MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	CTTC	2	8	1004	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017134	ACGG	2	8	2378	2385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017134	GATC	3	12	2574	2585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017134	TCGT	2	8	4285	4292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017134	AGCC	2	8	4843	4850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017134	CGGT	2	8	8484	8491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017134	TTGC	2	8	13240	13247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017134	CGAT	2	8	13374	13381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017134	GACT	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017134	ACAG	2	8	15390	15397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017134	TAAC	2	8	17996	18003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017134	TTTG	2	8	18031	18038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017134	CTGT	2	8	18574	18581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017134	TCTT	2	8	25386	25393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017134	ACTG	2	8	27856	27863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017134	ACAG	2	8	29631	29638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017134	GACT	2	8	30431	30438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017134	CCAC	2	8	34139	34146	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017134	CCAT	2	8	37134	37141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017134	CCGT	2	8	38367	38374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017134	ATCC	2	8	38504	38511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017134	ATCC	2	8	38691	38698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017134	ACAG	2	8	41629	41636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017134	ACAG	2	8	43298	43305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017134	AATA	2	8	45237	45244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017134	AGGC	2	8	48127	48134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017134	CTTC	2	8	49133	49140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017134	GTGA	2	8	49229	49236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017134	GGTA	2	8	50617	50624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017134	AAAT	2	8	60940	60947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017134	CTGT	2	8	63599	63606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017134	GGAA	2	8	65142	65149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017134	CTGA	2	8	67470	67477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017134	TTTA	2	8	67582	67589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017134	GTCA	2	8	69897	69904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017134	CTTA	2	8	74579	74586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017134	CCAG	2	8	74789	74796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017134	GATA	2	8	74826	74833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017134	CTGT	2	8	75167	75174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017134	CCTG	2	8	80594	80601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017134	GTGG	2	8	81658	81665	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017134	CAGG	2	8	81756	81763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017134	GAAT	2	8	84278	84285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017134	CCAT	2	8	84403	84410	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017134	CAAG	2	8	85556	85563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017134	CCGG	2	8	86647	86654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017134	ATTG	2	8	86692	86699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017134	CCAG	2	8	87723	87730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017134	CGTC	2	8	87923	87930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017134	AACT	2	8	88094	88101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017134	CTGT	2	8	88557	88564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017134	GTTC	2	8	91065	91072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017134	AAAG	2	8	91201	91208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017134	ACTT	2	8	92358	92365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017134	TACC	2	8	92392	92399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017134	ACAG	2	8	94525	94532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017134	CTTT	2	8	95769	95776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017134	TGTT	2	8	95804	95811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017134	AGTA	2	8	95944	95951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017134	AAAT	2	8	96031	96038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017134	GATG	2	8	100330	100337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017134	ATTG	2	8	103529	103536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017134	GTAA	2	8	103740	103747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017134	GGTA	2	8	104348	104355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017134	AGAT	2	8	104551	104558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017134	TTCT	2	8	104883	104890	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017134	TATT	2	8	105431	105438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017134	CTTG	2	8	105462	105469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017134	GTGA	2	8	107351	107358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017134	CAAT	2	8	111087	111094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017134	GTGC	2	8	126516	126523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017134	TGGA	2	8	128484	128491	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017134	CTGT	2	8	129667	129674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017134	TTGA	2	8	132063	132070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017134	TTGA	2	8	132105	132112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017134	AGCA	2	8	135529	135536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017134	GCCG	2	8	136638	136645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017134	GGCG	2	8	138687	138694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017134	ACGA	2	8	139674	139681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017134	CTGT	2	8	140769	140776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017134	GAAC	2	8	144054	144061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017134	ACAG	2	8	145980	145987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017134	GCAG	2	8	146665	146672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017134	CTGT	2	8	149533	149540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017134	CTCA	2	8	152217	152224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017134	TCAA	2	8	153640	153647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017134	CAAC	2	8	153683	153690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017134	GATA	2	8	157345	157352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017134	ACAG	2	8	161434	161441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017134	TGCT	2	8	161759	161766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017134	ATTC	2	8	162308	162315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017134	CTGT	2	8	164038	164045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017134	TCGC	2	8	169179	169186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017134	ACGC	2	8	169310	169317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017134	TCCT	2	8	174117	174124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017134	CCAG	2	8	174641	174648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017134	TGTA	2	8	174711	174718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017134	GATA	2	8	180050	180057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017134	TGAG	2	8	180187	180194	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017134	GTGA	2	8	180253	180260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017134	ACAG	2	8	182042	182049	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017134	ACAG	2	8	183723	183730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017134	GCCA	2	8	189013	189020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017134	GACA	2	8	189432	189439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017134	CGGG	2	8	189800	189807	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017134	GAAG	2	8	190347	190354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017134	TGGA	2	8	190762	190769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017134	CAAA	2	8	191025	191032	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017134	TGAC	2	8	191159	191166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017134	TCCA	2	8	191332	191339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.