MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017167	CGG	2	6	1601066	1601071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017167	C	6	6	1602968	1602973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3503	NC_017167	TCT	2	6	1602977	1602982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_017167	A	6	6	1603011	1603016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017167	GCC	2	6	1603017	1603022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_017167	GCG	2	6	1603028	1603033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017167	GTT	2	6	1603038	1603043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017167	C	6	6	1603833	1603838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3509	NC_017167	GACA	2	8	1604642	1604649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_017167	AGT	2	6	1604726	1604731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017167	AGG	2	6	1604806	1604811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017167	A	6	6	1606130	1606135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017167	CGC	2	6	1606158	1606163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_017167	GGC	2	6	1606168	1606173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_017167	CCT	2	6	1607449	1607454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_017167	CT	3	6	1607453	1607458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_017167	GT	3	6	1607488	1607493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017167	GCG	2	6	1607504	1607509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_017167	TCC	2	6	1607517	1607522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_017167	TCC	2	6	1608715	1608720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_017167	TGCG	2	8	1609627	1609634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_017167	CCT	2	6	1610658	1610663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_017167	CTCG	2	8	1610721	1610728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_017167	TCCC	2	8	1612433	1612440	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3525	NC_017167	ATC	3	9	1615129	1615137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3527	NC_017167	CGGC	2	8	1615647	1615654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_017167	GTG	2	6	1615668	1615673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017167	ATTCG	2	10	1615709	1615718	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3530	NC_017167	ACTG	2	8	1615720	1615727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_017167	ATA	2	6	1616424	1616429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017167	GAG	2	6	1616472	1616477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017167	GAT	2	6	1617829	1617834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017167	GCG	2	6	1617925	1617930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_017167	CTCC	2	8	1618878	1618885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3536	NC_017167	TGA	2	6	1618899	1618904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017167	CGCC	2	8	1618941	1618948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3539	NC_017167	CCCT	2	8	1621676	1621683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3540	NC_017167	CGG	2	6	1621733	1621738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017167	TCGCG	2	10	1621750	1621759	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3542	NC_017167	CTG	2	6	1621779	1621784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3544	NC_017167	A	6	6	1623035	1623040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3553	NC_017167	TGTA	2	8	1628997	1629004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3559	NC_017167	CA	3	6	1629345	1629350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3561	NC_017167	TCG	2	6	1629613	1629618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017167	CA	3	6	1629642	1629647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_017167	GCC	2	6	1629700	1629705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_017167	TCCA	2	8	1633077	1633084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_017167	TCCGC	2	10	1633107	1633116	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3566	NC_017167	AAT	2	6	1634037	1634042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017167	CGC	2	6	1634076	1634081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3570	NC_017167	CA	3	6	1635205	1635210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_017167	GC	3	6	1635726	1635731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_017167	TCC	2	6	1636995	1637000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_017167	TTC	2	6	1637047	1637052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3579	NC_017167	GC	3	6	1639111	1639116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3583	NC_017167	GAG	2	6	1644215	1644220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017167	GAG	2	6	1644227	1644232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017167	TGG	2	6	1644239	1644244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3590	NC_017167	GAG	2	6	1650093	1650098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_017167	GGA	2	6	1653623	1653628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3596	NC_017167	AGTTT	2	10	1654383	1654392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3599	NC_017167	TAA	2	6	1654554	1654559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017167	GAAG	2	8	1654569	1654576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017167	TCC	2	6	1655047	1655052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_017167	CCT	2	6	1656535	1656540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_017167	CTG	2	6	1658247	1658252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3607	NC_017167	AGGG	2	8	1658295	1658302	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3612	NC_017167	CAG	2	6	1658766	1658771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017167	T	7	7	1658827	1658833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017167	AAT	2	6	1658860	1658865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3626	NC_017167	TG	3	6	1659649	1659654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017167	CAAAA	2	10	1659661	1659670	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3628	NC_017167	A	6	6	1659667	1659672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017167	C	6	6	1659674	1659679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3630	NC_017167	AGG	2	6	1659689	1659694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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