MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter sp. L

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017192	TAAAT	2	10	1456	1465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017192	AAATA	2	10	35164	35173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017192	CCAAG	2	10	37174	37183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017192	CTAAG	2	10	43289	43298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017192	TTTTG	2	10	48528	48537	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017192	ATAAA	2	10	49194	49203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017192	TGATA	2	10	53590	53599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017192	ATTTA	2	10	76040	76049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017192	ATTAT	2	10	76148	76157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017192	TTTTG	2	10	86675	86684	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017192	AGATT	2	10	86776	86785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017192	TAAGT	2	10	88901	88910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017192	TAATT	2	10	91364	91373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017192	GATTT	2	10	94761	94770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017192	CTCTT	2	10	100999	101008	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017192	ATTAT	2	10	103697	103706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017192	ATATT	2	10	103711	103720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017192	ATTTT	2	10	112208	112217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017192	TAAAT	2	10	125497	125506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017192	TAAAA	2	10	125511	125520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017192	AGATG	2	10	125555	125564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017192	AGATA	2	10	133247	133256	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017192	TTAAT	2	10	154411	154420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017192	CTAAT	2	10	156736	156745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017192	AGAAA	2	10	193578	193587	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017192	TTTTA	2	10	226865	226874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017192	AAAAT	2	10	227017	227026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017192	GTTTA	2	10	247367	247376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017192	ATTTA	2	10	249849	249858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017192	TTTTA	2	10	250411	250420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017192	TTTAA	2	10	254749	254758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017192	GTCTC	2	10	264300	264309	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017192	GTCTC	2	10	264529	264538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017192	ATTTT	2	10	271321	271330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017192	ATTAA	2	10	279445	279454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017192	AGTAA	2	10	279465	279474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017192	ATTAT	2	10	317541	317550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017192	TAAAA	2	10	345178	345187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017192	TTTAT	2	10	346375	346384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017192	GTATA	2	10	363807	363816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017192	GTGAT	2	10	382850	382859	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017192	ATTTA	2	10	388649	388658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017192	CTACA	2	10	388774	388783	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017192	ATTTT	2	10	403908	403917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017192	TAAAA	2	10	412074	412083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017192	TTCTA	2	10	462862	462871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017192	ATATA	2	10	466121	466130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017192	AATTA	2	10	481237	481246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017192	ATGCT	2	10	494964	494973	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017192	ATGCT	2	10	494975	494984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017192	AATTA	2	10	519067	519076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017192	TGAAA	2	10	540949	540958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017192	ATAAA	2	10	561338	561347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017192	TATAT	2	10	566939	566948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017192	ATAAG	2	10	571102	571111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017192	TTAAA	2	10	572599	572608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017192	TTTTA	2	10	585422	585431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017192	CTTTT	2	10	619573	619582	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017192	ATTTT	2	10	625630	625639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017192	TTAGT	2	10	633367	633376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017192	TAATA	2	10	635918	635927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017192	TAAAT	2	10	636049	636058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017192	TTTAA	2	10	644213	644222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017192	ATTTA	2	10	646875	646884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017192	AACTA	2	10	651632	651641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017192	AACTA	2	10	652019	652028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017192	TAATT	2	10	654525	654534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017192	TAAAT	2	10	654553	654562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017192	AATTT	2	10	664707	664716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017192	TTAAA	2	10	664760	664769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017192	ATTAA	2	10	673848	673857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017192	ATTCT	2	10	683400	683409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017192	AAGAT	2	10	687178	687187	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017192	TTTTA	2	10	690761	690770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017192	GATTT	2	10	707434	707443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017192	TCTTT	2	10	709108	709117	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017192	TAAAA	2	10	710047	710056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017192	TAAAA	2	10	714332	714341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017192	TTAAA	2	10	728388	728397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017192	AAGAC	2	10	730826	730835	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017192	TTATT	2	10	749332	749341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017192	ATTTT	2	10	752237	752246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017192	ATAAA	2	10	752380	752389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017192	AATAT	2	10	757878	757887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017192	ATTAA	2	10	802069	802078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017192	