MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019393	TGAAAT	2	12	39081	39092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019393	GTCAGA	2	12	40621	40632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019393	TTTTAG	2	12	57560	57571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019393	AATATT	2	12	125736	125747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019393	AATTTT	2	12	313522	313533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019393	ATTTAT	2	12	376620	376631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019393	AATTTT	2	12	377980	377991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019393	TGAAAT	2	12	437159	437170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019393	GCCAAG	2	12	441506	441517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019393	TTTGTT	2	12	474706	474717	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019393	TTACAT	2	12	484621	484632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019393	GTGATA	2	12	542138	542149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019393	TTTTTG	2	12	563135	563146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019393	TAAAAA	2	12	587774	587785	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019393	AGTGAA	2	12	641844	641855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019393	TTATTC	2	12	658658	658669	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019393	ATGTAG	2	12	752740	752751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019393	GGTATT	2	12	811114	811125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019393	TTTTTA	2	12	824098	824109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019393	CTAAAC	2	12	860515	860526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019393	TTCAGT	2	12	874537	874548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019393	TAAAAA	2	12	881045	881056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019393	CCAGTG	2	12	937363	937374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019393	TTTAAT	2	12	976119	976130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019393	TATCTT	2	12	996455	996466	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019393	CATATT	2	12	1050918	1050929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019393	AAAGGA	2	12	1066242	1066253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019393	TGATGG	2	12	1111167	1111178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019393	AGAGCC	2	12	1111254	1111265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019393	ACAAAA	2	12	1120204	1120215	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019393	TTAAAA	2	12	1138833	1138844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019393	ATAAAG	2	12	1204650	1204661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019393	GAGTTA	2	12	1311956	1311967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019393	CTTGAC	2	12	1324459	1324470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019393	TCAGGC	2	12	1324929	1324940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019393	GACCTT	2	12	1331773	1331784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019393	AAATCA	2	12	1364071	1364082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019393	TATTGA	2	12	1379674	1379685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019393	TGCACA	2	12	1380529	1380540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019393	CTTTGA	2	12	1393245	1393256	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019393	CGCTTT	2	12	1435120	1435131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019393	GGCTTT	2	12	1435309	1435320	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019393	GGCTTT	2	12	1435420	1435431	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019393	CGCTTT	2	12	1435657	1435668	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019393	GATGTT	2	12	1437037	1437048	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019393	CTCCCC	2	12	1438899	1438910	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_019393	CTCCCC	2	12	1439003	1439014	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
48	NC_019393	GAAAAA	2	12	1459599	1459610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019393	GAAGAG	2	12	1500801	1500812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019393	TCACTT	2	12	1570385	1570396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019393	TGCTTA	2	12	1667684	1667695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019393	TAAATA	2	12	1671586	1671597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019393	CTTTTG	2	12	1691719	1691730	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019393	GTTAAT	2	12	1744411	1744422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019393	TGCGCT	2	12	1767593	1767604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019393	TGCATT	2	12	1810594	1810605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019393	TTAAGT	2	12	1838733	1838744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019393	TATTTG	2	12	1859472	1859483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019393	ACGTTA	2	12	1909698	1909709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019393	ACTTTC	2	12	1926960	1926971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019393	TGTGTT	2	12	1995547	1995558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019393	GCTTTT	2	12	1996062	1996073	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019393	GTTGGT	2	12	2003809	2003820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019393	CGTATT	2	12	2015409	2015420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019393	CTATCT	2	12	2040896	2040907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019393	TAGAAA	2	12	2089208	2089219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019393	CGTTAA	2	12	2098569	2098580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019393	AAAATA	2	12	2122825	2122836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019393	AAATTA	2	12	2133068	2133079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019393	AACGCG	2	12	2142727	2142738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019393	AAAAGC	2	12	2157677	2157688	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019393	TTTTAA	2	12	2201630	2201641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019393	GCAAAC	2	12	2231738	2231749	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019393	TTTTTA	2	12	2262874	2262885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019393	TTTTTA	2	12	2318114	2318125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019393	TTTACG	2	12	2333099	2333110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019393	ATATTA	2	12	2387194	2387205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019393	CTTTTT	2	12	2427394	2427405	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019393	AAAACG	2	12	2428507	2428518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019393	TACTCC	2	12	2446065	2446076	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019393	TTACCG	2	12	2465358	