MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	CAAT	2	8	4063	4070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019394	ATGA	2	8	7582	7589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019394	TAAA	2	8	8567	8574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019394	GAGT	2	8	8595	8602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019394	CTTC	2	8	8647	8654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019394	ATTC	2	8	14389	14396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019394	TTTC	2	8	17388	17395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019394	CATT	2	8	18981	18988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019394	AACT	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019394	ATCA	2	8	23549	23556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019394	ATTT	2	8	24604	24611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019394	TGAA	2	8	27042	27049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019394	GGCT	2	8	28444	28451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019394	TTTG	2	8	28955	28962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019394	TTTA	2	8	30996	31003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019394	TTGT	2	8	32139	32146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019394	AGGC	2	8	32198	32205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019394	CAAG	2	8	32778	32785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019394	CAAA	2	8	32996	33003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019394	ATTC	2	8	34168	34175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019394	ATCA	2	8	37706	37713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019394	TTGT	2	8	38085	38092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019394	CAAT	2	8	38852	38859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019394	CACT	2	8	42528	42535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019394	TAAT	2	8	56893	56900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019394	TCTT	2	8	62892	62899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019394	ATTT	2	8	95483	95490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019394	TAAA	2	8	98729	98736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019394	TAAT	2	8	99282	99289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019394	GCAA	2	8	99293	99300	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019394	TGAG	2	8	103851	103858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019394	ATTA	2	8	105649	105656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019394	TTTA	2	8	105884	105891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019394	TGGC	2	8	107865	107872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019394	AGGG	2	8	111629	111636	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019394	CGTT	2	8	114476	114483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019394	ACTC	2	8	117241	117248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019394	TACC	2	8	117419	117426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019394	GAAC	2	8	126504	126511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019394	CTAA	2	8	126622	126629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019394	TTTC	2	8	126671	126678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019394	AAGG	2	8	130542	130549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019394	GATG	2	8	133176	133183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019394	CGTT	2	8	133225	133232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019394	TTTC	2	8	133531	133538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019394	CTGT	2	8	133980	133987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019394	TTAA	2	8	134571	134578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019394	TTAT	2	8	134875	134882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019394	AAAT	2	8	135151	135158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019394	ACGA	2	8	135728	135735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019394	CTTA	2	8	135974	135981	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019394	TCGT	2	8	136137	136144	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019394	CCAA	2	8	137523	137530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019394	GAAT	2	8	139245	139252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019394	GATT	2	8	139331	139338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019394	GTGA	2	8	139347	139354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019394	GCTG	2	8	140914	140921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019394	ATTG	2	8	144938	144945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019394	CTGT	2	8	144962	144969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019394	TTAC	2	8	145188	145195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019394	ATGT	2	8	146253	146260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019394	ATTT	2	8	146686	146693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019394	AGAA	2	8	146706	146713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019394	AATC	2	8	155667	155674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019394	TAAT	2	8	158232	158239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019394	TAAA	2	8	158489	158496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019394	TCAA	2	8	159428	159435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019394	CTGT	2	8	159456	159463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019394	TCCG	2	8	159482	159489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019394	TACT	2	8	159561	159568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019394	ATCA	2	8	212467	212474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019394	GCAA	2	8	213721	213728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019394	AAAT	2	8	228211	228218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019394	AGAA	2	8	228393	228400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019394	TTTC	2	8	228419	228426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019394	TAGA	2	8	229410	229417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019394	TGCC	2	8	229421	229428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019394	ATAC	2	8	229848	229855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019394	TTTC	2	8	231693	231700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019394	GATA	2	8	231711	231718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019394	CTTG	2	8	231727	231734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019394	TAAA	2	8	232105	232112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019394	TAAT	2	8	232287	232294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019394	GTTA	2	8	236927	236934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019394	ACAA	2	8	237188	237195	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019394	TTCA	2	8	237213	237220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019394	CAGT	2	8	238232	238239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019394	ACTT	2	8	243086	243093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019394	CCCA	2	8	248616	248623	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_019394	TAAA	2	8	248630	248637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019394	ATTA	2	8	248684	248691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019394	ATCA	2	8	261917	261924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019394	ATTT	2	8	262972	262979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019394	TGAA	2	8	265410	265417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019394	GGCT	2	8	266812	266819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019394	TTTG	2	8	267323	267330	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019394	TTTA	2	8	269364	269371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019394	TTGT	2	8	270507	270514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019394	AGGC	2	8	270566	270573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019394	CAAG	2	8	271146	271153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019394	CAAA	2	8	271364	271371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019394	ATTC	2	8	272536	272543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019394	ATCA	2	8	276074	276081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019394	TTGT	2	8	276453	276460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019394	CTTT	2	8	286432	286439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019394	GCTG	2	8	291522	291529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019394	AATG	2	8	293609	293616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019394	CATA	2	8	293913	293920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019394	GTAT	2	8	294408	294415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019394	TTTA	4	16	295957	295972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.