MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	ATT	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018643	TAA	2	6	13970	13975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018643	GAA	2	6	15500	15505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018643	TAT	2	6	24165	24170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018643	TTA	2	6	24780	24785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018643	TTG	2	6	37470	37475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018643	AGA	2	6	40739	40744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018643	ATT	2	6	40747	40752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018643	CTT	2	6	47956	47961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018643	TGT	2	6	50599	50604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018643	TAA	2	6	54651	54656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018643	TAA	2	6	54673	54678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018643	AAT	2	6	54730	54735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018643	TAA	2	6	55912	55917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018643	AAT	2	6	55957	55962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018643	ATT	2	6	55985	55990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018643	TGT	2	6	58768	58773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018643	TTG	2	6	61066	61071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018643	ATT	2	6	61072	61077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018643	TTG	2	6	61085	61090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018643	ATT	2	6	65171	65176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018643	TCC	2	6	73267	73272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018643	ATT	2	6	74187	74192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018643	TCC	2	6	76084	76089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018643	TTA	2	6	76114	76119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018643	TCC	2	6	76992	76997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018643	TTA	2	6	77000	77005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018643	ATA	2	6	84653	84658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018643	TTA	2	6	84662	84667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018643	ATT	2	6	84700	84705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018643	TAA	2	6	89127	89132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018643	CAT	2	6	91854	91859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018643	ATG	2	6	91862	91867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018643	ATT	3	9	104706	104714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018643	AAT	2	6	110642	110647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018643	ATT	2	6	110716	110721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018643	TCC	2	6	127852	127857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018643	ACA	2	6	135824	135829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018643	TTC	2	6	136972	136977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018643	TCA	2	6	137090	137095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018643	AAT	2	6	142884	142889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018643	ATT	2	6	147107	147112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018643	CTT	2	6	147853	147858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018643	TAA	2	6	147859	147864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018643	GTA	2	6	160780	160785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018643	AAT	2	6	168988	168993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018643	ATT	2	6	168997	169002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018643	TAT	2	6	169018	169023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018643	AAT	2	6	171401	171406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018643	TAG	2	6	173244	173249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018643	ATT	2	6	174214	174219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018643	ATA	2	6	176226	176231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018643	TCA	2	6	177317	177322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018643	CTT	2	6	177413	177418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018643	TAA	2	6	177430	177435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018643	TTG	2	6	185395	185400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018643	CAT	2	6	185464	185469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018643	AAG	2	6	185519	185524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018643	GAT	2	6	185544	185549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018643	ATA	2	6	185565	185570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018643	TAA	2	6	186461	186466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018643	TGA	2	6	186567	186572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018643	TAA	3	9	186615	186623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018643	CAA	2	6	186752	186757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018643	CAA	2	6	186785	186790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018643	ATA	2	6	186799	186804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018643	TAT	2	6	195480	195485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018643	CTG	2	6	199909	199914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018643	TCA	2	6	199974	199979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018643	ATT	2	6	202108	202113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018643	ATT	2	6	205015	205020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018643	AAT	2	6	209972	209977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018643	CAG	2	6	213497	213502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018643	ATT	2	6	213503	213508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018643	ATT	2	6	213526	213531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018643	ACA	2	6	220161	220166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018643	AGT	2	6	220198	220203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018643	AGA	2	6	228330	228335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018643	ATT	2	6	234881	234886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018643	TGA	2	6	236624	236629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018643	GTT	2	6	236654	236659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018643	ATT	2	6	236673	236678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018643	ATA	2	6	240505	240510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018643	AAT	2	6	248221	248226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018643	TGT	2	6	260628	260633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018643	CTT	2	6	272210	272215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018643	TAA	2	6	279228	279233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018643	TAT	2	6	279249	279254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018643	ATT	3	9	279256	279264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018643	AAC	2	6	280970	280975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018643	CTA	2	6	280981	280986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018643	ACT	2	6	289247	289252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018643	TAA	2	6	292733	292738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018643	ATT	2	6	297102	297107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018643	AGA	2	6	305465	305470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018643	TGG	2	6	319634	319639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018643	TAA	2	6	319676	319681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018643	TTA	2	6	323517	323522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018643	ATG	2	6	326138	326143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018643	TCA	2	6	329860	329865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018643	TTC	2	6	336586	336591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018643	CCT	2	6	336945	336950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018643	ATT	2	6	338494	338499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018643	ATA	2	6	338513	338518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018643	TAA	2	6	340237	340242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018643	TTA	2	6	340321	340326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018643	ATA	2	6	340356	340361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018643	ATT	2	6	347070	347075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018643	ATT	2	6	347078	347083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018643	AAT	2	6	347095	347100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018643	GGA	2	6	347847	347852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018643	TAT	3	9	355584	355592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018643	ATT	2	6	356347	356352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018643	TTA	2	6	356780	356785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018643	TGA	2	6	359589	359594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018643	TGT	2	6	367866	367871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018643	AGC	2	6	367948	367953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018643	GTT	2	6	367998	368003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018643	CAA	2	6	368027	368032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018643	TGA	2	6	374839	374844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018643	TTG	2	6	375163	375168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018643	ATT	2	6	378149	378154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018643	TAT	2	6	378186	378191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018643	GAA	2	6	378216	378221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018643	AAT	2	6	378240	378245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018643	ATA	2	6	379265	379270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018643	ATT	2	6	380121	380126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018643	AAT	2	6	380310	380315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018643	TAA	2	6	386788	386793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018643	TTG	2	6	386795	386800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018643	AAT	2	6	387903	387908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018643	AAT	2	6	399234	399239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018643	TTA	2	6	401573	401578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018643	TTC	2	6	401600	401605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018643	AAT	2	6	404170	404175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018643	TGT	2	6	404213	404218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_018643	GTT	2	6	404265	404270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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