2465369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019393	AAAAGA	2	12	2472196	2472207	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019393	AAACAC	2	12	2482475	2482486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019393	TCTAGC	2	12	2484477	2484488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019393	GTGTGC	2	12	2489620	2489631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019393	GTTGTC	2	12	2492905	2492916	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019393	TCTCAG	2	12	2509137	2509148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019393	ATATGT	2	12	2517719	2517730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019393	TTGTTT	2	12	2542159	2542170	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019393	GCCGAC	2	12	2574797	2574808	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019393	ATTTTT	2	12	2685525	2685536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019393	TCGCTT	2	12	2706101	2706112	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019393	CCTTCC	2	12	2760762	2760773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019393	CAGAAG	2	12	2761100	2761111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019393	AAAATA	2	12	2761337	2761348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019393	GTATAG	2	12	2761620	2761631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019393	TTTTAT	2	12	2846212	2846223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019393	AAACAC	2	12	2853559	2853570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019393	AGAAAA	2	12	2878055	2878066	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019393	GTTATT	2	12	2904983	2904994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019393	AGGAAC	2	12	2905384	2905395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019393	AGCGTT	2	12	2920382	2920393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019393	GTTATA	2	12	2948036	2948047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019393	GCTTTT	2	12	2948952	2948963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019393	CGTTAC	2	12	2951251	2951262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019393	GGGTTA	2	12	2955454	2955465	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019393	CAAAGC	2	12	2956986	2956997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019393	ATTTCA	2	12	2967324	2967335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019393	TCACTT	2	12	2967869	2967880	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019393	CCCGGC	2	12	3115240	3115251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019393	TACTGA	2	12	3125668	3125679	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019393	AGCAAT	2	12	3218984	3218995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019393	TTAAAA	2	12	3263029	3263040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019393	GTTTTA	2	12	3317619	3317630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019393	TTAAAA	2	12	3388275	3388286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019393	CAATAT	2	12	3419578	3419589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019393	ACGTAA	2	12	3421802	3421813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019393	GGAGAA	2	12	3556331	3556342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019393	TGATGT	2	12	3570007	3570018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019393	ATCTGA	2	12	3636019	3636030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019393	AATGAT	2	12	3668406	3668417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019393	GGAATA	2	12	3679223	3679234	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019393	AATAAA	2	12	3708041	3708052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019393	AAATTA	2	12	3709448	3709459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019393	TATTGC	2	12	3721836	3721847	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019393	ATCTAA	2	12	3754757	3754768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_019393	AAAATT	2	12	3754950	3754961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019393	AATATT	2	12	3755960	3755971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019393	AATATT	2	12	3783237	3783248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019393	AATTTT	2	12	3784247	3784258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019393	TTAGAT	2	12	3784440	3784451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019393	ATTTCA	2	12	3819693	3819704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019393	TTTAAT	2	12	3826296	3826307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019393	AGGCAG	2	12	3918491	3918502	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019393	TAAGTT	2	12	3918721	3918732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019393	ATATTT	2	12	3920061	3920072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019393	AAAGTG	2	12	3949293	3949304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019393	AAAACC	2	12	3950295	3950306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019393	ATTTCA	2	12	3974514	3974525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_019393	TTTTTC	2	12	3980078	3980089	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_019393	TTAATG	2	12	3985628	3985639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019393	AGAATC	2	12	4023700	4023711	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_019393	ATAAAG	2	12	4024139	4024150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019393	GAATAG	2	12	4103666	4103677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019393	TGCATT	2	12	4138300	4138311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_019393	CTATAA	2	12	4146053	4146064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_019393	ACCTTA	2	12	4165565	4165576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019393	CCGTTT	2	12	4210486	4210497	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019393	AGACTA	2	12	4228302	4228313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_019393	GTGTTT	2	12	4242171	4242182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019393	TTACAT	2	12	4304395	4304406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_019393	ATGCAT	2	12	4370863	4370874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_019393	AAGAAC	2	12	4381266	4381277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_019393	TCTCGC	2	12	4397525	4397536	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_019393	ACACGC	2	12	4417620	4417631	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
156	NC_019393	TGGCTT	2	12	4446912	4446923	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_019393	GCGGCT	2	12	4464032	4464043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019393	TTGAAA	2	12	4466321	4466332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019393	TCATTT	2	12	4481053	4481064	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_019393	TTTTTG	2	12	4518770	4518781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019393	CCTAAA	2	12	4620784	4620795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.