MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017167	CTA	2	6	1742075	1742080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017167	TA	3	6	1742103	1742108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017167	ACA	2	6	1742138	1742143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017167	GT	3	6	1742150	1742155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017167	A	6	6	1742252	1742257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017167	AT	3	6	1742738	1742743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017167	ACC	2	6	1742796	1742801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_017167	CT	3	6	1742805	1742810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_017167	AAT	2	6	1742877	1742882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017167	TCC	2	6	1742890	1742895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_017167	ATTATC	2	12	1742916	1742927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4012	NC_017167	CCAAT	2	10	1742975	1742984	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4013	NC_017167	CCT	2	6	1744425	1744430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_017167	GGT	2	6	1745762	1745767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017167	CTG	2	6	1745795	1745800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017167	TCA	2	6	1745895	1745900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017167	CAG	2	6	1745902	1745907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017167	TGG	2	6	1745931	1745936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017167	CAAGC	2	10	1745956	1745965	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4020	NC_017167	GCG	2	6	1746017	1746022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017167	CTG	2	6	1746025	1746030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017167	CTGCA	2	10	1746043	1746052	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4023	NC_017167	GACG	2	8	1746065	1746072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_017167	GGA	2	6	1746080	1746085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017167	TC	3	6	1746126	1746131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_017167	CAGC	2	8	1746150	1746157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_017167	AGC	2	6	1746171	1746176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017167	CCA	2	6	1746270	1746275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017167	GGAC	2	8	1746335	1746342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_017167	GTC	2	6	1746370	1746375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017167	CTG	2	6	1746409	1746414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017167	TC	3	6	1746485	1746490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_017167	GTT	2	6	1746529	1746534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017167	CTT	2	6	1746575	1746580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017167	ATCA	2	8	1746665	1746672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_017167	AAC	2	6	1746702	1746707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017167	CAA	2	6	1746804	1746809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017167	CATT	2	8	1746812	1746819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_017167	TCA	2	6	1746864	1746869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017167	GATG	2	8	1746872	1746879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017167	CTG	2	6	1746946	1746951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017167	CCGAA	2	10	1747012	1747021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4043	NC_017167	TTC	2	6	1747069	1747074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017167	CCA	2	6	1747081	1747086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_017167	ATC	2	6	1747091	1747096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017167	CTT	2	6	1747123	1747128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017167	CCA	2	6	1747136	1747141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_017167	GTCT	2	8	1747183	1747190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_017167	GCA	2	6	1747325	1747330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017167	GATG	2	8	1747354	1747361	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017167	CT	3	6	1747452	1747457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_017167	CAA	2	6	1747515	1747520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017167	TAT	2	6	1747578	1747583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017167	TTCT	2	8	1747616	1747623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_017167	AAT	2	6	1747649	1747654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017167	TA	4	8	1747763	1747770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017167	GTT	2	6	1747899	1747904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017167	ACG	2	6	1747980	1747985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017167	AT	3	6	1748097	1748102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017167	GAT	2	6	1748128	1748133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017167	TGA	2	6	1748136	1748141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017167	TAG	2	6	1748183	1748188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017167	TAGG	2	8	1748224	1748231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017167	TGG	2	6	1748275	1748280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017167	AGG	2	6	1748294	1748299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017167	AAT	2	6	1748322	1748327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017167	AC	3	6	1748341	1748346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_017167	GTA	2	6	1748357	1748362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017167	TGC	2	6	1748498	1748503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017167	AGA	3	9	1748607	1748615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017167	TCC	2	6	1748662	1748667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_017167	TC	3	6	1748668	1748673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_017167	AAT	2	6	1748683	1748688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017167	TGG	2	6	1748803	1748808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017167	TCC	2	6	1750405	1750410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_017167	CG	3	6	1750456	1750461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_017167	CGG	2	6	1750505	1750510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017167	CAG	2	6	1750551	1750556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017167	GTA	2	6	1750557	1750562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017167	GAGC	2	8	1750658	1750665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_017167	CTT	2	6	1750705	1750710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017167	CAC	2	6	1750725	1750730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_017167	CT	3	6	1750799	1750804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_017167	CAG	2	6	1750827	1750832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017167	TAC	2	6	1750860	1750865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017167	GTG	2	6	1750946	1750951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017167	GCC	2	6	1750986	1750991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_017167	ACG	2	6	1751070	1751075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017167	CAAAC	2	10	1751096	1751105	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4090	NC_017167	AGG	2	6	1751867	1751872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017167	TCA	2	6	1753540	1753545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017167	CGG	2	6	1753565	1753570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017167	CATG	2	8	1753744	1753751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_017167	AAC	2	6	1753755	1753760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017167	CCG	2	6	1753762	1753767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_017167	G	6	6	1756168	1756173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017167	TCGC	2	8	1756303	1756310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_017167	AAC	2	6	1756600	1756605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017167	ATGG	2	8	1756871	1756878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017167	GCG	2	6	1756894	1756899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017167	CCG	2	6	1756927	1756932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017167	GTA	2	6	1757001	1757006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017167	TCC	2	6	1759355	1759360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_017167	TGGAT	2	10	1759376	1759385	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017167	CAC	2	6	1759406	1759411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_017167	CTC	2	6	1759443	1759448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_017167	GAA	2	6	1759487	1759492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017167	ATA	2	6	1759500	1759505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017167	AGGTT	2	10	1759506	1759515	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017167	C	7	7	1761049	1761055	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4111	NC_017167	GCA	2	6	1761579	1761584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017167	TC	3	6	1762527	1762532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_017167	C	6	6	1763636	1763641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4114	NC_017167	AGA	2	6	1763642	1763647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017167	TCC	2	6	1764068	1764073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_017167	AGA	2	6	1765467	1765472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017167	CCT	2	6	1765516	1765521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_017167	GAT	2	6	1765561	1765566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017167	CTT	2	6	1767284	1767289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017167	ATCC	2	8	1768400	1768407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_017167	C	6	6	1768406	1768411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4122	NC_017167	ATTT	2	8	1768415	1768422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017167	TCA	2	6	1768439	1768444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017167	CGCCC	2	10	1769293	1769302	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4125	NC_017167	TAA	2	6	1770086	1770091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017167	GCGA	2	8	1770272	1770279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_017167	ACG	2	6	1770282	1770287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017167	CTG	2	6	1770331	1770336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017167	TG	3	6	1770335	1770340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_017167	TAG	2	6	1770507	1770512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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