MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p2ABTCDC0715

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017166	GTC	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017166	GGC	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017166	TAA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017166	ATT	2	6	1941	1946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017166	AAT	2	6	2005	2010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017166	TTA	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017166	TAA	2	6	2310	2315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017166	TAT	2	6	2326	2331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017166	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017166	TTG	3	9	3928	3936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017166	CAA	3	9	3945	3953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017166	AAC	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017166	TTA	2	6	4040	4045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017166	CAA	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017166	AGG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017166	CAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017166	TAA	2	6	4350	4355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017166	AAT	2	6	4859	4864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017166	GCA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017166	ATA	2	6	4970	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017166	TGA	2	6	10955	10960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017166	CGC	2	6	15225	15230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017166	ATA	2	6	15245	15250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017166	GGA	2	6	15337	15342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017166	AAG	2	6	15365	15370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017166	ATA	2	6	15371	15376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017166	ATA	2	6	21628	21633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017166	AGG	2	6	24674	24679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017166	GCT	2	6	24693	24698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017166	TTA	2	6	26301	26306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017166	ATT	2	6	26385	26390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017166	ATC	2	6	27952	27957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017166	TAA	2	6	29058	29063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017166	TAA	2	6	29080	29085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017166	GCT	2	6	29146	29151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017166	ATT	2	6	29225	29230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017166	ACA	2	6	29537	29542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017166	TGA	2	6	30084	30089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017166	GTT	2	6	30161	30166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017166	AAC	2	6	30193	30198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017166	TAA	2	6	30276	30281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017166	GCA	2	6	31487	31492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017166	ATG	2	6	34154	34159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017166	TGA	2	6	34221	34226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017166	ATA	2	6	35135	35140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017166	TAG	2	6	35164	35169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017166	CTA	2	6	35692	35697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017166	TTA	2	6	37471	37476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017166	CAA	2	6	37900	37905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017166	AAT	2	6	37909	37914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017166	AGG	2	6	38469	38474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017166	AAG	2	6	39441	39446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017166	TCC	2	6	40645	40650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017166	TAT	2	6	40662	40667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017166	TTA	2	6	40854	40859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017166	CTT	2	6	40889	40894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017166	GTC	2	6	40897	40902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017166	TCA	2	6	40978	40983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017166	ATT	2	6	41019	41024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017166	TTA	2	6	41053	41058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017166	GTA	2	6	41099	41104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017166	GTT	2	6	42511	42516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017166	CAA	2	6	42526	42531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017166	TAG	2	6	42591	42596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017166	AAC	2	6	44698	44703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017166	CCT	2	6	44719	44724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017166	AGT	2	6	46110	46115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017166	TAT	2	6	49150	49155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017166	TGA	2	6	49179	49184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017166	ATT	2	6	50848	50853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017166	GAG	2	6	52397	52402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017166	TAA	2	6	53149	53154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017166	GAA	2	6	53265	53270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017166	AAT	2	6	54541	54546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017166	GCA	2	6	54740	54745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017166	TTA	2	6	54837	54842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017166	CTT	2	6	54872	54877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017166	GTC	2	6	54880	54885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017166	TCA	2	6	54961	54966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017166	ATC	2	6	55712	55717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017166	TAA	2	6	55812	55817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017166	AAT	2	6	57480	57485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017166	TAA	2	6	57542	57547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017166	AGA	3	9	59322	59330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017166	ATC	2	6	59391	59396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017166	ATG	2	6	59450	59455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017166	TTG	2	6	59457	59462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017166	ATT	2	6	59486	59491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017166	TAA	2	6	59600	59605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017166	GTA	2	6	59620	59625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017166	CAA	2	6	60598	60603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017166	GAT	2	6	61091	61096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017166	GAT	2	6	61104	61109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017166	ATT	2	6	61120	61125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017166	AAG	2	6	61186	61191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017166	ATA	2	6	61770	61775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017166	TTG	2	6	67828	67833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017166	TAA	2	6	68011	68016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017166	GTG	2	6	68122	68127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017166	CAT	2	6	68158	68163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017166	GGT	2	6	70336	70341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017166	TGG	2	6	70469	70474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017166	ATA	3	9	70486	70494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.