MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016624	AGAGG	2	10	358	367	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016624	TTGAA	2	10	376	385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016624	ATCCC	2	10	1555	1564	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016624	TTCTC	2	10	11896	11905	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016624	TGGGG	2	10	26576	26585	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016624	GTTCT	2	10	43207	43216	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016624	CGGCG	2	10	53366	53375	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016624	AAACA	2	10	69284	69293	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016624	TCCGC	2	10	73348	73357	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016624	GTCCG	2	10	76882	76891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016624	GAAGG	2	10	80613	80622	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016624	CTCCC	2	10	81345	81354	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13	NC_016624	AAACG	2	10	95170	95179	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016624	CGCGT	2	10	127169	127178	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016624	GAAAA	2	10	142332	142341	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016624	CCCAT	2	10	153482	153491	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_016624	GCAGC	2	10	153601	153610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016624	GGCCG	2	10	159919	159928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016624	CGATC	2	10	160190	160199	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016624	CGCGG	2	10	165680	165689	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016624	AGTAT	2	10	171725	171734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016624	GTCCC	2	10	177032	177041	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_016624	GAGCA	2	10	178182	178191	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016624	TGTAC	2	10	186063	186072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016624	TTTCG	2	10	191974	191983	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016624	CGTTC	2	10	196760	196769	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016624	CGCGG	2	10	198813	198822	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016624	ACAGG	2	10	205958	205967	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016624	GCCCT	2	10	214379	214388	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_016624	CAGGG	2	10	220155	220164	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016624	CGATT	2	10	221436	221445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016624	GCGCC	2	10	240036	240045	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_016624	CGCCA	2	10	246845	246854	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_016624	TGGGG	2	10	254614	254623	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016624	GCACC	2	10	258968	258977	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_016624	CTGCG	2	10	275977	275986	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016624	CGTTT	2	10	294603	294612	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016624	GCCCC	2	10	295208	295217	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
39	NC_016624	TTTTA	2	10	298679	298688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016624	CATCC	2	10	305666	305675	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_016624	CATCC	2	10	305680	305689	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_016624	GCATC	2	10	305693	305702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016624	GATCG	2	10	312766	312775	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016624	TCCCG	2	10	328148	328157	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_016624	AAATT	2	10	340988	340997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016624	TCCGG	2	10	343181	343190	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016624	GCCCC	2	10	349403	349412	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_016624	CTCCC	2	10	357086	357095	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
49	NC_016624	GGGGA	2	10	374861	374870	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016624	CGATG	2	10	398972	398981	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016624	CCCCA	2	10	402187	402196	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_016624	TCCCC	2	10	402255	402264	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_016624	CAGGT	2	10	418012	418021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016624	AAGCC	2	10	436599	436608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016624	GTCGA	2	10	436873	436882	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016624	TGCGT	2	10	444503	444512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016624	TCCTC	2	10	448920	448929	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016624	ACTTA	2	10	456395	456404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016624	AAACG	2	10	461965	461974	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016624	CCGGC	2	10	463535	463544	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_016624	TCGTG	2	10	475597	475606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016624	ACGGG	2	10	476485	476494	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016624	AATCA	2	10	477441	477450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.