MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017130	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017130	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017130	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017130	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017130	GCTCC	2	10	34082	34091	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017130	AGAAA	2	10	40180	40189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017130	AGAAA	2	10	41849	41858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017130	CTTGC	2	10	81745	81754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017130	TTTCT	2	10	83695	83704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017130	CCAGA	2	10	86636	86645	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017130	TCACT	2	10	91078	91087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017130	AATCA	2	10	91109	91118	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017130	CTGAG	2	10	91126	91135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017130	TTTAC	2	10	92320	92329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017130	TTATG	2	10	99876	99885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017130	GACAT	2	10	103742	103751	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017130	GTATT	2	10	111040	111049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017130	TTTCT	2	10	131066	131075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017130	ATAGT	2	10	135475	135484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017130	TTTCT	2	10	142168	142177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017130	CTTTT	2	10	144080	144089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017130	ATGAC	2	10	144220	144229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017130	AGAAA	2	10	144531	144540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017130	TGATC	2	10	146213	146222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017130	CAGAT	2	10	146417	146426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017130	AAACA	2	10	153820	153829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017130	CTTCC	2	10	154423	154432	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017130	CTGCC	2	10	155995	156004	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017130	AGAAA	2	10	159985	159994	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017130	TCTAT	2	10	162182	162191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017130	TTTCT	2	10	165437	165446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017130	CTGCT	2	10	169083	169092	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017130	CCGGA	2	10	169199	169208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017130	ATGCA	2	10	176392	176401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017130	AGAAA	2	10	180593	180602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017130	AGAAA	2	10	182274	182283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017130	CCAGC	2	10	190353	190362	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017130	GCCAC	2	10	191182	191191	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.