MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017105	ACAG	2	8	978	985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017105	ACAG	2	8	6590	6597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017105	TTCC	2	8	6742	6749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017105	GGAA	2	8	6753	6760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017105	CTCA	2	8	9447	9454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017105	CTGT	2	8	10675	10682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017105	TCTG	2	8	12061	12068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017105	CTTC	2	8	12940	12947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017105	TTCC	2	8	18167	18174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017105	TTTA	2	8	22468	22475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017105	TTCC	2	8	22817	22824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017105	GTCA	2	8	37054	37061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017105	GAAA	2	8	46053	46060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017105	CATC	2	8	46129	46136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017105	GTGA	2	8	46522	46529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017105	GACA	2	8	52454	52461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017105	TACG	2	8	54136	54143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017105	GGCG	2	8	54166	54173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017105	AAAG	2	8	54180	54187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017105	GTCG	2	8	54287	54294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017105	GTCC	2	8	58089	58096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017105	TGGA	2	8	67093	67100	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017105	CGGA	2	8	67608	67615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017105	GTCC	2	8	67848	67855	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017105	GACG	2	8	70121	70128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017105	AATG	2	8	71054	71061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017105	ACGG	2	8	75213	75220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017105	GGCA	2	8	76464	76471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017105	TAGT	2	8	76813	76820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017105	AAAG	2	8	76911	76918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017105	ACGA	2	8	77083	77090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017105	GCTG	2	8	77300	77307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017105	GAGC	2	8	77570	77577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017105	CCAG	2	8	83639	83646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017105	CGGG	2	8	83666	83673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017105	ACAG	2	8	87394	87401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017105	ACCT	2	8	87604	87611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017105	CTGT	2	8	88956	88963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017105	TTCT	2	8	98197	98204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017105	GCGG	2	8	98407	98414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017105	GTGG	2	8	98472	98479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017105	CTGT	2	8	105462	105469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017105	ACGG	2	8	108597	108604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017105	GTGA	2	8	110842	110849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017105	CTGT	2	8	112622	112629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017105	GCGG	2	8	119419	119426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017105	AAAT	2	8	136703	136710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017105	TGAG	2	8	137548	137555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017105	AATC	2	8	137557	137564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017105	GTAT	2	8	139361	139368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017105	ATAA	2	8	139544	139551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017105	GGGC	2	8	139970	139977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017105	ATTC	2	8	142555	142562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017105	TCGC	2	8	148984	148991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017105	CGTC	2	8	149563	149570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017105	AAGG	2	8	149596	149603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017105	GCGA	2	8	151137	151144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017105	CCGC	2	8	154171	154178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017105	CTGG	2	8	154201	154208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017105	ACAG	2	8	157061	157068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017105	TAAA	2	8	159770	159777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017105	GCCC	2	8	163350	163357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017105	GTGG	2	8	168669	168676	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017105	ACCA	2	8	168746	168753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017105	AATG	2	8	169447	169454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017105	ATCA	2	8	170151	170158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017105	TCAT	2	8	170307	170314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017105	ATGC	2	8	171578	171585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017105	AATG	2	8	171703	171710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017105	CTCA	2	8	176331	176338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017105	TGGA	2	8	176605	176612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017105	CATT	2	8	177094	177101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017105	TGAG	2	8	177368	177375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017105	GAAA	2	8	177392	177399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017105	TGGC	2	8	179787	179794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017105	GCAC	2	8	179914	179921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017105	GAAG	2	8	180091	180098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017105	CTGT	2	8	180699	180706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017105	GACG	2	8	180803	180810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017105	GGTC	2	8	181073	181080	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017105	GTGA	2	8	181431	181438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017105	GCGT	2	8	182111	182118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017105	CATC	2	8	182592	182599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017105	AGCG	2	8	182707	182714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017105	CTTC	2	8	182857	182864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.