MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 1449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018643	T	6	6	1275	1280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018643	ATT	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018643	TAA	2	6	13970	13975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018643	T	6	6	13978	13983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018643	GAA	2	6	15500	15505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018643	A	6	6	15504	15509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018643	AT	3	6	24136	24141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018643	TAT	2	6	24165	24170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018643	T	7	7	24178	24184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018643	TTA	2	6	24780	24785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018643	A	7	7	26756	26762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018643	TTAA	2	8	26808	26815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018643	T	6	6	26822	26827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018643	TAAA	2	8	26852	26859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018643	TTG	2	6	37470	37475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018643	A	7	7	40669	40675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018643	T	6	6	40677	40682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018643	T	7	7	40688	40694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018643	AGA	2	6	40739	40744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018643	ATT	2	6	40747	40752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018643	A	7	7	40765	40771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018643	TAAA	2	8	40794	40801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018643	TAAA	2	8	47922	47929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018643	CTT	2	6	47956	47961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018643	ATTA	2	8	47969	47976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018643	TGT	2	6	50599	50604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018643	A	8	8	54641	54648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018643	TAA	2	6	54651	54656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018643	A	9	9	54655	54663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018643	TAA	2	6	54673	54678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018643	AAT	2	6	54730	54735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018643	TTATT	2	10	55902	55911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018643	TAA	2	6	55912	55917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018643	T	7	7	55923	55929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018643	TA	3	6	55950	55955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018643	AAT	2	6	55957	55962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018643	ATT	2	6	55985	55990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018643	TGT	2	6	58768	58773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018643	TTG	2	6	61066	61071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018643	ATT	2	6	61072	61077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018643	T	6	6	61076	61081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018643	TTG	2	6	61085	61090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018643	ATT	2	6	65171	65176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018643	T	6	6	65180	65185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018643	A	6	6	65189	65194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018643	TCC	2	6	73267	73272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018643	T	9	9	74176	74184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018643	ATT	2	6	74187	74192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018643	A	7	7	74761	74767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018643	TCC	2	6	76084	76089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018643	TAAG	2	8	76099	76106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018643	TTA	2	6	76114	76119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018643	TCC	2	6	76992	76997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018643	TTA	2	6	77000	77005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018643	ATTT	2	8	80661	80668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018643	TA	3	6	80673	80678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018643	T	6	6	80681	80686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018643	ATA	2	6	84653	84658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018643	TTA	2	6	84662	84667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018643	ATT	2	6	84700	84705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018643	A	8	8	89077	89084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018643	T	7	7	89102	89108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018643	TAA	2	6	89127	89132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018643	A	10	10	89131	89140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018643	A	6	6	91671	91676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018643	T	6	6	91724	91729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018643	T	9	9	91777	91785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018643	T	6	6	91833	91838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018643	A	8	8	91843	91850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018643	CAT	2	6	91854	91859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018643	ATG	2	6	91862	91867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018643	T	6	6	91878	91883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018643	TAAA	2	8	93889	93896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018643	A	6	6	93958	93963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018643	A	7	7	93969	93975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018643	AT	3	6	102247	102252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018643	T	7	7	104669	104675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018643	T	9	9	104677	104685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018643	ATT	3	9	104706	104714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018643	AAT	2	6	110642	110647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018643	TA	3	6	110676	110681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018643	ATT	2	6	110716	110721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018643	AACTT	2	10	111745	111754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018643	TA	3	6	112503	112508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018643	T	10	10	126517	126526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018643	TCC	2	6	127852	127857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018643	AATT	2	8	135788	135795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018643	ACA	2	6	135824	135829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018643	AT	3	6	135830	135835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018643	TTC	2	6	136972	136977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018643	T	7	7	136988	136994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018643	T	6	6	137006	137011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018643	TAACT	2	10	137020	137029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018643	TATT	2	8	137037	137044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018643	TCA	2	6	137090	137095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018643	TA	3	6	137097	137102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018643	T	7	7	139685	139691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018643	A	8	8	142848	142855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018643	AT	3	6	142876	142881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018643	AAT	2	6	142884	142889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018643	ATTT	2	8	147083	147090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018643	ATT	2	6	147107	147112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018643	CTT	2	6	147853	147858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018643	TAA	2	6	147859	147864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018643	A	6	6	150182	150187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018643	TAAA	2	8	151411	151418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018643	AATTA	2	10	154120	154129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018643	AAAT	2	8	154130	154137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018643	GTA	2	6	160780	160785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018643	ATTA	2	8	160788	160795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018643	TA	3	6	162949	162954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018643	AAT	2	6	168988	168993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018643	ATT	2	6	168997	169002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018643	TAT	2	6	169018	169023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018643	A	6	6	169033	169038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018643	T	6	6	169042	169047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018643	A	7	7	169079	169085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018643	TAAT	2	8	171337	171344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018643	TA	3	6	171366	171371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018643	T	6	6	171384	171389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018643	AAT	2	6	171401	171406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018643	ATTT	2	8	173209	173216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018643	TAG	2	6	173244	173249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018643	TTTA	2	8	174167	174174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018643	ATT	2	6	174214	174219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018643	A	9	9	174789	174797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018643	TATT	2	8	174798	174805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018643	AT	4	8	175405	175412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018643	TA	3	6	176218	176223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018643	ATA	2	6	176226	176231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018643	TTTTAT	2	12	177074	177085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018643	TCA	2	6	177317	177322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018643	CTT	2	6	177413	177418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018643	TAA	2	6	177430	177435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018643	TTTA	2	8	177462	177469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018643	TATAT	2	10	177507	177516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018643	AT	3	6	177532	177537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018643	A	7	7	179516	179522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018643	TTG	2	6	185395	185400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018643	CTTTTT	2	12	185404	185415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_018643	CAT	2	6	185464	185469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018643	TTTA	2	8	185480	185487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018643	T	7	7	185508	185514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018643	AAG	2	6	185519	185524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018643	GAT	2	6	185544	185549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018643	ATA	2	6	185565	185570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018643	A	9	9	185570	185578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018643	TAA	2	6	186461	186466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018643	T	9	9	186470	186478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_018643	A	8	8	186544	186551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_018643	TAAA	2	8	355563	355570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018643	TAT	3	9	355584	355592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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