MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 chromosome

Total Repeats: 526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019393	AATTA	2	10	15554	15563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019393	TTCAA	2	10	30628	30637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019393	AGACA	2	10	35052	35061	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019393	GGTAA	2	10	35363	35372	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019393	TCGTG	2	10	36179	36188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019393	ACTTG	2	10	36944	36953	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019393	AGTCG	2	10	38172	38181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019393	CAGGG	2	10	38392	38401	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019393	ACGAG	2	10	38592	38601	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019393	ATTGA	2	10	62038	62047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019393	CGCAC	2	10	72818	72827	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019393	CGACA	2	10	77150	77159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019393	AATTA	2	10	81905	81914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019393	CAAGC	2	10	82500	82509	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019393	TAAAC	2	10	113110	113119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019393	TTAAG	2	10	114341	114350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019393	CAAAC	2	10	144575	144584	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019393	GTTTT	2	10	159344	159353	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019393	CTCAC	2	10	181657	181666	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_019393	GCTTT	2	10	181683	181692	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019393	TTAAT	2	10	191360	191369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019393	TATTT	2	10	191456	191465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019393	TACAT	2	10	203180	203189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019393	CGCAG	2	10	214824	214833	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019393	ATGCT	2	10	228889	228898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019393	TTTTG	2	10	253392	253401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019393	CTTTT	2	10	253576	253585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019393	TAACC	2	10	268215	268224	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019393	GAAAG	2	10	311122	311131	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019393	GTGTT	2	10	314534	314543	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019393	GCTGC	2	10	314650	314659	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019393	ATTAG	2	10	318165	318174	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019393	TAAAA	2	10	327355	327364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019393	ACTCA	2	10	329876	329885	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019393	TGATT	2	10	332351	332360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019393	TGAAA	2	10	332423	332432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019393	TTACG	2	10	355100	355109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019393	AGCAT	2	10	359431	359440	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019393	AAAAT	2	10	367048	367057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019393	TTTGC	2	10	367317	367326	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019393	GTGTT	2	10	381416	381425	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019393	TTCCT	2	10	387714	387723	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019393	ACAAA	2	10	389230	389239	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019393	TTTCA	2	10	392268	392277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019393	AGTAA	2	10	404971	404980	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019393	ACACA	2	10	430337	430346	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019393	AGACA	2	10	432835	432844	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019393	GGTAA	2	10	433146	433155	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019393	TCGTG	2	10	433962	433971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019393	GCCCT	2	10	434652	434661	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_019393	ACTTG	2	10	435033	435042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019393	AGTCG	2	10	436261	436270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019393	CAGGG	2	10	436481	436490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019393	ATTCC	2	10	438385	438394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019393	TCTTT	2	10	447764	447773	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019393	AACAA	2	10	496297	496306	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019393	ATTAA	2	10	510971	510980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019393	AAAAT	2	10	534428	534437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019393	GAGGC	2	10	543761	543770	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019393	AGGGT	2	10	547008	547017	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019393	TTTAA	2	10	549738	549747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019393	TATAA	2	10	553100	553109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019393	TCAAT	2	10	564491	564500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019393	GGTAA	2	10	566996	567005	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019393	TAGGT	2	10	591187	591196	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019393	AAAAT	2	10	595095	595104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019393	GTTGC	2	10	596699	596708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019393	TAAAT	2	10	611887	611896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019393	AGCGA	2	10	619037	619046	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019393	CTGAG	2	10	624512	624521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019393	CGGTT	2	10	634763	634772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019393	CTGAG	2	10	639588	639597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019393	AGCGA	2	10	640317	640326	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019393	AGCGA	2	10	640693	640702	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019393	TTTGG	2	10	641767	641776	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019393	TGCTT	2	10	673483	673492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019393	CAGGG	2	10	683695	683704	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019393	GCGCT	2	10	701684	701693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_019393	TTTTA	2	10	713583	713592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019393	AAAGG	2	10	724533	724542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019393	GCTTG	2	10	747841	747850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019393	CTAGC	2	10	747869	747878	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_019393	GAAAA	2	10	750081	750090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019393	AGGTA	2	10	757148	757157	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019393	TAAAA	2	10	760781	760790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019393	GGTTC	2	10	771218	771227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019393	GCGTT	2	10	788701	788710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019393	TCACA	2	10	792210	792219	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019393	TCCTA	2	10	798093	798102	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019393	TAAGG	2	10	800834	800843	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019393	AAGTT	2	10	807382	807391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019393	AACTT	2	10	809139	809148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019393	AAACA	2	10	814225	814234	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019393	ATTTA	2	10	815303	815312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019393	GATAT	2	10	822012	822021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019393	TTTAT	2	10	824243	824252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019393	TAAAA	2	10	833400	833409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019393	TGCTT	2	10	836691	836700	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019393	TTCAT	2	10	860433	860442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019393	AATTA	2	10	860537	860546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019393	CTTTT	2	10	860584	860593	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019393	ATAGG	2	10	874563	874572	