MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaerobaculum mobile DSM 13181 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018024	TAAAA	2	10	7179	7188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018024	CTTAG	2	10	7670	7679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018024	CTCGT	2	10	21811	21820	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018024	CCTTA	2	10	28975	28984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018024	TAAAT	2	10	29334	29343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018024	ATATA	2	10	29796	29805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018024	TTATT	2	10	69018	69027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018024	GTCAA	2	10	72182	72191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018024	GTAGC	2	10	73536	73545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018024	ATAAA	3	15	75181	75195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018024	GTGAG	2	10	75206	75215	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018024	TCTTT	2	10	76405	76414	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018024	ATGAA	2	10	95514	95523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018024	TTATT	2	10	109480	109489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018024	TATAA	2	10	109657	109666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018024	GCTAA	2	10	112095	112104	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018024	CATAA	2	10	113378	113387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018024	TATAT	2	10	115554	115563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018024	AGTAG	2	10	142533	142542	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018024	CATAT	2	10	173750	173759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018024	AGTTT	2	10	197522	197531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018024	TTTTA	2	10	227509	227518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018024	ACTGG	2	10	227609	227618	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018024	TTATT	2	10	229727	229736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018024	ATTAT	2	10	252199	252208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018024	CAGTT	2	10	264242	264251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018024	CCGGA	2	10	422953	422962	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018024	TTGGC	2	10	432103	432112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018024	GGGCA	2	10	432800	432809	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018024	CAAAC	2	10	433131	433140	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018024	GAAAT	2	10	468364	468373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018024	TAATT	2	10	468380	468389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018024	TTAAT	2	10	510937	510946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018024	AGTTA	2	10	513979	513988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018024	GGGTC	2	10	522653	522662	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018024	TTTAA	2	10	523888	523897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018024	AGGTG	2	10	540306	540315	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018024	ATTTA	2	10	550584	550593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018024	GCAAA	2	10	552781	552790	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018024	ATAAA	2	10	559539	559548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018024	GGTGA	2	10	578191	578200	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018024	ATATT	2	10	584411	584420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018024	AAAGG	2	10	588771	588780	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018024	TTTTA	2	10	595187	595196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018024	CCAGG	2	10	601791	601800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018024	AGGCC	2	10	686988	686997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018024	GTCTG	2	10	687147	687156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018024	CAGTG	2	10	695000	695009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018024	TGGGG	2	10	696341	696350	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018024	CAAAA	2	10	708824	708833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018024	TAGTA	2	10	722816	722825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018024	TGATA	2	10	737993	738002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018024	CTTTT	2	10	751972	751981	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018024	TGCAA	2	10	757471	757480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018024	ATTTC	2	10	795661	795670	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018024	AGGAT	2	10	797646	797655	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018024	AATCC	2	10	797901	797910	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018024	CTATT	2	10	826167	826176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018024	AAAAT	2	10	829521	829530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018024	CTTCA	2	10	859563	859572	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018024	GATTA	2	10	896992	897001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018024	ATTGT	2	10	900974	900983	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018024	AACGT	2	10	901627	901636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018024	TTATT	2	10	903001	903010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018024	GCATG	2	10	983835	983844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018024	GGTGA	2	10	997871	997880	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018024	AAATT	2	10	997884	997893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018024	CCCTT	2	10	1002746	1002755	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_018024	TGCCT	2	10	1002761	1002770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018024	TGCCG	2	10	1015101	1015110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018024	AAAAG	2	10	1023914	1023923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018024	AATAT	2	10	1026938	1026947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018024	TCCTT	2	10	1037827	1037836	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_018024	TCAAG	2	10	1041542	1041551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018024	TATTT	2	10	1060804	1060813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018024	CTTGA	2	10	1061399	1061408	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018024	TATAT	2	10	1073733	1073742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018024	TGTTA	2	10	1076613	1076622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018024	AAATG	2	10	1088991	1089000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018024	CCTTA	2	10	1093083	1093092	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018024	ATATA	2	10	1097018	1097027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018024	ATTGA	2	10	1097493	1097502	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018024	AAACC	2	10	1107976	1107985	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018024	TTGCC	2	10	1108999	1109008	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018024	TGTTT	2	10	1111460	1111469	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018024	AACGG	2	10	1111692	1111701	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018024	GCGAC	2	10	1112116	1112125	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018024	TGTTT	2	10	1112525	1112534	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018024	TGCCG	2	10	1112983	1112992	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018024	CAATA	2	10	1133003	1133012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018024	TTTGC	2	10	1137612	1137621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018024	AATAA	2	10	1146499	1146508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018024	ATAAC	2	10	1155866	1155875	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018024	GACCC	2	10	1159847	1159856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_018024	TTAAT	2	10	1177999	1178008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018024	TATGG	2	10	1178075	1178084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018024	TGCGT	2	10	1180198	1180207	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018024	GAAAG	2	10	1180453	1180462	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018024	TTTAA	2	10	1181559	1181568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018024	CACTT	2	10	1195029	1195038	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018024	AGAAA	2	10	1197022	1197031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018024	ATTTA	2	10	1197320	1197329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018024	TTATC	2	10	1202655	1202664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018024	ACCCC	2	10	1211347	1211356	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
105	NC_018024	ATTAA	2	10	1222899	1222908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018024	ATGTC	2	10	1233279	1233288	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018024	ATTTA	2	10	1241355	1241364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018024	GCATA	2	10	1241505	1241514	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018024	ACTTA	2	10	1245010	1245019	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018024	CATAA	2	10	1257841	1257850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018024	ATTTA	2	10	1267560	1267569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018024	TAAAA	2	10	1271771	1271780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018024	CCACT	2	10	1274498	1274507	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_018024	GGGGC	2	10	1276357	1276366	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018024	AAGTA	2	10	1291557	1291566	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018024	TTAAG	2	10	1294341	1294350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018024	CCCTA	2	10	1294365	1294374	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_018024	TTATA	2	10	1308008	1308017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018024	TTAAA	2	10	1310620	1310629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018024	TACTG	2	10	1310943	1310952	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018024	ACTAA	2	10	1311019	1311028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018024	GGAAT	2	10	1319001	1319010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018024	TCCTT	2	10	1340731	1340740	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018024	ATAAA	2	10	1362116	1362125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018024	ATAGA	2	10	1371500	1371509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018024	TAATA	2	10	1380300	1380309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018024	AACCC	2	10	1412267	1412276	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_018024	AAATA	2	10	1414271	1414280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018024	CATTT	2	10	1429219	1429228	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018024	ATTTT	2	10	1430492	1430501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018024	CGAGG	2	10	1430829	1430838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018024	ATAAC	2	10	1459350	1459359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018024	TGTTT	2	10	1477592	1477601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018024	AGAAA	2	10	1477604	1477613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018024	TTAAA	2	10	1482155	1482164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018024	TTATA	2	10	1482268	1482277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018024	GCTAG	2	10	1513636	1513645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018024	AATAA	2	10	1527995	1528004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018024	CATAT	2	10	1540688	1540697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018024	AATCT	2	10	1550493	1550502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018024	TCATA	2	10	1550827	1550836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018024	CTTTT	2	10	1561275	1561284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018024	AATAG	2	10	1567273	1567282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018024	ACATA	2	10	1567726	1567735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_018024	TGTTT	2	10	1988608	1988617	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_018024	GAAAT	2	10	2062747	2062756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_018024	TAAGC	2	10	2123644	2123653	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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207	NC_018024	ATGAT	2	10	2145161	2145170	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.