MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas macleodii ATCC 27126 chromosome

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018632	AAGTGA	2	12	38623	38634	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018632	TGAAAT	2	12	39168	39179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018632	GTTCAA	2	12	86208	86219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018632	AGGTTT	2	12	96635	96646	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018632	AAGTGT	2	12	107194	107205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018632	TGTTGA	2	12	107275	107286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018632	TTCAAA	2	12	114753	114764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018632	CTTGCT	2	12	160689	160700	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018632	ATACTA	2	12	199526	199537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018632	TGCTGT	2	12	285398	285409	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018632	GTTTTT	2	12	295452	295463	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018632	GAGGAA	2	12	300968	300979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018632	AAGTGA	2	12	314694	314705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018632	TGAAAT	2	12	315239	315250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018632	GTGTGC	2	12	369083	369094	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018632	TAAAGC	2	12	408984	408995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018632	TTGTAA	2	12	431415	431426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018632	CCGGTT	2	12	468329	468340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018632	AAAAAT	2	12	487504	487515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018632	AGACCA	2	12	497835	497846	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018632	TGATAT	2	12	534654	534665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018632	TACCTC	2	12	554356	554367	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018632	AAAAAT	2	12	659570	659581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018632	GTATGA	2	12	664302	664313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018632	AGCAAC	2	12	706090	706101	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018632	ATATTT	2	12	706304	706315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018632	CAAGGC	2	12	706752	706763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018632	CCTTAA	2	12	737861	737872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018632	CTAAAC	2	12	757866	757877	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018632	TTCAGT	2	12	774455	774466	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018632	GGTAAA	2	12	787102	787113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018632	TAATGC	2	12	836692	836703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018632	TAAAAA	2	12	891313	891324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018632	AACAAG	2	12	898138	898149	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018632	CTTGCA	2	12	923116	923127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018632	TACCAA	2	12	942775	942786	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018632	TGTTTT	2	12	959881	959892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018632	GAAAGG	2	12	1015705	1015716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018632	AATTAA	2	12	1019670	1019681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018632	GCTGTA	2	12	1055380	1055391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018632	AGACGC	2	12	1157352	1157363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018632	AACGTA	2	12	1186687	1186698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018632	TTTCGT	2	12	1204351	1204362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018632	ATAAGA	2	12	1228748	1228759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018632	CTTTGA	2	12	1274471	1274482	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018632	GAAGAT	2	12	1274670	1274681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018632	AAGTGT	2	12	1279606	1279617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018632	TATTTT	2	12	1297451	1297462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018632	GCTTGT	2	12	1297982	1297993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018632	GGCGAC	2	12	1298235	1298246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018632	CTCTGG	2	12	1333510	1333521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018632	GAAGAG	2	12	1380332	1380343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018632	CTTTTT	2	12	1409223	1409234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018632	TTGCAA	2	12	1444751	1444762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018632	GGCAAA	2	12	1512692	1512703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018632	TTCAAT	2	12	1524759	1524770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018632	CAACGC	2	12	1569659	1569670	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018632	CTATTC	2	12	1582816	1582827	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018632	CCACTG	2	12	1614097	1614108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018632	ATGAGC	2	12	1651778	1651789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018632	TTAAGT	2	12	1704630	1704641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018632	ACGTTA	2	12	1780374	1780385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018632	GCTATA	2	12	1781723	1781734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018632	AGCTTT	2	12	1803052	1803063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018632	GTTGGT	2	12	1817711	1817722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018632	GCCAAT	2	12	1825577	1825588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018632	AATTGC	2	12	1879889	1879900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018632	TTTACC	2	12	1919041	1919052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018632	AGGCCT	2	12	1982958	1982969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018632	AAATGT	2	12	1995002	1995013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018632	AAAAGC	2	12	2005931	2005942	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018632	TGAATT	2	12	2058261	2058272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018632	CTTTTA	2	12	2111697	2111708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018632	CACATT	2	12	2171681	2171692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018632	TTTACG	2	12	2175184	2175195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018632	TTATAT	2	12	2180605	2180616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018632	GAACGG	2	12	2192515	2192526	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018632	CGTTTT	2	12	2201362	2201373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018632	TAACGT	2	12	2234281	2234292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018632	ATTATC	2	12	2309682	2309693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018632	TAAGGT	2	12	2311970	2311981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018632	AAACAC	2	12	2370640	2370651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018632	AAAATG	2	12	2387166	2387177	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018632	TCTCAG	2	12	2399899	2399910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018632	TATTGT	2	12	2476867	2476878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018632	GTTAAC	2	12	2479468	2479479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018632	TACACA	2	12	2506996	2507007	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018632	ACTTAT	2	12	2507689	2507700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018632	TTGTAT	2	12	2550633	2550644	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018632	CAAAAG	2	12	2571477	2571488	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018632	GAAATG	2	12	2593940	2593951	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018632	TTTATA	2	12	2650889	2650900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018632	ATGCGT	2	12	2695609	2695620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018632	TGAGAT	2	12	2708339	2708350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018632	GATTTT	2	12	2708748	2708759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018632	TTTCAC	2	12	2715744	2715755	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018632	TGTGTT	2	12	2720667	2720678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018632	AATTCG	2	12	2723602	2723613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018632	TTTTAT	2	12	2732760	2732771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018632	GTTATT	2	12	2789652	2789663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018632	AGGAAC	2	12	2790052	2790063	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018632	TAAAAA	2	12	2799286	2799297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018632	GAAAAA	2	12	2800120	2800131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018632	CATCAC	2	12	2816453	2816464	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018632	TTATCT	2	12	2852381	2852392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018632	GCTTGA	2	12	2852629	2852640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018632	AGCACA	2	12	2854897	2854908	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018632	ATTTCA	2	12	2856864	2856875	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018632	TCACTT	2	12	2857409	2857420	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018632	CGCTTG	2	12	2889434	2889445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018632	TGGCTG	2	12	2889803	2889814	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018632	AAAGGT	2	12	2890255	2890266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018632	CCGAAA	2	12	2989643	2989654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018632	ACCCAT	2	12	2989711	2989722	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018632	CACTTA	2	12	2989809	2989820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018632	AAGAAA	2	12	2990303	2990314	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018632	CTTTTT	2	12	3004973	3004984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018632	CCCGGC	2	12	3010174	3010185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018632	TAAACA	2	12	3030018	3030029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018632	CCGCGT	2	12	3083547	3083558	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018632	AGCAAT	2	12	3110758	3110769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018632	CATCCT	2	12	3133894	3133905	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018632	ATACTG	2	12	3153739	3153750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018632	TGTTAT	2	12	3159654	3159665	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018632	TAACAA	2	12	3167436	3167447	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.