MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacterium woodii DSM 1030 chromosome

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016894	TTTAAA	2	12	18206	18217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016894	TTTATA	2	12	25009	25020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016894	ATCGAT	2	12	25516	25527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016894	AAGGTT	2	12	77355	77366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016894	ACCTTT	2	12	77612	77623	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016894	ACGGAG	2	12	93377	93388	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016894	ACGGAG	2	12	93591	93602	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016894	CATTAA	2	12	104182	104193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016894	ATCTTA	2	12	152285	152296	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016894	TAAACA	2	12	161262	161273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016894	ATTTAT	2	12	162458	162469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016894	GTCAAC	2	12	168791	168802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016894	TTGAAA	2	12	220360	220371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016894	AATTAT	2	12	267838	267849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016894	AAAAAT	2	12	273297	273308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016894	TTTGAC	2	12	318426	318437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016894	ATGCCT	2	12	353039	353050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016894	TTTTTA	2	12	357492	357503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016894	TTTAAA	2	12	381104	381115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016894	CATAAA	2	12	448942	448953	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016894	TTAATT	2	12	480698	480709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016894	ATAAAA	2	12	499368	499379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016894	TTTTTA	2	12	503881	503892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016894	TTTTAT	2	12	519982	519993	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016894	TAAATA	2	12	537986	537997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016894	TCAGAA	2	12	580392	580403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016894	AAAGGG	2	12	588997	589008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016894	TTAAGT	2	12	591567	591578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016894	AATAAA	2	12	631414	631425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016894	TTAATG	2	12	642728	642739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016894	AATTAA	2	12	665285	665296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016894	TGACAA	2	12	695697	695708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016894	AAATAT	2	12	703889	703900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016894	TTTTTA	2	12	718593	718604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016894	AAAAAT	2	12	725856	725867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016894	AAAAAT	2	12	728939	728950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016894	TCATGG	2	12	746420	746431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016894	TCTTTG	2	12	754172	754183	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016894	CTAAAA	2	12	771967	771978	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016894	GAGAAT	2	12	801507	801518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016894	TTAATT	2	12	834534	834545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016894	ATAAAA	2	12	876620	876631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016894	ATAAAA	2	12	891035	891046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016894	ATGAAA	2	12	930312	930323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016894	TATCAT	2	12	980900	980911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016894	TGATTC	2	12	995996	996007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016894	TATATT	2	12	1032706	1032717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016894	AATGAT	2	12	1067749	1067760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016894	TAATTT	2	12	1080162	1080173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016894	GAACAA	2	12	1080546	1080557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016894	ATAAAT	2	12	1080749	1080760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016894	GAAAAA	2	12	1130601	1130612	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016894	AAATAA	2	12	1139209	1139220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016894	AAGAAA	2	12	1144444	1144455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016894	ATCAAA	3	18	1157915	1157932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016894	TGATAA	2	12	1162777	1162788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016894	CAAAAG	2	12	1167836	1167847	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016894	ATCGGG	2	12	1167850	1167861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016894	TTAATT	2	12	1167960	1167971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016894	TTATCT	2	12	1177675	1177686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016894	AATATA	2	12	1189134	1189145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016894	GAATCC	2	12	1201665	1201676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016894	TAAAAA	2	12	1211916	1211927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016894	ATTTAA	2	12	1226520	1226531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016894	AGAAAA	2	12	1286582	1286593	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016894	TCATGG	2	12	1296236	1296247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016894	AAATTA	2	12	1328619	1328630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016894	TGCTTG	2	12	1342537	1342548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016894	AATGAA	2	12	1357680	1357691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016894	ATTTCA	2	12	1368496	1368507	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016894	GATTTC	2	12	1401108	1401119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016894	TTCGAA	2	12	1401189	1401200	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016894	TTTAGT	2	12	1401333	1401344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016894	CAAATG	2	12	1402084	1402095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016894	TAAAAT	2	12	1403095	1403106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016894	AGACGA	2	12	1407397	1407408	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016894	GAATTT	2	12	1411054	1411065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016894	GAATTG	2	12	1428741	1428752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016894	ATTTGG	2	12	1428776	1428787	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016894	TGAGCA	2	12	1428798	1428809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016894	GAAAAT	2	12	1475443	1475454	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016894	TAGTTT	2	12	1490937	1490948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016894	TAAAAA	2	12	1567005	1567016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016894	AAATAA	2	12	1568058	1568069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016894	TACGCA	2	12	1602995	1603006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016894	CAAAAA	2	12	1677952	1677963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016894	GATAAA	2	12	1708554	1708565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016894	TAAAAA	2	12	1712500	1712511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016894	ATTTTA	2	12	1728134	1728145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016894	TTTTAA	2	12	1753235	1753246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016894	AAAATA	2	12	1767920	1767931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016894	TAAATT	2	12	1773765	1773776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016894	TAATTG	2	12	1789743	1789754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016894	GAAAAA	2	12	1790314	1790325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016894	ATTGAT	2	12	1796681	1796692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016894	ATTGTG	2	12	1806555	1806566	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016894	AATTAA	2	12	1850207	1850218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016894	TAGTGT	2	12	1878877	1878888	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016894	CTAATT	2	12	1932110	1932121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016894	CTAATT	2	12	1932292	1932303	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016894	TAAAAA	2	12	1948290	1948301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016894	ATATAA	2	12	1960892	1960903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016894	CAGATT	2	12	2025047	2025058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016894	AATTGA	2	12	2036356	2036367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016894	TCATTT	2	12	2058149	2058160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016894	TAAAAA	2	12	2061542	2061553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016894	GATTAT	2	12	2078118	2078129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016894	CTTATA	2	12	2103964	2103975	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016894	ATTTTT	2	12	2116075	2116086	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016894	AATGGT	2	12	2121712	2121723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016894	ATATTT	2	12	2163744	2163755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016894	AATAAA	2	12	2173130	2173141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016894	TTTCAT	2	12	2179612	2179623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016894	TTTAAA	2	12	2231118	2231129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016894	CTTTTT	2	12	2245511	2245522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016894	GAATAA	2	12	2292478	2292489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016894	ATATTT	2	12	2294760	2294771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016894	CTATTT	2	12	2339788	2339799	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016894	TTCATT	2	12	2351913	2351924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016894	AAATTA	2	12	2354513	2354524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016894	TAAAAT	2	12	2386240	2386251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016894	TTTTTA	2	12	2401228	2401239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016894	ATAACC	2	12	2401250	2401261	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016894	TAAAAC	2	12	2443974	2443985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016894	TAAATT	2	12	2454282	2454293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016894	TAATTT	2	12	2471845	2471856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016894	TGAAAC	2	12	2491252	2491263	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016894	CCATTT	2	12	2554075	2554086	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016894	TCACTT	2	12	2592094	2592105	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016894	ATCTCA	2	12	2608794	2608805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016894	TCTCTT	2	12	2632727	2632738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016894	CACTTT	2	12	2641189	2641200	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016894	AACCTT	2	12	2655132	2655143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_016894	TTTAAA	2	12	2879177	2879188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016894	AAAATT	2	12	2920597	2920608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_016894	GCTTCT	2	12	3018716	3018727	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.