MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinoplanes missouriensis 431

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017093	TTGGGT	2	12	172080	172091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017093	CGGGCG	2	12	228363	228374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017093	GTCCGC	2	12	340117	340128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017093	GCGCCA	2	12	362439	362450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017093	GCTCGC	2	12	369974	369985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017093	GTGGCG	2	12	418210	418221	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017093	GGGATC	2	12	418425	418436	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017093	CGGTTC	2	12	424973	424984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017093	CCTACC	2	12	430475	430486	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017093	CCCGCC	2	12	453740	453751	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_017093	CCCGCC	2	12	453774	453785	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
12	NC_017093	TTGGGT	2	12	499409	499420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017093	GTTCGT	2	12	515217	515228	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017093	ATTAGT	2	12	537285	537296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017093	CGGCCC	2	12	555343	555354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017093	GGAAAA	2	12	576618	576629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017093	GACGGC	2	12	586582	586593	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017093	GGGGGT	2	12	633819	633830	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017093	CAGCGA	2	12	684492	684503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017093	ACGGTG	2	12	688905	688916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017093	AGCCCG	2	12	767924	767935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017093	GGCCGG	2	12	805699	805710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017093	CCTCAA	2	12	829341	829352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017093	CGAGCC	3	18	830856	830873	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017093	ACGCCG	2	12	843608	843619	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017093	GTCGCT	2	12	845993	846004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017093	TGCACG	2	12	858244	858255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017093	CTTAAA	2	12	873355	873366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017093	CCCTCG	2	12	893672	893683	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017093	CTGCGT	2	12	895910	895921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017093	GCCGGC	2	12	931407	931418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017093	GCTACG	3	18	931645	931662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017093	GGCTGC	2	12	931686	931697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017093	GAGGCA	2	12	939920	939931	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017093	CGCCCG	2	12	944726	944737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017093	CGCCCG	2	12	944789	944800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017093	CTCGGT	2	12	977157	977168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017093	CCACCC	2	12	982806	982817	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
39	NC_017093	TCGGGT	2	12	993290	993301	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017093	GTCCCG	2	12	1013507	1013518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017093	CGGGCA	2	12	1023903	1023914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017093	CCGGGA	2	12	1083283	1083294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017093	TCCCGG	2	12	1102259	1102270	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017093	CCCCGT	2	12	1105683	1105694	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017093	GCCCGA	2	12	1129592	1129603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017093	GTTCGG	2	12	1134883	1134894	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017093	GGCCGG	2	12	1141495	1141506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017093	GACTTC	2	12	1172736	1172747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017093	TTGGGT	2	12	1201482	1201493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017093	CGGCGC	2	12	1244930	1244941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017093	GTCGGA	2	12	1247203	1247214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017093	GCCGGT	2	12	1249828	1249839	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017093	GCGCCC	2	12	1296257	1296268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017093	ACGGCA	2	12	1398416	1398427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017093	GGCACG	3	18	1424467	1424484	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017093	GCTGGT	5	30	1434852	1434881	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017093	GCTGGA	2	12	1435812	1435823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017093	GGCTGG	2	12	1435829	1435840	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017093	GAGCCG	2	12	1438834	1438845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017093	GTGGAG	2	12	1467460	1467471	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017093	ATGCGG	2	12	1483726	1483737	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017093	CGTTCG	2	12	1508083	1508094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017093	GGCTGG	2	12	1543189	1543200	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017093	GTCCAG	2	12	1559892	1559903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017093	GGATGG	2	12	1605677	1605688	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017093	CGTTCC	2	12	1623634	1623645	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017093	TGGCGC	2	12	1623801	1623812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017093	TGATCG	2	12	1627038	1627049	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017093	CCGCTC	2	12	1629767	1629778	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017093	GGAAGG	2	12	1639783	1639794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017093	TGCACG	2	12	1652586	1652597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017093	GGGCGG	2	12	1682971	1682982	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017093	GCCCGG	2	12	1687667	1687678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017093	ACCGGT	2	12	1712371	1712382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017093	CCGGGC	2	12	1718664	1718675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017093	GTGAGA	2	12	1724231	1724242	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017093	GGCGAC	2	12	1739237	1739248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017093	CCGAAC	2	12	1753342	1753353	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017093	GGCGGG	2	12	1753656	1753667	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017093	GGCCGG	2	12	1807347	1807358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017093	GGCCGG	2	12	1824567	1824578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017093	CGGTGG	2	12	1882705	1882716	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017093	CGGTTG	2	12	1935411	1935422	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017093	CCGGCG	2	12	2067152	2067163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017093	GCGACT	2	12	2072787	2072798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017093	TGCACC	2	12	2072833	2072844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017093	AAACGC	2	12	2169870	2169881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017093	GTTGCC	2	12	2271844	2271855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017093	GCGCCC	2	12	2347183	2347194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017093	AGCCGT	2	12	2383728	2383739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017093	ACCGGC	2	12	2434312	2434323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017093	TGCCGC	2	12	2434415	2434426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017093	GTTGCT	2	12	2445094	2445105	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017093	CAATCC	2	12	2499464	2499475	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017093	GCCGGG	2	12	2599289	2599300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017093	