MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	AGA	2	6	133	138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017104	ATG	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017104	GGT	2	6	1395	1400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017104	TCC	2	6	1406	1411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017104	AGA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017104	TGA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017104	CCT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017104	CGA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017104	AAG	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017104	AGC	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017104	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017104	CGG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017104	TCA	2	6	5209	5214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017104	TCG	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017104	CTT	2	6	7753	7758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017104	GAC	2	6	7905	7910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017104	ATC	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017104	TTA	2	6	8064	8069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017104	AAT	2	6	8102	8107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017104	TTA	2	6	8134	8139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017104	ATT	2	6	8260	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017104	ACT	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017104	TCA	2	6	8292	8297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017104	CTT	2	6	8983	8988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017104	CAG	2	6	13407	13412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017104	ATG	2	6	13415	13420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017104	GAT	2	6	13430	13435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017104	GGT	2	6	13490	13495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017104	GCT	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017104	CCA	2	6	13835	13840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017104	CCT	2	6	13907	13912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017104	CCT	2	6	13919	13924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017104	GCC	2	6	13962	13967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017104	CCG	2	6	13983	13988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017104	CCT	2	6	13999	14004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017104	CAA	2	6	14098	14103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017104	ACC	2	6	14105	14110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017104	GCC	2	6	14125	14130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017104	CCA	2	6	15789	15794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017104	CGC	2	6	15839	15844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017104	ACG	2	6	15952	15957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017104	CCA	2	6	16009	16014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017104	GAC	2	6	16464	16469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017104	AGG	2	6	16483	16488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017104	GAC	2	6	16527	16532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017104	TTC	2	6	16571	16576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017104	GCT	2	6	18049	18054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017104	CAG	2	6	18075	18080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017104	CAA	2	6	18238	18243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017104	CTG	2	6	18325	18330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017104	ATC	2	6	18418	18423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017104	GGC	2	6	18870	18875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017104	TGG	2	6	18921	18926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017104	TGA	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017104	GAT	2	6	20453	20458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017104	TTC	2	6	20520	20525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017104	GCG	2	6	20543	20548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017104	GAG	2	6	21064	21069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017104	GTT	2	6	22212	22217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017104	ATG	2	6	25709	25714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017104	ACC	2	6	25850	25855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017104	TAT	2	6	25872	25877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017104	CGC	2	6	26042	26047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017104	GCC	2	6	26074	26079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017104	GGC	2	6	26088	26093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017104	AAT	2	6	28147	28152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017104	CCA	2	6	28162	28167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017104	ACC	2	6	28178	28183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017104	TTG	2	6	28201	28206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017104	TTA	2	6	28213	28218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017104	GAA	2	6	28292	28297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017104	CAT	2	6	28379	28384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017104	AGG	2	6	28414	28419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017104	CAT	2	6	28420	28425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017104	GGT	2	6	28472	28477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017104	ATT	2	6	28502	28507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017104	ATC	2	6	28596	28601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017104	CCA	2	6	30030	30035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017104	CGC	2	6	30080	30085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017104	TGA	2	6	30200	30205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017104	CAA	2	6	30879	30884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017104	ATA	2	6	30992	30997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017104	TAA	2	6	31004	31009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017104	TGC	2	6	31019	31024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017104	GTT	2	6	32148	32153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017104	GTG	2	6	32263	32268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017104	AGA	2	6	34619	34624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017104	TGA	2	6	37392	37397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017104	ACG	2	6	37424	37429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017104	TCC	2	6	37436	37441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017104	CGC	2	6	37447	37452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017104	GAA	2	6	37456	37461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017104	CGG	2	6	37532	37537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017104	TGA	2	6	38422	38427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017104	GCG	2	6	38743	38748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017104	TAT	2	6	38849	38854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017104	CCG	2	6	38899	38904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017104	CGT	2	6	39033	39038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017104	TCG	2	6	39059	39064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017104	TGA	2	6	39074	39079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017104	ATC	2	6	40578	40583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017104	CCA	2	6	42012	42017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017104	CGC	2	6	42062	42067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017104	ATC	2	6	42247	42252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017104	CCA	2	6	43681	43686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017104	CGC	2	6	43731	43736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017104	GAT	2	6	43854	43859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017104	CGG	2	6	43874	43879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017104	CAG	2	6	43921	43926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017104	ATG	2	6	43927	43932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017104	CCA	2	6	44617	44622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017104	GAA	2	6	44638	44643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017104	GCA	2	6	44717	44722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017104	TAT	2	6	44856	44861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017104	AGG	2	6	44886	44891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017104	AGA	2	6	44905	44910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017104	GAC	2	6	45601	45606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017104	CTA	2	6	45611	45616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017104	TAA	2	6	45630	45635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017104	GAT	2	6	48310	48315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017104	GAT	2	6	48324	48329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017104	TGA	2	6	48491	48496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017104	CAT	2	6	48504	48509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017104	TGA	2	6	48516	48521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017104	GAC	2	6	49548	49553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017104	TCG	2	6	49619	49624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017104	AGC	2	6	51030	51035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017104	GCA	2	6	51148	51153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017104	CTT	2	6	53173	53178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017104	TCA	2	6	53339	53344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017104	CGT	2	6	53352	53357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017104	CCT	2	6	53367	53372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017104	CGG	2	6	53384	53389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017104	ATT	2	6	61280	61285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017104	TGC	2	6	61359	61364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017104	AGA	2	6	61421	61426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017104	GCG	2	6	61485	61490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017104	ATT	2	6	62779	62784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017104	AAG	2	6	62801	62806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017104	AAT	2	6	62810	62815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.