MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018644	ATAA	2	8	12092	12099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018644	TTTA	2	8	15064	15071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018644	TATT	2	8	18569	18576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018644	TTAC	2	8	35588	35595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018644	AAGA	2	8	40580	40587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018644	ATTA	2	8	44816	44823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018644	GATT	2	8	56433	56440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018644	AGTT	2	8	59716	59723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018644	TAAT	2	8	67509	67516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018644	AAAG	2	8	73675	73682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018644	ATTA	2	8	85397	85404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018644	TTAA	2	8	87184	87191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018644	TATT	2	8	93581	93588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018644	AACA	2	8	94330	94337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018644	ATAA	2	8	106138	106145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018644	TCTT	2	8	106146	106153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018644	CTTA	2	8	106987	106994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018644	TTAT	2	8	112754	112761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018644	TAAT	2	8	113964	113971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018644	TATT	2	8	114457	114464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018644	TTCC	2	8	136585	136592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018644	TAAA	2	8	140320	140327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018644	TATC	2	8	147113	147120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018644	TACT	2	8	164248	164255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018644	ACTT	2	8	165987	165994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018644	ACAA	2	8	167084	167091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018644	ATAA	2	8	169162	169169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018644	CTTA	2	8	183237	183244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018644	TAAA	2	8	185008	185015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018644	TAAA	2	8	185035	185042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018644	TAAA	2	8	190574	190581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018644	TCTT	2	8	207479	207486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018644	GTTT	2	8	220347	220354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018644	TTAT	2	8	224677	224684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018644	AACA	2	8	245849	245856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018644	AAAC	2	8	245917	245924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018644	ATTT	2	8	264062	264069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018644	TTAA	2	8	264073	264080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018644	TCCA	2	8	269655	269662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018644	AGTA	2	8	284772	284779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018644	AAAT	2	8	294142	294149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018644	CCCT	2	8	295206	295213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_018644	TATT	3	12	295284	295295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018644	ATTA	2	8	296310	296317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018644	GATT	2	8	298436	298443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018644	AAAT	2	8	308320	308327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018644	AAAG	2	8	308451	308458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018644	TTGA	2	8	314829	314836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018644	TTCT	2	8	321218	321225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018644	GGGT	2	8	321328	321335	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018644	CTAA	2	8	321392	321399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018644	TTAT	2	8	328947	328954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018644	ACTA	2	8	331665	331672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018644	TAAT	2	8	341121	341128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018644	GATA	2	8	344420	344427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018644	AATT	3	12	356723	356734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018644	GGCA	2	8	358456	358463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018644	TTTA	2	8	365431	365438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018644	TAAT	2	8	368936	368943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018644	ATTA	2	8	369867	369874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018644	CCAT	2	8	376854	376861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018644	CGTA	2	8	387015	387022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018644	TAGT	2	8	387045	387052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018644	ATTT	2	8	399741	399748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018644	TAAA	2	8	399804	399811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018644	ATTC	2	8	405473	405480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018644	CTTT	2	8	405563	405570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018644	TTTA	2	8	405653	405660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018644	TTCT	2	8	410901	410908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018644	TATT	2	8	412140	412147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018644	AATA	2	8	413337	413344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018644	AAAT	2	8	419332	419339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018644	TACA	2	8	419354	419361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018644	AATT	2	8	441290	441297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018644	TAAA	2	8	453081	453088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018644	TGAT	2	8	454904	454911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018644	CTAC	2	8	457656	457663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018644	ATTT	2	8	457749	457756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018644	ATTT	2	8	484093	484100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018644	TGAT	2	8	484143	484150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018644	CATT	2	8	484220	484227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018644	GGGA	2	8	489211	489218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018644	GTTT	2	8	490280	490287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018644	GGGA	2	8	490327	490334	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018644	TTAA	2	8	491923	491930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018644	TTCA	2	8	499956	499963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018644	AAAT	2	8	501881	501888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018644	ATAA	2	8	501904	501911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018644	TGAT	2	8	503749	503756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018644	TTTA	2	8	514694	514701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018644	TAAA	2	8	519972	519979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018644	CTGA	2	8	525840	525847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018644	AAAG	2	8	529114	529121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018644	TTAT	2	8	530525	530532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018644	CTGT	2	8	530538	530545	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018644	ATTT	2	8	531003	531010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018644	ACAA	2	8	531035	531042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018644	GCTC	2	8	535933	535940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018644	TTAG	2	8	552943	552950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018644	AGAT	2	8	557472	557479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018644	AAAT	2	8	559179	559186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018644	AATA	2	8	565825	565832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018644	CTTA	2	8	568647	568654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018644	ATTT	3	12	581373	581384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018644	TAAA	2	8	598414	598421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018644	TCAA	2	8	598432	598439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018644	ATCT	2	8	599492	599499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018644	CTTT	2	8	602146	602153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018644	AATT	2	8	616450	616457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018644	ATCT	2	8	625851	625858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018644	TTTA	2	8	653261	653268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018644	ATAA	2	8	654015	654022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018644	AATT	2	8	655685	655692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018644	TCAA	2	8	659141	659148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018644	TATT	2	8	663647	663654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018644	CAAT	2	8	676512	676519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018644	TTAA	2	8	682837	682844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018644	TTTA	3	12	682946	682957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018644	ATTA	2	8	705964	705971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018644	CTGA	2	8	712450	712457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018644	ACAG	2	8	727641	727648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018644	TTAA	2	8	729272	729279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018644	TCAA	2	8	729284	729291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018644	AGTA	2	8	731934	731941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018644	AAAT	2	8	736399	736406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018644	CTTA	2	8	740369	740376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018644	TTTA	2	8	755186	755193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018644	AAAG	2	8	765966	765973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018644	TAAT	2	8	768843	768850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018644	ATTC	2	8	777838	777845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018644	AGTT	2	8	781238	781245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018644	ATTA	2	8	790540	790547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018644	ATTT	2	8	818895	818902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018644	ATTT	2	8	818932	818939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018644	ATTT	2	8	833931	833938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018644	AAAT	2	8	833973	833980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018644	TCAA	2	8	834004	834011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018644	TAAA	2	8	834201	834208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018644	AAAT	2	8	834213	834220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018644	ATAA	2	8	853249	853256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018644	ATTT	2	8	857350	857357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018644	AATA	2	8	866999	867006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018644	ATCA	2	8	877375	877382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018644	AAAT	2	8	886446	886453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018644	CTCC	2	8	916095	916102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_018644	TGCC	2	8	917618	917625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018644	ATTA	2	8	920394	920401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018644	ATTA	2	8	946014	946021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018644	TAAT	2	8	959431	959438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_018644	ATTT	2	8	961858	961865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.