CGGGCG	2	12	2661830	2661841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017093	GCCGCG	2	12	2682593	2682604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017093	GCGATG	2	12	2684494	2684505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017093	TCGCCT	2	12	2702715	2702726	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017093	GGCCCG	2	12	2777084	2777095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017093	CGCCGG	2	12	2783141	2783152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017093	CCCGTC	2	12	2942760	2942771	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017093	GACCCC	2	12	3015621	3015632	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017093	TTTCGG	2	12	3016184	3016195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017093	CCGCAT	2	12	3016315	3016326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017093	GGTAGG	2	12	3016436	3016447	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017093	TCCGCC	2	12	3029129	3029140	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017093	AAGGTG	2	12	3035080	3035091	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017093	CGGCCG	2	12	3035205	3035216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017093	CGACCA	2	12	3038676	3038687	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017093	GCCGTG	2	12	3078268	3078279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017093	CCGCGG	2	12	3110420	3110431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017093	ACGCTG	2	12	3111753	3111764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017093	CGGTGC	2	12	3122485	3122496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017093	CGGGTC	2	12	3183890	3183901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017093	CGGGGC	2	12	3197413	3197424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017093	CTGACG	2	12	3201680	3201691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017093	CCGCCC	2	12	3276357	3276368	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
119	NC_017093	TGCGCG	2	12	3287184	3287195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017093	GCGCAC	2	12	3294403	3294414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017093	CCGGCC	2	12	3303801	3303812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017093	GACGGC	2	12	3348261	3348272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017093	CGCGGC	2	12	3365478	3365489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017093	CCGGCT	2	12	3491658	3491669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017093	GCCGAC	2	12	3525835	3525846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017093	ATCGCC	2	12	3608034	3608045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017093	AGGCGG	2	12	3613868	3613879	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017093	CGGGTC	2	12	3661791	3661802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017093	CCGGCA	2	12	3757709	3757720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017093	CTCGGG	2	12	3804364	3804375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017093	CCGGCG	2	12	3828092	3828103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017093	TTGGGT	2	12	3868383	3868394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017093	ACCGCC	2	12	3870779	3870790	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017093	GCCGGC	2	12	3909448	3909459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017093	CGCCAT	2	12	3960504	3960515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017093	CGGATC	2	12	3999496	3999507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017093	CCCACC	2	12	4008337	4008348	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
138	NC_017093	CAACCG	2	12	4020349	4020360	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017093	TCCCCG	2	12	4021824	4021835	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017093	CGGCTC	3	18	4033276	4033293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017093	GGCCAG	2	12	4033295	4033306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017093	CTAGGG	2	12	4033317	4033328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_017093	CAAGTA	2	12	4035187	4035198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_017093	CCGGAG	2	12	4077460	4077471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017093	ATCGCC	2	12	4082351	4082362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017093	GCGCCG	2	12	4133689	4133700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017093	CGGCGA	2	12	4143455	4143466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017093	GCGACG	4	24	4143469	4143492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017093	CTCCCG	2	12	4174551	4174562	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017093	GGCAGC	2	12	4378440	4378451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017093	TGAGGG	2	12	4381479	4381490	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017093	GCCGGG	2	12	4383915	4383926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017093	GCGGGC	2	12	4392851	4392862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_017093	GATCGC	2	12	4419687	4419698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017093	ACGAGG	2	12	4436110	4436121	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_017093	CCCCGT	2	12	4445690	4445701	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_017093	CCGGGG	2	12	4510007	4510018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017093	CGGGCG	2	12	4515296	4515307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017093	ACCCAA	2	12	4541253	4541264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_017093	CGCCGG	3	18	4558406	4558423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_017093	GGCGCG	3	18	4558573	4558590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017093	CTCGTT	2	12	4572481	4572492	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_017093	CTGCCG	2	12	4741872	4741883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
168	NC_017093	AAGATC	2	12	4745473	4745484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_017093	CGACCT	6	36	4769325	4769360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_017093	CCGGCA	2	12	4789550	4789561	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_017093	CCCGGG	2	12	5100369	5100380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
181	NC_017093	ATGCCG	2	12	5115521	5115532	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_017093	AGCACT	2	12	5115568	5115579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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244	NC_017093	GCCCGC	2	12	6836893	6836904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
245	NC_017093	CGGCAC	2	12	6899829	6899840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
246	NC_017093	CGCCTC	2	12	6941523	6941534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
247	NC_017093	GCCGGC	2	12	6963802	6963813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
248	NC_017093	GTTTCC	2	12	7004550	7004561	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_017093	CAAGAT	2	12	7005883	7005894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_017093	CCCGCA	2	12	7007637	7007648	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_017093	GGCCGG	2	12	7093559	7093570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_017093	GGCACC	2	12	7134874	7134885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
254	NC_017093	GCACCG	2	12	7138289	7138300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
255	NC_017093	CCGGCG	2	12	7138359	7138370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
256	NC_017093	AGTGGA	2	12	7143010	7143021	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017093	AGCGGA	2	12	7143040	7143051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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260	NC_017093	CCACGG	2	12	7199600	7199611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
261	NC_017093	TGTTCG	2	12	7309190	7309201	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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263	NC_017093	CGCCCG	2	12	7345378	7345389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_017093	TACCCG	2	12	7901349	7901360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
280	NC_017093	CAAGGT	2	12	7915235	7915246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.