MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aequorivita sublithincola DSM 14238 chromosome

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018013	TATTT	2	10	26149	26158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018013	TAAAA	2	10	26205	26214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018013	AACAA	2	10	36444	36453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018013	CATTT	2	10	76625	76634	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018013	TCAAA	2	10	76644	76653	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018013	TGTGT	2	10	88174	88183	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018013	AAACG	2	10	94820	94829	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018013	TGAAA	2	10	94848	94857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018013	ATAAA	2	10	95370	95379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018013	TGGCT	2	10	95400	95409	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018013	AAATT	2	10	106514	106523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018013	TTAAA	2	10	106575	106584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018013	TGTTT	2	10	112128	112137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018013	TATTG	2	10	114039	114048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018013	TTCAT	2	10	114164	114173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018013	TGTAG	2	10	123499	123508	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018013	AAACT	2	10	124526	124535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018013	AAATT	2	10	134895	134904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018013	ATTTC	2	10	137991	138000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018013	TTTTG	2	10	142624	142633	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018013	TAATT	2	10	148221	148230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018013	TATTT	2	10	170211	170220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018013	CGCTG	2	10	170943	170952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_018013	TGTTA	2	10	172950	172959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018013	TAAAT	2	10	175048	175057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018013	TAATA	2	10	175822	175831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018013	GTTTT	2	10	177900	177909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018013	AGAAA	2	10	178090	178099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018013	TAAAA	2	10	178784	178793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018013	TTTTA	2	10	185231	185240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018013	TATTC	2	10	190763	190772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018013	CTGTT	2	10	196240	196249	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018013	AGCGA	2	10	196575	196584	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018013	ACTCC	2	10	196716	196725	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_018013	TATAA	2	10	201778	201787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018013	CAGAA	2	10	202880	202889	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018013	TAAAT	2	10	203211	203220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018013	GTTTA	2	10	210784	210793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018013	TCAAA	2	10	244148	244157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018013	ACAAA	2	10	245871	245880	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018013	GAAAA	2	10	246242	246251	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018013	AAATC	2	10	252826	252835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018013	TTAAA	2	10	262559	262568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018013	CAATT	2	10	263143	263152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018013	TTTAC	2	10	263515	263524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018013	CAACT	2	10	263685	263694	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018013	AAAAT	2	10	271977	271986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018013	TTCAA	2	10	273361	273370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018013	TTTTC	2	10	273930	273939	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018013	TCCGA	2	10	276158	276167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018013	AATTA	2	10	311550	311559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018013	AGCGA	2	10	329662	329671	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018013	GTTTT	2	10	332729	332738	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018013	CAAAA	2	10	337400	337409	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018013	CAAAA	2	10	349851	349860	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018013	AGCGA	2	10	363764	363773	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018013	TTTAA	2	10	365561	365570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018013	AAAAC	2	10	369832	369841	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018013	TTTTA	2	10	370756	370765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018013	TTAAC	2	10	371962	371971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018013	AACAC	2	10	393065	393074	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018013	AAACA	2	10	394191	394200	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018013	CCTTT	2	10	397362	397371	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018013	AAATT	2	10	413700	413709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018013	ATTTT	2	10	416515	416524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018013	TAAAC	2	10	434084	434093	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018013	AAAGA	2	10	435383	435392	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018013	TTTGT	2	10	477481	477490	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018013	TAAAT	2	10	495021	495030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018013	ACTTC	2	10	495900	495909	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018013	TATTC	2	10	506075	506084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018013	ACTTA	2	10	506319	506328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018013	CTTAA	2	10	531206	531215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018013	GCAAC	2	10	533038	533047	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018013	CAAAA	2	10	534614	534623	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018013	AAAAC	2	10	534715	534724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018013	AAACC	2	10	557980	557989	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_018013	GAAAT	2	10	563602	563611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018013	ATTTT	2	10	582153	582162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018013	GCTTT	2	10	585794	585803	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018013	ACTGA	2	10	586216	586225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018013	ATTCT	2	10	597031	597040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018013	