MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Amphibacillus xylanus NBRC 15112

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018704	AATAGA	2	12	10894	10905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018704	AAAGCG	2	12	98629	98640	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018704	AAAGCG	2	12	104851	104862	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018704	AGTCAA	2	12	107038	107049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018704	AATGGA	2	12	159521	159532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018704	AAGGAG	2	12	167896	167907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018704	TAATAT	2	12	182323	182334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018704	TAATTA	2	12	183267	183278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018704	TGAGTG	2	12	191836	191847	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018704	TAAATT	2	12	225373	225384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018704	ATTTTA	2	12	233221	233232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018704	AATTTA	2	12	245429	245440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018704	GATATT	2	12	246297	246308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018704	CAAGCT	2	12	265981	265992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018704	AGATAG	2	12	266149	266160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018704	ACTAGA	2	12	280373	280384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018704	TAATCT	2	12	293435	293446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018704	ATTAAT	2	12	296636	296647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018704	ATTTAT	2	12	309069	309080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018704	AGGTTA	2	12	338641	338652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018704	AAAAAT	2	12	342588	342599	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018704	TCTATT	2	12	398235	398246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018704	ATCAAT	2	12	402622	402633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018704	TCTATT	2	12	427879	427890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018704	ATAAAG	2	12	428881	428892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018704	TTATAT	2	12	453283	453294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018704	TTATAT	2	12	474930	474941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018704	GTATTT	2	12	505269	505280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018704	TTAATT	2	12	545736	545747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018704	TTGTAC	2	12	576075	576086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018704	TCACTT	2	12	611910	611921	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018704	AAAATT	2	12	627256	627267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018704	CTTTTA	2	12	643229	643240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018704	AAAAAT	2	12	647506	647517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018704	AAAGCG	2	12	661219	661230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018704	ATTTTT	2	12	662615	662626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018704	TATTAA	2	12	690674	690685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018704	TCAACT	2	12	701576	701587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018704	GTATTT	2	12	727382	727393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018704	AAAATA	2	12	728335	728346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018704	CTTTTT	2	12	747802	747813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018704	ATTAAA	2	12	765333	765344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018704	ACTAAT	2	12	770918	770929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018704	TGATTT	2	12	819093	819104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018704	ATTCAT	2	12	866700	866711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018704	AGTTAT	2	12	866885	866896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018704	TTATTT	2	12	867016	867027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018704	ATTCAT	2	12	877387	877398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018704	AGTTAT	2	12	877572	877583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018704	ATTTTT	2	12	893223	893234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018704	TGATAG	2	12	894730	894741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018704	TGAATA	2	12	926878	926889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018704	CTGTAA	2	12	952280	952291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018704	CACCAA	2	12	952459	952470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018704	TATTTT	2	12	960679	960690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018704	TTTTAT	2	12	1004510	1004521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018704	TTATTT	2	12	1018199	1018210	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018704	GAAGAG	2	12	1047687	1047698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018704	TCCATC	2	12	1067306	1067317	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018704	TATAAA	2	12	1083363	1083374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018704	ATGAAA	3	18	1131065	1131082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018704	TAAATA	2	12	1131608	1131619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018704	AAAGTC	2	12	1151691	1151702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018704	TTAAAG	2	12	1154784	1154795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018704	TTGATT	2	12	1176307	1176318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018704	TTATAT	2	12	1190647	1190658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018704	AATATT	2	12	1279425	1279436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018704	GTTTTA	2	12	1283072	1283083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018704	TCATGA	2	12	1321607	1321618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018704	TACAAT	2	12	1336038	1336049	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018704	TTAATT	2	12	1346067	1346078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018704	CACCAA	2	12	1346189	1346200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018704	TTTCTA	2	12	1347242	1347253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018704	AAATAG	2	12	1390366	1390377	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018704	TTAATT	2	12	1403592	1403603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018704	CACCAA	2	12	1403795	1403806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018704	AGCTTG	2	12	1419416	1419427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018704	TATTTT	2	12	1442734	1442745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018704	CAATAT	2	12	1487866	1487877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018704	AAAAAG	2	12	1514395	1514406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018704	ATTTTT	2	12	1616712	1616723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018704	ATTTTG	2	12	1724226	1724237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018704	AATTCT	2	12	1786923	1786934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018704	CACCAA	2	12	1803347	1803358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018704	AAAAAC	2	12	1803374	1803385	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018704	ACTGAA	2	12	1827846	1827857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018704	TATTTT	2	12	1867040	1867051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018704	GTTCCT	2	12	1881729	1881740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018704	CTTAAT	2	12	1901089	1901100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018704	ATAAAT	2	12	1903824	1903835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018704	TAAAAA	2	12	1914411	1914422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018704	CCTCAT	2	12	1923752	1923763	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018704	ATTACA	2	12	1941078	1941089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018704	AATAGC	2	12	1959132	1959143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018704	ATATAA	2	12	1994060	1994071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018704	TCTATT	2	12	2003092	2003103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018704	GCTACC	2	12	2008337	2008348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018704	ATTAAT	2	12	2060806	2060817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018704	ATTTGT	2	12	2083140	2083151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018704	AAACTA	2	12	2083206	2083217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018704	AAGTAA	2	12	2088819	2088830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018704	TGGGAG	2	12	2110598	2110609	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018704	AATATT	2	12	2129120	2129131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018704	TTTAAC	2	12	2129897	2129908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018704	AAAAAC	2	12	2169470	2169481	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018704	TATTTT	2	12	2179683	2179694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018704	ATTTTT	2	12	2183738	2183749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018704	TTTTAT	2	12	2188691	2188702	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018704	TTAATT	2	12	2210850	2210861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018704	CACCAA	2	12	2212867	2212878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018704	AATAAA	2	12	2229209	2229220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018704	AATAAA	2	12	2234028	2234039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018704	AAAAAT	2	12	2259223	2259234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018704	CTGTTC	2	12	2271545	2271556	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018704	GTGTTT	2	12	2292628	2292639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018704	ATAAAA	2	12	2310626	2310637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018704	TAAATA	2	12	2321730	2321741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018704	TACTAT	2	12	2326248	2326259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018704	TTATTT	2	12	2331166	2331177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018704	CACCAA	2	12	2341250	2341261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018704	ATTTTT	2	12	2343947	2343958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018704	TGATTT	2	12	2354233	2354244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018704	TGCTAC	2	12	2389310	2389321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018704	TTTTCA	2	12	2392370	2392381	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018704	AATATC	2	12	2399029	2399040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018704	TAAGTG	2	12	2413730	2413741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018704	CAAAAA	2	12	2437927	2437938	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018704	AAAACA	2	12	2455065	2455076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018704	AACCAG	2	12	2482701	2482712	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018704	ATCAAG	2	12	2482858	2482869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018704	AGAAAA	2	12	2502265	2502276	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018704	AACTGC	2	12	2507743	2507754	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018704	ACCAAA	2	12	2513156	2513167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018704	TTAATT	2	12	2522291	2522302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018704	TAACAC	2	12	2527481	2527492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018704	CACCAA	2	12	2536669	2536680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.