MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017108	TATTTT	2	12	157463	157474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017108	TTTTGC	2	12	163909	163920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017108	TGTGTA	2	12	185229	185240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017108	TATTTA	2	12	185346	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017108	GTCGGA	2	12	196772	196783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017108	ACCTTT	2	12	230042	230053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017108	CGACCG	2	12	278785	278796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017108	TGCCAC	2	12	291046	291057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017108	GGGCGG	2	12	309571	309582	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017108	AGAAAA	2	12	318237	318248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017108	TTCTGG	2	12	349051	349062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017108	GGCGCG	2	12	419525	419536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017108	TATGCA	2	12	473968	473979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017108	AAACCA	2	12	521863	521874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017108	AAAATT	2	12	530972	530983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017108	TAAAAA	2	12	533157	533168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017108	TGCCAA	2	12	645192	645203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017108	GTGCGT	2	12	723388	723399	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017108	AAAAGG	2	12	753042	753053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017108	TGAACG	2	12	766363	766374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017108	TAAAGC	2	12	774378	774389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017108	GCGCAA	2	12	791217	791228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017108	TGCGCG	2	12	866628	866639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017108	GAAGGT	2	12	867500	867511	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017108	AGACGG	2	12	963622	963633	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017108	CCTTTC	2	12	1022636	1022647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017108	GCCGGG	2	12	1042778	1042789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017108	TTTTCT	2	12	1055346	1055357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017108	GGGGAT	2	12	1088907	1088918	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017108	TGTTGG	2	12	1089485	1089496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017108	GGGCAG	2	12	1191157	1191168	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017108	ACGGAA	2	12	1219197	1219208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017108	GGAACG	2	12	1243187	1243198	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017108	TATTCG	2	12	1317937	1317948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017108	AAACAT	2	12	1334022	1334033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017108	TTCAGG	2	12	1334095	1334106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017108	CAAAAA	2	12	1347803	1347814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017108	CAAAAA	2	12	1368727	1368738	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017108	TTGGGG	2	12	1369261	1369272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017108	TTTTTG	2	12	1462475	1462486	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017108	CTCGCC	2	12	1538137	1538148	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017108	TTTGAT	2	12	1728455	1728466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017108	CTCGCC	2	12	1731220	1731231	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017108	CCGAAA	2	12	1803471	1803482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017108	TTTTTA	2	12	1835324	1835335	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017108	GAGCCC	2	12	1844709	1844720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017108	CGGTTC	2	12	1850219	1850230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017108	TATGGA	2	12	1917350	1917361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017108	CGATCC	2	12	1919794	1919805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017108	GATGCC	2	12	1919843	1919854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017108	TGAAGA	2	12	1922523	1922534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017108	AGCTAT	2	12	1931648	1931659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017108	GTTTTT	2	12	1982438	1982449	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017108	ATCACG	2	12	2016483	2016494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017108	TATTTT	2	12	2026449	2026460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017108	TGATCA	2	12	2030566	2030577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017108	CTACGC	2	12	2094612	2094623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017108	AACCCT	2	12	2223651	2223662	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017108	AATATA	2	12	2253601	2253612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017108	CTCGCC	2	12	2283409	2283420	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017108	TGCGGT	2	12	2309160	2309171	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017108	GAAAAA	2	12	2349851	2349862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017108	ATCCTT	2	12	2410343	2410354	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017108	TCGTTA	2	12	2415180	2415191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017108	AAAATA	2	12	2426026	2426037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017108	AATTGG	2	12	2478153	2478164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017108	GCGCCA	2	12	2501731	2501742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017108	CAGAAA	2	12	2538132	2538143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017108	AGCTTC	2	12	2586423	2586434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017108	ACGTCA	2	12	2605320	2605331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017108	CTCGCC	2	12	2607838	2607849	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017108	ACCTGC	2	12	2642993	2643004	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017108	CCGGAT	2	12	2674764	2674775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017108	TCGCTG	2	12	2698193	2698204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017108	GCTTGC	2	12	2698339	2698350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017108	CTCGCC	2	12	2762883	2762894	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017108	TCTTAC	2	12	2783782	2783793	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017108	ATTTTA	2	12	2785896	2785907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017108	CTTTTT	2	12	2802886	2802897	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017108	GCTTCT	2	12	2840927	2840938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017108	TCCTTT	2	12	2865723	2865734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.