MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ chromosome

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017847	TTTATT	2	12	19	30	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017847	TTGATT	2	12	90	101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017847	AATTTA	2	12	358	369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017847	CAAAAA	2	12	12861	12872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017847	GAAATC	2	12	22785	22796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017847	TACAGA	2	12	52446	52457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017847	GTTCAT	2	12	56638	56649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017847	ATTTAT	2	12	63381	63392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017847	ACAAGC	2	12	70355	70366	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017847	AATATA	2	12	111174	111185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017847	AAAACA	2	12	114832	114843	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017847	CAAGGT	2	12	165325	165336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017847	TTTTTG	2	12	178043	178054	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017847	TAAAAG	2	12	189633	189644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017847	TTTATT	2	12	194271	194282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017847	TTATTT	2	12	195454	195465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017847	AATAAA	2	12	196406	196417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017847	TTTAAA	2	12	236382	236393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017847	CATGAC	2	12	238164	238175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017847	AAATTA	2	12	238224	238235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017847	TTAAAT	2	12	244067	244078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017847	TTAAAT	2	12	245354	245365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017847	AAAAAG	2	12	258519	258530	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017847	TAAATA	2	12	259206	259217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017847	TGGTCT	2	12	273688	273699	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017847	AGGGGC	2	12	279560	279571	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017847	ATTTTT	2	12	279590	279601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017847	TAAAAA	2	12	279765	279776	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017847	TAAAGA	2	12	286282	286293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017847	TAAAAG	2	12	300806	300817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017847	GTAAAA	2	12	340814	340825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017847	TATTTT	2	12	351867	351878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017847	TATAAA	2	12	354889	354900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017847	ATGGCT	2	12	386666	386677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017847	CCATAC	2	12	406014	406025	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017847	GATAAA	2	12	420693	420704	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017847	TAGTTT	2	12	462050	462061	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017847	TTTAGA	2	12	465801	465812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017847	AAAATG	2	12	474896	474907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017847	CGCCTT	2	12	484188	484199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017847	GAAATC	2	12	492402	492413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017847	GAAATC	2	12	524765	524776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017847	AATAAA	2	12	526025	526036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017847	TATTTT	2	12	547049	547060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017847	AAAATT	2	12	565673	565684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017847	AAAATT	2	12	632907	632918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017847	GTCAAT	2	12	634375	634386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017847	GAAAAA	2	12	636306	636317	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017847	TTAATT	2	12	649044	649055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017847	TAAAAA	2	12	666497	666508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017847	AGGTTT	2	12	683736	683747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017847	ATATTT	2	12	703104	703115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017847	TAAATA	2	12	720757	720768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017847	CTTGTT	2	12	748531	748542	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017847	TATATT	2	12	843118	843129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017847	GATTTT	2	12	843166	843177	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017847	TCGTGG	2	12	845226	845237	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017847	AAATTA	2	12	855103	855114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017847	TAAAAA	2	12	916603	916614	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017847	AAAAAT	2	12	920030	920041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017847	TATTCT	2	12	954317	954328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017847	TAAAAA	2	12	967956	967967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017847	CTTTTT	2	12	997049	997060	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017847	ATTTTA	2	12	1003851	1003862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017847	GTTTTT	2	12	1052445	1052456	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017847	TTTTTA	2	12	1055087	1055098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017847	TAAAAA	2	12	1082568	1082579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017847	ATAATT	2	12	1091634	1091645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017847	AAAAGA	2	12	1096726	1096737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017847	TTAAAT	2	12	1158119	1158130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017847	TTATAA	2	12	1158253	1158264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017847	TTTTAT	2	12	1189873	1189884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017847	TGAAAT	2	12	1191452	1191463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017847	TTGAAA	2	12	1194015	1194026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017847	TAAAAA	2	12	1223525	1223536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017847	GACATT	2	12	1241450	1241461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017847	TTATTT	2	12	1352552	1352563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017847	ATAAAA	2	12	1364046	1364057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017847	AAAGTA	2	12	1387714	1387725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017847	CAAAAA	2	12	1408355	1408366	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017847	ATAAAA	2	12	1446963	1446974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017847	ATTTTT	2	12	1465844	1465855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017847	CTTTTT	2	12	1482935	1482946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017847	TTTTCT	2	12	1498051	1498062	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017847	TTTTAT	2	12	1514158	1514169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017847	TAAAAA	2	12	1539443	1539454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017847	GCAAGT	2	12	1577521	1577532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017847	GAAAAT	2	12	1595927	1595938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017847	AAAATA	2	12	1625432	1625443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017847	TAAAAA	2	12	1652648	1652659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017847	TTAAAT	2	12	1680308	1680319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017847	ATTTTT	2	12	1706261	1706272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017847	GCTATG	2	12	1720648	1720659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017847	GCTTTA	2	12	1827971	1827982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017847	TTAGAT	2	12	1828004	1828015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017847	AAAGGA	2	12	1873484	1873495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017847	ACCGTT	2	12	1889909	1889920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017847	TATGTA	2	12	1911298	1911309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017847	TATAAC	2	12	1915909	1915920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017847	TTTGCT	2	12	1935244	1935255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017847	TAAAAA	2	12	1953967	1953978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017847	AATTGA	2	12	1955968	1955979	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017847	TCCTTT	2	12	2046222	2046233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017847	ATTTTT	2	12	2046362	2046373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017847	AATTTA	2	12	2077712	2077723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017847	CCTAGC	2	12	2079689	2079700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017847	TGATAA	2	12	2095033	2095044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017847	AACAAT	2	12	2112735	2112746	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017847	TAAAAA	2	12	2121591	2121602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017847	ATATTA	2	12	2123387	2123398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017847	ATTTAA	2	12	2212363	2212374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017847	CTCAAG	2	12	2218088	2218099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017847	ATTAAA	2	12	2219371	2219382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017847	TGATTA	2	12	2243417	2243428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017847	TTTATT	2	12	2252491	2252502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017847	TCTATA	2	12	2252716	2252727	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017847	ACAAAA	2	12	2273280	2273291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017847	TTTTTA	2	12	2305594	2305605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017847	CTTTAT	2	12	2306838	2306849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017847	TTACAC	2	12	2312362	2312373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017847	ATTTTA	2	12	2337421	2337432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017847	TACTTT	2	12	2357514	2357525	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017847	TTTTTA	2	12	2418234	2418245	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017847	TAAAAA	2	12	2422086	2422097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017847	AAATTT	2	12	2440422	2440433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017847	ATTTAA	2	12	2472166	2472177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017847	CAAATG	2	12	2515638	2515649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017847	AATTTA	2	12	2529341	2529352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017847	TGATTA	2	12	2542059	2542070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017847	TATTGA	2	12	2573707	2573718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.