	TTAATT	2	12	236751	236762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019427	ATAGAC	2	12	245303	245314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019427	CGAAGT	2	12	263516	263527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019427	CTATTA	2	12	272431	272442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019427	TAAGAA	2	12	292604	292615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019427	TAAAAA	2	12	384201	384212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019427	TAAAAC	2	12	390173	390184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019427	AAACAA	2	12	392510	392521	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019427	ACAAAT	2	12	392559	392570	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019427	AAATCT	2	12	423541	423552	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019427	ATGAAG	2	12	432243	432254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019427	ACTTCG	2	12	444085	444096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019427	TCAAAA	2	12	446124	446135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019427	TGGTAA	2	12	452645	452656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019427	TTGTTC	2	12	461066	461077	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019427	AGATCC	2	12	465166	465177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019427	TTGACC	2	12	470855	470866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019427	TGCTCT	2	12	479495	479506	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019427	AGGGGA	2	12	494219	494230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019427	ATTTAG	2	12	505797	505808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019427	ACTTCG	2	12	508850	508861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019427	GATGAG	2	12	514043	514054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019427	ATATAA	2	12	530974	530985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019427	ACTTCG	2	12	555411	555422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019427	GAAAGA	2	12	557616	557627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019427	ATAAAT	2	12	571513	571524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019427	ATTGAA	2	12	572184	572195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019427	TGAAAA	2	12	580187	580198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019427	TAATTA	2	12	582899	582910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019427	ACTTCG	2	12	587863	587874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019427	TATTTT	2	12	601094	601105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019427	AGATTT	2	12	608350	608361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019427	AACGTA	2	12	616055	616066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019427	GTTAAT	2	12	618041	618052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019427	TTAGAA	2	12	704601	704612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019427	AAATGA	2	12	720672	720683	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019427	ATTATG	2	12	723516	723527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019427	TGCTTT	2	12	727057	727068	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019427	GATTAT	2	12	736092	736103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019427	AGTTTA	2	12	737732	737743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019427	AGTAAA	2	12	744666	744677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019427	AGCAAT	2	12	745037	745048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019427	GAACTA	2	12	780616	780627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019427	GATCAT	2	12	793837	793848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019427	GCCTCT	2	12	802216	802227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019427	AACATT	2	12	805855	805866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019427	AGCGTG	2	12	809144	809155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019427	GAGGCA	2	12	824237	824248	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019427	TTTACT	2	12	830798	830809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019427	GAATAT	2	12	834489	834500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019427	ATTAGA	2	12	853439	853450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019427	TAAGTC	2	12	921048	921059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019427	TAACAA	2	12	922185	922196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019427	TACAAA	2	12	926573	926584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019427	CTATAA	2	12	937889	937900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019427	AGAAAA	2	12	947980	947991	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019427	GGGGTA	2	12	966900	966911	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019427	CTATAA	2	12	1120219	1120230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019427	TTGTTT	2	12	1125824	1125835	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019427	CGAAGT	2	12	1163570	1163581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019427	CTTTAC	2	12	1179651	1179662	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019427	ATTTCT	2	12	1181741	1181752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019427	CAAAAA	2	12	1182074	1182085	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019427	CTTTTT	3	18	1193355	1193372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019427	AATTCT	2	12	1200205	1200216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019427	ATTTTA	2	12	1208317	1208328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019427	ATCCTT	2	12	1210703	1210714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019427	AGATAG	2	12	1227782	1227793	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019427	ATTTTG	2	12	1227854	1227865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019427	GTTTTA	2	12	1228047	1228058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019427	CGTAAG	2	12	1256898	1256909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019427	TTTAAT	2	12	1269763	1269774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019427	ATAATT	2	12	1295053	1295064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019427	ATCAAT	2	12	1310918	1310929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019427	TTTCTC	2	12	1316559	1316570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019427	TTTTGG	2	12	1321226	1321237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019427	GATTTA	2	12	1339794	1339805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019427	GTCTAT	2	12	1339966	1339977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019427	TAAAAA	2	12	1386054	1386065	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019427	AGAAAA	2	12	1413512	1413523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019427	AACGTA	2	12	1417612	1417623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019427	CGAAGT	2	12	1439528	1439539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019427	TTTTGA	2	12	1461085	1461096	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019427	ACTTCG	2	12	1465280	1465291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019427	ACTCTC	2	12	1477713	1477724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019427	ACTTCG	2	12	1478843	1478854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019427	AATGTC	2	12	1497387	1497398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019427	CTGTTG	2	12	1533725	1533736	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019427	ACCAAT	2	12	1544813	1544824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019427	TTTGAT	2	12	1561033	1561044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019427	CATAAT	2	12	1584736	1584747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019427	AGCCAT	2	12	1589786	1589797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019427	ATTAGA	2	12	1609698	1609709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019427	AATTTT	2	12	1618454	1618465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019427	AAAGTC	2	12	1648475	1648486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019427	CTAATT	2	12	1658462	1658473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019427	TTTACA	2	12	1661885	1661896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019427	GGTAAA	2	12	1669886	1669897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019427	GATGTT	2	12	1679452	1679463	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019427	TAACCT	2	12	1702109	1702120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019427	TATAAA	2	12	1732796	1732807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019427	GGCAGG	2	12	1754256	1754267	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019427	AATTCC	2	12	1756572	1756583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019427	ATATCT	2	12	1772239	1772250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019427	ATATCA	2	12	1772890	1772901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019427	CAATTA	2	12	1777672	1777683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019427	TAGAAA	2	12	1782892	1782903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019427	CATATT	2	12	1800436	1800447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019427	AGTTTT	2	12	1827937	1827948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019427	CTAAAA	2	12	1830515	1830526	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019427	TAAGAA	2	12	1838513	1838524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019427	ATCTTT	2	12	1839653	1839664	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019427	TTTAGA	2	12	1844677	1844688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019427	GTCAGA	2	12	1861753	1861764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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135	NC_019427	ATCATG	2	12	1888932	1888943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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248	NC_019427	AAGTTG	2	12	3671354	3671365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_019427	TTACAT	2	12	3680065	3680076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_019427	GATTTA	2	12	3680921	3680932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019427	TAAATC	2	12	3683675	3683686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_019427	ATGTAA	2	12	3684531	3684542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019427	AAAAAC	2	12	3697344	3697355	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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260	NC_019427	CAAAAA	2	12	3800948	3800959	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_019427	TAAATG	2	12	3859821	3859832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_019427	ATTAGC	2	12	4031846	4031857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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284	NC_019427	CACCAT	2	12	4122000	4122011	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.