MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017136	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017136	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017136	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017136	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017136	GCTCC	2	10	34074	34083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017136	AGAAA	2	10	40172	40181	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017136	AGAAA	2	10	41841	41850	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017136	CTTGC	2	10	81737	81746	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017136	TTTCT	2	10	83687	83696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017136	CCAGA	2	10	86628	86637	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017136	TCACT	2	10	91070	91079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017136	AATCA	2	10	91101	91110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017136	CTGAG	2	10	91118	91127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017136	TTTAC	2	10	92312	92321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017136	TTATG	2	10	99868	99877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017136	GACAT	2	10	103734	103743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017136	GTATT	2	10	111032	111041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017136	TTTCT	2	10	131058	131067	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017136	ATAGT	2	10	135467	135476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017136	TTTCT	2	10	142160	142169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017136	CTTTT	2	10	144072	144081	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017136	ATGAC	2	10	144212	144221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017136	AGAAA	2	10	144523	144532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017136	TGATC	2	10	146205	146214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017136	CAGAT	2	10	146409	146418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017136	AAACA	2	10	153812	153821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017136	CTTCC	2	10	154415	154424	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017136	CTGCC	2	10	155987	155996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017136	AGAAA	2	10	159977	159986	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017136	TCTAT	2	10	162174	162183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017136	TTTCT	2	10	165429	165438	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017136	CTGCT	2	10	169075	169084	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017136	CCGGA	2	10	169191	169200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017136	ATGCA	2	10	176384	176393	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017136	AGAAA	2	10	180585	180594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017136	AGAAA	2	10	182266	182275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017136	CCAGC	2	10	190345	190354	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017136	GCCAC	2	10	191174	191183	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.