MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018644	CCTCT	2	10	13174	13183	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_018644	CTCTT	2	10	68052	68061	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018644	TTATA	2	10	143509	143518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018644	TTAAA	2	10	159622	159631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018644	ATTTC	2	10	191675	191684	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018644	TATTT	2	10	192774	192783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018644	CTTAT	2	10	225939	225948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018644	ATATT	2	10	231512	231521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018644	TAAAA	2	10	231573	231582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018644	AAGTA	2	10	255074	255083	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018644	TCATA	2	10	257124	257133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018644	TTAAT	2	10	260167	260176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018644	TTAAT	2	10	284703	284712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018644	AAAGA	2	10	293308	293317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018644	TAAAA	2	10	321148	321157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018644	TAAAA	2	10	344280	344289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018644	AGTTT	2	10	405579	405588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018644	ATTTT	2	10	420226	420235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018644	ACAGC	2	10	435750	435759	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018644	TTATA	2	10	441272	441281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018644	AGAGG	2	10	442537	442546	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018644	TATCT	2	10	450388	450397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018644	ATTCA	2	10	457802	457811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018644	AATTT	2	10	484171	484180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018644	GAATT	2	10	490291	490300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018644	TAGAT	2	10	527256	527265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018644	AAATT	2	10	528729	528738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018644	TAATT	2	10	565895	565904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018644	TTAAC	2	10	579907	579916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018644	TTATT	2	10	645970	645979	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018644	GATGC	2	10	653598	653607	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018644	TTTTA	2	10	698433	698442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018644	TATCT	2	10	712377	712386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018644	TTGAT	2	10	790745	790754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018644	ATTAA	2	10	863881	863890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018644	TTAAC	2	10	978746	978755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018644	ATTAT	2	10	991918	991927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018644	CTTAA	2	10	1009404	1009413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018644	ATTAT	2	10	1021105	1021114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018644	AATTT	2	10	1061258	1061267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018644	TTTAA	2	10	1061363	1061372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018644	TTATC	2	10	1068059	1068068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018644	TAAAA	2	10	1077589	1077598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018644	TCAAC	2	10	1085164	1085173	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_018644	AAAAT	2	10	1089247	1089256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018644	TAAAA	2	10	1096783	1096792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018644	TATAG	2	10	1179487	1179496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018644	TTCTT	2	10	1184582	1184591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018644	AATTA	2	10	1193787	1193796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018644	ATTTT	2	10	1203068	1203077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018644	TAAAT	2	10	1223436	1223445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018644	AATAA	2	10	1240533	1240542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018644	TTAAT	2	10	1280980	1280989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018644	TATTT	2	10	1343664	1343673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018644	CACGA	2	10	1385374	1385383	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018644	TTACC	2	10	1386163	1386172	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018644	TTCAT	2	10	1386527	1386536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018644	TAAAA	2	10	1394045	1394054	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.