MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid p232

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018532	TTGA	2	8	1	8	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018532	ATCT	2	8	1204	1211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018532	AAGT	2	8	2052	2059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018532	CGTT	2	8	3131	3138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018532	GCGG	2	8	3992	3999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018532	CTGG	2	8	4708	4715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018532	CCTT	2	8	5138	5145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018532	CCAG	2	8	5379	5386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018532	CGAG	2	8	5772	5779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018532	GTAG	2	8	5792	5799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018532	CGGC	2	8	8838	8845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018532	TGCT	2	8	8943	8950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018532	GTTG	2	8	8968	8975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018532	TGCC	2	8	16348	16355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018532	GGAC	2	8	18180	18187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018532	CCCT	2	8	19871	19878	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_018532	GTGA	2	8	22859	22866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018532	GACA	2	8	23098	23105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018532	TGCA	2	8	25846	25853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018532	TCCC	2	8	26800	26807	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_018532	CGGG	2	8	27106	27113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018532	ATGC	2	8	28873	28880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018532	CCGG	2	8	28883	28890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018532	CCCA	2	8	31724	31731	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_018532	CGGA	2	8	34029	34036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018532	CCAG	2	8	39041	39048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018532	ATCC	2	8	39345	39352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018532	TGGC	2	8	45884	45891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018532	CGGA	2	8	49912	49919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018532	GCCT	2	8	50298	50305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018532	TGGG	2	8	60295	60302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018532	TTCA	2	8	65256	65263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018532	AGGT	2	8	65372	65379	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018532	CTGC	2	8	73802	73809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018532	AGGG	2	8	75358	75365	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018532	GCGT	2	8	76461	76468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018532	TGAG	2	8	76535	76542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018532	CCTC	2	8	76657	76664	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_018532	CATT	2	8	79270	79277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018532	AGGG	2	8	82899	82906	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018532	CCCT	2	8	84548	84555	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_018532	ACCA	2	8	84612	84619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018532	GGAG	2	8	84632	84639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018532	GAAA	2	8	84977	84984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018532	GAAA	2	8	86765	86772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018532	ACCA	2	8	86801	86808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018532	GAAA	2	8	88660	88667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018532	ACCA	2	8	88696	88703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018532	GGGC	2	8	90112	90119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018532	AAGC	3	12	90556	90567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018532	GAAA	2	8	90598	90605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018532	CGGG	2	8	91546	91553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018532	GGGC	2	8	91569	91576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018532	CAGC	2	8	94213	94220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018532	TTTC	2	8	94317	94324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018532	CAGA	2	8	97319	97326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018532	CTAA	2	8	97332	97339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018532	GACG	2	8	100287	100294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018532	GTCC	2	8	100305	100312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018532	TGGG	2	8	100574	100581	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018532	TCCC	2	8	102563	102570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_018532	TGGG	2	8	108128	108135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018532	GCCG	2	8	113119	113126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018532	AAGC	2	8	114688	114695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018532	GACC	2	8	114738	114745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018532	TTCA	2	8	116344	116351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018532	CCTG	2	8	119044	119051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018532	AGGG	2	8	124634	124641	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018532	AGGC	2	8	125353	125360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018532	TGCC	2	8	125711	125718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018532	GGGA	2	8	127136	127143	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018532	GAAC	2	8	127150	127157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018532	CCCG	2	8	130981	130988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_018532	TCTG	2	8	132150	132157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018532	GGTT	2	8	132442	132449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018532	GTCA	2	8	138271	138278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018532	GTTG	2	8	138332	138339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018532	GCAC	2	8	139459	139466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018532	CTTC	2	8	139745	139752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018532	GCCG	2	8	140873	140880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018532	GCTC	2	8	141269	141276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018532	GGTC	2	8	141284	141291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018532	TCAG	2	8	141570	141577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018532	CCAC	2	8	158877	158884	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_018532	CTCC	2	8	162125	162132	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_018532	TCCG	2	8	162158	162165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018532	GCTG	2	8	162268	162275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018532	AGCA	2	8	163736	163743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018532	ATGC	2	8	166325	166332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018532	GTAG	2	8	166388	166395	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018532	CGGG	2	8	170690	170697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018532	GCCC	2	8	170709	170716	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_018532	CCAC	2	8	172989	172996	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_018532	GTCA	2	8	173090	173097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018532	GACT	2	8	173767	173774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018532	GTAG	2	8	177289	177296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018532	CCAA	2	8	177789	177796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018532	ACTC	2	8	179359	179366	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018532	CAGG	2	8	183238	183245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018532	GCGG	2	8	184873	184880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018532	GGTC	2	8	186348	186355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018532	GAAC	2	8	186917	186924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018532	TGGC	2	8	187864	187871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018532	TTGT	2	8	191061	191068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018532	TCCT	2	8	194616	194623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018532	TGGC	2	8	205201	205208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018532	CAGT	2	8	212606	212613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018532	CTAC	2	8	218443	218450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018532	CTCG	2	8	222689	222696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018532	TCCC	2	8	224460	224467	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_018532	CATG	2	8	225121	225128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018532	TTCC	2	8	225438	225445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018532	CGAG	2	8	225577	225584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018532	TCGG	2	8	227654	227661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018532	TCGA	2	8	228075	228082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018532	AATC	2	8	228160	228167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018532	GCCA	2	8	228220	228227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018532	AAGG	2	8	228387	228394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018532	CAGA	2	8	228450	228457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018532	TGCG	2	8	230697	230704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018532	GCCA	2	8	230892	230899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018532	ATTG	2	8	231283	231290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018532	ATAA	3	12	231429	231440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018532	AGAT	2	8	231513	231520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.