MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017167	AG	3	6	1309202	1309207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017167	GCG	2	6	1309229	1309234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017167	GTC	2	6	1309235	1309240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017167	CGT	2	6	1310235	1310240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017167	CGA	2	6	1310265	1310270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017167	TGT	2	6	1310271	1310276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017167	TGC	2	6	1310325	1310330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017167	GCT	2	6	1310335	1310340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017167	CGC	2	6	1312807	1312812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_017167	TC	3	6	1314808	1314813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_017167	GACC	2	8	1315663	1315670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_017167	ACT	2	6	1316436	1316441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_017167	CGA	2	6	1316464	1316469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017167	GC	3	6	1316811	1316816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_017167	TGG	2	6	1319607	1319612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017167	GGA	2	6	1321266	1321271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017167	AAC	2	6	1326655	1326660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017167	AGG	2	6	1330091	1330096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017167	G	6	6	1331677	1331682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017167	GT	3	6	1331719	1331724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017167	CTC	2	6	1331731	1331736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_017167	GCGCG	2	10	1331822	1331831	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3023	NC_017167	CAG	2	6	1331863	1331868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017167	CG	4	8	1331871	1331878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_017167	CG	3	6	1331912	1331917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_017167	TCCT	2	8	1332453	1332460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_017167	GT	3	6	1332483	1332488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017167	CAGC	2	8	1332490	1332497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_017167	GA	3	6	1332641	1332646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017167	GGA	2	6	1332662	1332667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017167	GCG	2	6	1332691	1332696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017167	CTT	2	6	1333004	1333009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017167	CGAG	2	8	1333039	1333046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_017167	GC	3	6	1333503	1333508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_017167	ACGG	2	8	1333517	1333524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_017167	GCG	2	6	1333600	1333605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017167	GAT	2	6	1333633	1333638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3039	NC_017167	CG	3	6	1334397	1334402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_017167	T	6	6	1334414	1334419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017167	CG	3	6	1334424	1334429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_017167	GAG	2	6	1334461	1334466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017167	CAG	2	6	1334488	1334493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017167	TGG	2	6	1338122	1338127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017167	TGT	2	6	1340512	1340517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017167	AGGTG	2	10	1345311	1345320	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017167	GCG	2	6	1346227	1346232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017167	C	7	7	1348218	1348224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3049	NC_017167	CGAGG	2	10	1348261	1348270	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_017167	GGA	2	6	1348294	1348299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3052	NC_017167	GC	3	6	1350274	1350279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_017167	TGA	2	6	1350350	1350355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017167	GAAA	2	8	1350383	1350390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017167	GGC	2	6	1350402	1350407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_017167	GT	3	6	1350427	1350432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017167	CAT	2	6	1356479	1356484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017167	CGT	2	6	1356529	1356534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_017167	TTC	2	6	1356976	1356981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017167	AGG	2	6	1357003	1357008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017167	ATC	2	6	1357009	1357014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_017167	CTT	2	6	1357303	1357308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017167	AGG	2	6	1357376	1357381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017167	GGCGC	2	10	1360624	1360633	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3065	NC_017167	TCA	2	6	1360646	1360651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017167	AGG	2	6	1360659	1360664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017167	TC	3	6	1362403	1362408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3069	NC_017167	AGG	2	6	1362442	1362447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017167	GGGC	2	8	1362496	1362503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3074	NC_017167	CGT	2	6	1373900	1373905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_017167	T	6	6	1377575	1377580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_017167	TCAA	2	8	1378765	1378772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_017167	CGC	2	6	1378821	1378826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_017167	GGTC	2	8	1378827	1378834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_017167	GGC	2	6	1378856	1378861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017167	GATG	2	8	1378862	1378869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017167	TCG	2	6	1380877	1380882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017167	CAG	2	6	1380888	1380893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_017167	CCG	2	6	1380896	1380901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_017167	CGG	2	6	1380920	1380925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_017167	CGG	2	6	1380963	1380968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017167	ATC	2	6	1382001	1382006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017167	AAGG	2	8	1382012	1382019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_017167	AGA	2	6	1385135	1385140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017167	CAT	2	6	1385509	1385514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017167	GA	4	8	1385538	1385545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017167	GGA	2	6	1388478	1388483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017167	CTG	2	6	1389074	1389079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_017167	GA	3	6	1389590	1389595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017167	CG	3	6	1389605	1389610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_017167	GTTT	2	8	1392614	1392621	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017167	GAA	2	6	1392734	1392739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017167	ACA	2	6	1394513	1394518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017167	TCG	2	6	1394590	1394595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_017167	AGG	2	6	1394605	1394610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017167	AGG	2	6	1396314	1396319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017167	CGC	2	6	1397578	1397583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_017167	GGC	2	6	1397588	1397593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_017167	TCC	2	6	1397668	1397673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_017167	GCC	2	6	1397780	1397785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_017167	AGG	2	6	1397864	1397869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017167	CCCT	2	8	1398445	1398452	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3110	NC_017167	GGA	2	6	1398461	1398466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017167	GC	3	6	1398470	1398475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_017167	G	6	6	1400697	1400702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017167	CAT	2	6	1403639	1403644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017167	GAC	2	6	1403649	1403654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017167	TGT	2	6	1412191	1412196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017167	GGTG	2	8	1412202	1412209	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017167	CGA	2	6	1412220	1412225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017167	CGC	2	6	1412269	1412274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_017167	GTAG	2	8	1412295	1412302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017167	TCC	2	6	1412383	1412388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_017167	CGG	2	6	1412426	1412431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017167	GCC	2	6	1412465	1412470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_017167	CGG	2	6	1412624	1412629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_017167	CCA	2	6	1412647	1412652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017167	TGG	2	6	1412805	1412810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017167	AAG	2	6	1412827	1412832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017167	GCTC	2	8	1412872	1412879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_017167	TTG	2	6	1412907	1412912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017167	TAC	2	6	1412975	1412980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_017167	CCG	2	6	1413027	1413032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3265	NC_017167	CG	3	6	1501019	1501024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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