ATTAA	2	10	810288	810297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017192	ATTTG	2	10	874369	874378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017192	AAACT	2	10	874627	874636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017192	TAATT	2	10	882781	882790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017192	TTAAA	2	10	884838	884847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017192	ATTTA	2	10	888220	888229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017192	TTATT	2	10	925743	925752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017192	ATATC	2	10	934837	934846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017192	GATTT	2	10	934873	934882	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017192	CTAAA	2	10	934953	934962	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017192	TTTAA	2	10	940862	940871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017192	TATTT	2	10	942846	942855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017192	ATTTA	2	10	943886	943895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017192	TTAAA	2	10	944625	944634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017192	TGTAA	2	10	955932	955941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017192	AATTT	2	10	964031	964040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017192	ATTAT	2	10	974306	974315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017192	GTTTA	2	10	975288	975297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017192	ATTTT	2	10	980634	980643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017192	TGAAT	2	10	993853	993862	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017192	TAAAA	2	10	993993	994002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017192	TTAAT	2	10	1034745	1034754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017192	TAATT	2	10	1041757	1041766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017192	CAAAA	2	10	1044472	1044481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017192	GTTTT	2	10	1050901	1050910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017192	AAATT	2	10	1056468	1056477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017192	AAACT	2	10	1078891	1078900	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017192	ATTTT	2	10	1086869	1086878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017192	TCGTG	2	10	1098621	1098630	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017192	TTAAG	2	10	1099094	1099103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017192	CTTAA	2	10	1099112	1099121	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017192	TTATT	2	10	1099587	1099596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017192	GTGAA	2	10	1099848	1099857	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017192	TATAT	2	10	1101289	1101298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017192	CCGTA	2	10	1101304	1101313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017192	TAATA	2	10	1109804	1109813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017192	ATTTT	2	10	1113785	1113794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017192	TTTAT	2	10	1113795	1113804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017192	ATTTA	2	10	1149940	1149949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017192	TTTTA	2	10	1165103	1165112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017192	TTACT	2	10	1166350	1166359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017192	CAATA	2	10	1186703	1186712	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017192	TATTG	2	10	1186733	1186742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017192	TTAAA	2	10	1188736	1188745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017192	TATGA	2	10	1191111	1191120	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017192	TTTTA	2	10	1206647	1206656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017192	CTAAA	2	10	1214552	1214561	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017192	ATTTA	2	10	1219241	1219250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017192	ATATT	2	10	1224809	1224818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017192	ATAAA	2	10	1235091	1235100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017192	AGTTA	2	10	1244434	1244443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017192	TAAAA	2	10	1251788	1251797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017192	TAATA	2	10	1254179	1254188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017192	TTTAA	2	10	1271017	1271026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017192	TTATA	2	10	1271032	1271041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017192	AAAAT	2	10	1271075	1271084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017192	TTATA	2	10	1276988	1276997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017192	TAATT	2	10	1296988	1296997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017192	TTATA	2	10	1297817	1297826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017192	ATGAT	2	10	1302059	1302068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017192	TCTTT	2	10	1335399	1335408	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017192	TAAAT	2	10	1344940	1344949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_017192	TCTAC	2	10	2342433	2342442	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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288	NC_017192	TACGG	2	10	2583977	2583986	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_017192	ATATA	2	10	2583992	2584001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017192	TCGGT	2	10	2584851	2584860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_017192	TTCAC	2	10	2585433	2585442	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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302	NC_017192	AAATA	2	10	2671262	2671271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_017192	ATTTA	2	10	2756917	2756926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_017192	TCGGT	2	10	2848689	2848698	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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329	NC_017192	GAATC	2	10	2850016	2850025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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331	NC_017192	TAAAT	2	10	2872882	2872891	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_017192	CTATT	2	10	2878579	2878588	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_017192	TATTT	2	10	2884678	2884687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_017192	ATTAA	2	10	2899750	2899759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_017192	TTATA	2	10	2919102	2919111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_017192	TAAAA	2	10	2924930	2924939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_017192	GAATA	2	10	2930966	2930975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
339	NC_017192	TTAAC	2	10	2933721	2933730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
340	NC_017192	TTTTA	2	10	2938798	2938807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_017192	AATAT	2	10	2941322	2941331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.