MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017150	TATTTT	2	12	157463	157474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017150	TTTTGC	2	12	163909	163920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017150	TGTGTA	2	12	185229	185240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017150	TATTTA	2	12	185346	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017150	GTCGGA	2	12	196772	196783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017150	ACCTTT	2	12	230042	230053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017150	CGACCG	2	12	278785	278796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017150	TGCCAC	2	12	291052	291063	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017150	GGGCGG	2	12	309577	309588	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017150	AGAAAA	2	12	318243	318254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017150	TTCTGG	2	12	349057	349068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017150	GGCGCG	2	12	419531	419542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017150	TATGCA	2	12	473974	473985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017150	AAACCA	2	12	521869	521880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017150	AAAATT	2	12	530978	530989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017150	TAAAAA	2	12	533163	533174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017150	TGCCAA	2	12	645198	645209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017150	GTGCGT	2	12	723394	723405	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017150	AAAAGG	2	12	753048	753059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017150	TGAACG	2	12	766369	766380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017150	TAAAGC	2	12	774384	774395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017150	GCGCAA	2	12	791223	791234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017150	TGCGCG	2	12	866634	866645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017150	GAAGGT	2	12	867506	867517	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017150	AGACGG	2	12	963628	963639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017150	CCTTTC	2	12	1022642	1022653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017150	GCCGGG	2	12	1042784	1042795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017150	TTTTCT	2	12	1055352	1055363	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017150	GGGGAT	2	12	1088913	1088924	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017150	TGTTGG	2	12	1089491	1089502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017150	GGGCAG	2	12	1191163	1191174	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017150	ACGGAA	2	12	1219203	1219214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017150	GGAACG	2	12	1243193	1243204	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017150	TATTCG	2	12	1317943	1317954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017150	AAACAT	2	12	1334028	1334039	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017150	TTCAGG	2	12	1334101	1334112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017150	CAAAAA	2	12	1347809	1347820	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017150	CAAAAA	2	12	1368733	1368744	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017150	TTGGGG	2	12	1369267	1369278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017150	TTTGAT	2	12	1636207	1636218	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017150	CTCGCC	2	12	1638972	1638983	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017150	CCGAAA	2	12	1711223	1711234	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017150	TTTTTA	2	12	1743076	1743087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017150	GAGCCC	2	12	1752473	1752484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017150	CGGTTC	2	12	1757983	1757994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017150	TATGGA	2	12	1825114	1825125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017150	CGATCC	2	12	1827558	1827569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017150	GATGCC	2	12	1827607	1827618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017150	TGAAGA	2	12	1830287	1830298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017150	AGCTAT	2	12	1839412	1839423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017150	GTTTTT	2	12	1890202	1890213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017150	ATCACG	2	12	1924247	1924258	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017150	TATTTT	2	12	1934213	1934224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017150	TGATCA	2	12	1938330	1938341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017150	CTACGC	2	12	2002381	2002392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017150	AACCCT	2	12	2131438	2131449	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017150	AATATA	2	12	2161388	2161399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017150	CTCGCC	2	12	2191196	2191207	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017150	TGCGGT	2	12	2216947	2216958	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017150	GAAAAA	2	12	2257638	2257649	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017150	GGGAAG	2	12	2278944	2278955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017150	ATCCTT	2	12	2319545	2319556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017150	TCGTTA	2	12	2324382	2324393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017150	AAAATA	2	12	2335228	2335239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017150	AATTGG	2	12	2387355	2387366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017150	GCGCCA	2	12	2410933	2410944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017150	CAGAAA	2	12	2447334	2447345	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017150	AGCTTC	2	12	2495625	2495636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017150	ACGTCA	2	12	2514522	2514533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017150	CTCGCC	2	12	2517040	2517051	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017150	ACCTGC	2	12	2552195	2552206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017150	CCGGAT	2	12	2585381	2585392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017150	TCGCTG	2	12	2608810	2608821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017150	GCTTGC	2	12	2608956	2608967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017150	CTCGCC	2	12	2673500	2673511	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017150	TCTTAC	2	12	2694399	2694410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017150	ATTTTA	2	12	2696513	2696524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017150	CTTTTT	2	12	2713503	2713514	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017150	GCTTCT	2	12	2751544	2751555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017150	TCCTTT	2	12	2776340	2776351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.