MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017150	GCTTG	2	10	169	178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017150	GTACG	2	10	937	946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017150	AATAA	2	10	2603	2612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017150	TTTGA	2	10	59031	59040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017150	CTGAA	2	10	67913	67922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017150	CAAGG	2	10	71136	71145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017150	AAGGT	2	10	79292	79301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017150	TTTTC	2	10	83188	83197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017150	GCTCT	2	10	84520	84529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017150	AGGGA	2	10	84576	84585	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017150	CAGAA	2	10	87578	87587	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017150	GCGTT	2	10	89967	89976	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017150	AGGGC	2	10	96648	96657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017150	AAAAC	2	10	112799	112808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017150	AACAG	2	10	120933	120942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017150	GCATA	2	10	126079	126088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017150	CAGGA	2	10	136034	136043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017150	CCTAT	2	10	140554	140563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017150	TAGAT	2	10	150647	150656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017150	ATTTT	2	10	150715	150724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017150	CAAAA	2	10	157372	157381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017150	TAAAG	2	10	163736	163745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017150	TAGAG	2	10	163998	164007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017150	GTAAA	2	10	181423	181432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017150	TTCCA	2	10	205975	205984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017150	GAATG	2	10	223657	223666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017150	AAAAG	2	10	230260	230269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017150	ACCGC	2	10	280863	280872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017150	CTGTC	2	10	291042	291051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017150	ATCCT	2	10	300755	300764	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017150	CTTTA	2	10	303642	303651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017150	ATAGT	2	10	345652	345661	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017150	TATAT	2	10	345711	345720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017150	GGGCA	2	10	348111	348120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017150	ACGGC	2	10	349103	349112	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017150	AAAGG	2	10	350892	350901	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017150	TTGCG	2	10	352886	352895	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017150	TCAAC	2	10	354748	354757	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017150	TCTAC	2	10	354758	354767	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017150	TTTCT	2	10	358163	358172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017150	CTTTA	2	10	363586	363595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017150	CACCC	2	10	368171	368180	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_017150	ATTAA	2	10	368186	368195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017150	AACAC	2	10	379221	379230	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017150	ATGGC	2	10	391765	391774	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017150	AAACA	2	10	413288	413297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017150	TGAAC	2	10	413496	413505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017150	GGGGC	2	10	419590	419599	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017150	GGGCA	2	10	424169	424178	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017150	AGGGT	2	10	433027	433036	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017150	ACAGA	2	10	458360	458369	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017150	AACAG	2	10	465436	465445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017150	GGGGT	2	10	473921	473930	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017150	AACAA	2	10	477231	477240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017150	GCCAC	2	10	487195	487204	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017150	CGGAA	2	10	491301	491310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017150	GCCGG	2	10	501962	501971	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017150	GGGTG	2	10	503243	503252	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017150	TTGCG	2	10	505190	505199	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017150	GGGGA	2	10	533466	533475	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017150	GGCGT	2	10	535009	535018	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017150	GAAAA	2	10	565225	565234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017150	AGAAA	2	10	583128	583137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017150	AAAGA	2	10	606452	606461	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017150	GTCTG	2	10	616569	616578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017150	TGCGG	2	10	618027	618036	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017150	CATGT	2	10	636260	636269	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017150	GGCAG	2	10	637381	637390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017150	GTGGC	2	10	643183	643192	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017150	TGTGG	2	10	645091	645100	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017150	TTTGT	2	10	650006	650015	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017150	TTTTC	2	10	656005	656014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017150	CAGGG	2	10	662790	662799	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017150	GGAAG	2	10	680889	680898	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017150	GTTAC	2	10	699806	699815	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017150	CGTTT	2	10	725052	725061	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017150	ACGTA	2	10	732341	732350	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017150	GGGAA	2	10	771687	771696	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017150	GCTGT	2	10	771887	771896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017150	TTTCT	2	10	785438	785447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017150	CGAGA	2	10	799660	799669	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017150	GGTGT	2	10	821567	821576	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017150	CTTGC	2	10	851512	851521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017150	TTTCT	2	10	855119	855128	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017150	GGGTG	2	10	866436	866445	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017150	CAAGC	2	10	867607	867616	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017150	AATTT	2	10	867980	867989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017150	AAAGG	2	10	868294	868303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017150	TTTTC	2	10	875885	875894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017150	AGATA	2	10	888814	888823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017150	CTGAA	2	10	889177	889186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017150	AAGGA	2	10	912525	912534	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017150	AGCTA	2	10	937324	937333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017150	TCTCA	2	10	950836	950845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017150	GCACA	2	10	1051342	1051351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017150	GTTGT	2	10	1068951	1068960	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017150	TGCAC	2	10	1092802	1092811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017150	AAAAG	2	10	1096074	1096083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017150	GTGAA	2	10	1108225	1108234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017150	GAAAA	2	10	1155088	1155097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017150	AAAAT	2	10	1176991	1177000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017150	TCTGT	2	10	1177046	1177055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017150	TAAAA	2	10	1177146	1177155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017150	TTCCT	2	10	1186067	1186076	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017150	GCAAG	2	10	1238027	1238036	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017150	TCCTG	2	10	1243023	1243032	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017150	TCTTT	2	10	1248563	1248572	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017150	GTTTT	2	10	1253620	1253629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017150	TCTTT	2	10	1257721	1257730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017150	CACAA	2	10	1306298	1306307	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017150	CTGCC	2	10	1334090	1334099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017150	ACGAT	2	10	1347768	1347777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017150	CCTTG	2	10	1366799	1366808	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017150	AACGA	2	10	1368829	1368838	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017150	CACAA	2	10	1390638	1390647	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017150	AACAG	2	10	1403866	1403875	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017150	TAATA	2	10	1404505	1404514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017150	ACGCA	2	10	1419575	1419584	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017150	TATTT	2	10	1470586	1470595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017150	CACAA	2	10	1474165	1474174	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017150	ATAGC	2	10	1474291	1474300	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017150	TTATT	2	10	1493173	1493182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017150	TTAAA	2	10	1504620	1504629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017150	ATTAA	2	10	1504632	1504641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017150	TAAAT	2	10	1512333	1512342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017150	TACGC	2	10	1525484	1525493	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017150	TATAT	2	10	1537981	1537990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017150	AAATT	2	10	1571365	1571374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017150	ATTTT	2	10	1581506	1581515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017150	TAAAT	2	10	1581580	1581589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017150	TATTT	2	10	1581701	1581710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017150	TAAAA	2	10	1581936	1581945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017150	CGATA	2	10	1587980	1587989	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017150	ATAAA	2	10	1587990	1587999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017150	ATTTT	2	10	1591007	1591016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017150	ATTTT	2	10	1595582	1595591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017150	CTTAC	2	10	1625164	1625173	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017150	GGGAT	2	10	1637431	1637440	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017150	GCCCA	2	10	1641443	1641452	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017150	CACGA	2	10	1641510	1641519	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017150	CCCAT	2	10	1642840	1642849	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_017150	AGAAA	2	10	1661758	1661767	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017150	GAAAA	2	10	1691999	1692008	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017150	CCCCG	2	10	1695203	1695212	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
145	NC_017150	TGCCT	2	10	1737716	1737725	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017150	CAGAG	2	10	1781194	1781203	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_017150	TCATT	2	10	2124203	2124212	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_017150	CCTTG	2	10	2146972	2146981	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.