ATAAA	2	10	608501	608510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018013	TAATA	2	10	611211	611220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018013	TGCCG	2	10	617930	617939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_018013	GAAAA	2	10	640302	640311	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018013	AAAAG	2	10	646762	646771	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018013	AAGCG	2	10	678676	678685	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018013	TTTAA	2	10	680926	680935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018013	GAAAA	2	10	702353	702362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018013	AAATC	2	10	712221	712230	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018013	TGATT	2	10	723660	723669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018013	ATTTT	2	10	725659	725668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018013	TCTTA	2	10	758803	758812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018013	ATGAA	2	10	761291	761300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018013	TTCCC	2	10	768563	768572	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_018013	AATTT	2	10	789384	789393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018013	TTTAG	2	10	814975	814984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018013	AACAA	2	10	825845	825854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018013	TTAAA	2	10	847799	847808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018013	TATAA	2	10	855179	855188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018013	AAAAG	2	10	857655	857664	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018013	GAAAA	2	10	920865	920874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018013	ATTCT	2	10	938125	938134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018013	GCAAA	2	10	957867	957876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018013	ATAAA	2	10	983724	983733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018013	ATAAA	2	10	983864	983873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018013	ATTAT	2	10	1002846	1002855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018013	CAGCG	2	10	1017349	1017358	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018013	CAATT	2	10	1017396	1017405	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018013	ACATT	2	10	1022419	1022428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018013	TTCTT	2	10	1024502	1024511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018013	GTTTT	2	10	1031958	1031967	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018013	AATGA	2	10	1040607	1040616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018013	ATTTA	2	10	1050358	1050367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018013	ATTAA	2	10	1050419	1050428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018013	TATTT	2	10	1052797	1052806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018013	AAAAT	2	10	1052812	1052821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018013	TTTTA	2	10	1059898	1059907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018013	TAAAA	2	10	1059910	1059919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018013	AAAAC	2	10	1061652	1061661	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018013	CCGCT	2	10	1061701	1061710	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_018013	AAATT	2	10	1065151	1065160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018013	TCAAA	2	10	1066334	1066343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018013	TCCTT	2	10	1066373	1066382	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_018013	GAAAT	2	10	1068805	1068814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018013	AAATG	2	10	1069124	1069133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018013	GAAAA	2	10	1106557	1106566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018013	TTTAA	2	10	1119687	1119696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018013	ATTAT	2	10	1125908	1125917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018013	ATTTT	2	10	1147632	1147641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018013	ATTTT	2	10	1172148	1172157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018013	TACAT	2	10	1188400	1188409	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018013	TAAAA	2	10	1217566	1217575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018013	TTCCT	2	10	1217960	1217969	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_018013	AAACG	2	10	1224592	1224601	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018013	CTATG	2	10	1264126	1264135	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018013	TTTTA	2	10	1264195	1264204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018013	AATTG	2	10	1270420	1270429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018013	ATAAA	2	10	1299346	1299355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018013	ATTAA	2	10	1305662	1305671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018013	AAATT	2	10	1306573	1306582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018013	ATTTT	2	10	1312513	1312522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018013	GCCAC	2	10	1312623	1312632	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_018013	TATTT	2	10	1324766	1324775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018013	AATGA	2	10	1346022	1346031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018013	TTTAG	2	10	1348279	1348288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018013	TGCAT	2	10	1349154	1349163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018013	TTCTA	2	10	1351522	1351531	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_018013	GAATT	2	10	1407405	1407414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018013	ATTGT	2	10	1453790	1453799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018013	TTTTC	2	10	1455377	1455386	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_018013	TAATT	2	10	1479667	1479676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018013	TTTTA	2	10	1508246	1508255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_018013	AATTT	2	10	1579373	1579382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018013	ATTTT	2	10	1681542	1681551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018013	TTTGT	2	10	1692444	1692453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018013	TATTT	2	10	1693539	1693548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_018013	TAAAA	2	10	1713895	1713904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_018013	TATTT	2	10	2510808	2510817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018013	TAAAA	2	10	2516023	2516032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_018013	AATAT	2	10	2548727	2548736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018013	AAATG	2	10	2572595	2572604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018013	AGTAA	2	10	2572856	2572865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.