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019393	AAAGC	2	10	887672	887681	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019393	GGTAA	2	10	890379	890388	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019393	GCACC	2	10	892144	892153	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_019393	ATTCA	2	10	909179	909188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019393	AGAGC	2	10	927071	927080	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019393	ATTGA	2	10	933863	933872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019393	CGCCA	2	10	934405	934414	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_019393	TTTTA	2	10	938198	938207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019393	AAACG	2	10	947466	947475	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019393	CTAGT	2	10	956595	956604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019393	ATACA	2	10	958868	958877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019393	AAAAT	2	10	964421	964430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019393	AATTA	2	10	972881	972890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019393	GGATG	2	10	996057	996066	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019393	TTGTT	2	10	997554	997563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019393	TTGAG	2	10	1005331	1005340	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019393	ACAAA	2	10	1011107	1011116	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019393	AACGT	2	10	1043960	1043969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019393	TATAT	2	10	1050892	1050901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019393	GGGTG	2	10	1057182	1057191	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019393	TAAAA	2	10	1064603	1064612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019393	AGGGA	2	10	1066515	1066524	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019393	AAAGG	2	10	1066599	1066608	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019393	GAAAA	2	10	1082863	1082872	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019393	TCTCT	2	10	1099772	1099781	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_019393	TGTTT	2	10	1106610	1106619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019393	GAGTC	2	10	1110943	1110952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019393	GTCAT	2	10	1134297	1134306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019393	AGAAT	2	10	1186432	1186441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019393	AAGAT	2	10	1209050	1209059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019393	AAATG	2	10	1220029	1220038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019393	GAAAT	2	10	1220512	1220521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019393	AAATA	2	10	1235354	1235363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019393	CTTTG	2	10	1239435	1239444	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019393	CTTTG	2	10	1241462	1241471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019393	ATCAA	2	10	1241598	1241607	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019393	CTTTT	2	10	1263179	1263188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019393	TATTT	2	10	1274162	1274171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019393	TTGAA	2	10	1274247	1274256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019393	TTGGT	2	10	1280298	1280307	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019393	ATGCT	2	10	1284751	1284760	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019393	ATGCC	2	10	1286985	1286994	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_019393	TTAAG	2	10	1297729	1297738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019393	GAAAA	2	10	1317315	1317324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019393	GGACG	2	10	1317403	1317412	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_019393	AGTCC	2	10	1324422	1324431	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_019393	TGCTG	2	10	1331309	1331318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_019393	CAAAC	2	10	1331818	1331827	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_019393	TTAGA	2	10	1365356	1365365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019393	AATCA	2	10	1372069	1372078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_019393	TAAGA	2	10	1519062	1519071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019393	CATTA	2	10	1529967	1529976	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_019393	TTTCT	2	10	1542989	1542998	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_019393	TACGT	2	10	1551071	1551080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_019393	TGAAT	2	10	1753931	1753940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_019393	TAAAA	2	10	1772863	1772872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_019393	TAAGC	3	15	1773624	1773638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_019393	GCTAG	2	10	1773642	1773651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_019393	CATAG	2	10	1781049	1781058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_019393	ATGAC	2	10	1789865	1789874	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_019393	TAGTT	2	10	1796339	1796348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_019393	CGCTT	2	10	2318998	2319007	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_019393	TTAAA	2	10	2427657	2427666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019393	TAAAA	2	10	2428125	2428134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_019393	GTGAA	2	10	2459080	2459089	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_019393	TGAAG	2	10	2511315	2511324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_019393	TTCAA	2	10	2568760	2568769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_019393	TTGTA	2	10	2957260	2957269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_019393	AAGCG	2	10	3521837	3521846	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_019393	CGCGG	2	10	3521850	3521859	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
404	NC_019393	GCTCG	2	10	3524127	3524136	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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409	NC_019393	AATTT	2	10	3552507	3552516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_019393	AATAA	2	10	3554274	3554283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_019393	TATTT	2	10	3556231	3556240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_019393	ATTTG	2	10	3566322	3566331	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
413	NC_019393	GCTAA	2	10	3566930	3566939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
414	NC_019393	TAAAG	2	10	3571117	3571126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_019393	AGAAA	2	10	3687963	3687972	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
422	NC_019393	TGAGA	2	10	3688152	3688161	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_019393	ATGCG	2	10	3717118	3717127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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443	NC_019393	TCAAG	2	10	3821820	3821829	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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452	NC_019393	TCCAG	2	10	3905642	3905651	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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461	NC_019393	CGACT	2	10	3975414	3975423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
462	NC_019393	ACTTG	2	10	3976625	3976634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_019393	TTGTC	2	10	3978541	3978550	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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476	NC_019393	TCGCG	2	10	4077731	4077740	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
477	NC_019393	TTCAG	2	10	4082110	4082119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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480	NC_019393	ATTTA	2	10	4147983	4147992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_019393	AGCGA	2	10	4177609	4177618	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
485	NC_019393	CTAGC	2	10	4177893	4177902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
486	NC_019393	TGCTA	2	10	4193193	4193202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
487	NC_019393	TTCCC	2	10	4194361	4194370	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
488	NC_019393	GACCG	2	10	4196039	4196048	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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497	NC_019393	CTTTG	2	10	4327946	4327955	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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