MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016622	GGGCGT	2	12	13777	13788	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016622	CTTCCA	2	12	34521	34532	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016622	ATGGCG	2	12	40829	40840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016622	CATCGT	2	12	53235	53246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016622	GGAAGC	2	12	55326	55337	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016622	CTTTTT	2	12	96124	96135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016622	GGGTCC	2	12	128380	128391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016622	CGGAGA	2	12	136829	136840	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016622	AAAAAG	2	12	194432	194443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016622	CCCGGA	2	12	201221	201232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016622	GGCATC	2	12	222488	222499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016622	CCCCGG	2	12	226872	226883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016622	CGGAAA	2	12	228277	228288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016622	TCTCCC	2	12	248882	248893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016622	CGGAAA	2	12	268858	268869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016622	AGCCTC	2	12	270100	270111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016622	CGTTGC	3	18	301047	301064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016622	TCCGGG	2	12	319188	319199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016622	GAAGCG	2	12	333966	333977	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016622	GAAAAG	2	12	370450	370461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016622	TCGAAC	2	12	392501	392512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016622	CGCGTA	2	12	416449	416460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016622	CGCGTC	2	12	436042	436053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016622	GCGCGG	2	12	468916	468927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016622	CCGAAG	2	12	560966	560977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016622	GGCCGC	2	12	564503	564514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016622	GGGGGA	2	12	565121	565132	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016622	CCCGTC	2	12	570179	570190	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016622	TCCCTC	2	12	585203	585214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016622	CAAAGC	2	12	594500	594511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016622	GCAGGG	2	12	631428	631439	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016622	AAGGGC	2	12	681734	681745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016622	GCTTGC	2	12	766714	766725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016622	CTGTCC	2	12	771023	771034	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016622	CGCAAA	2	12	787372	787383	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016622	CGTCTG	2	12	824648	824659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016622	ACCGGG	2	12	861088	861099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016622	GCCGTC	2	12	1021600	1021611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016622	GGGGCC	2	12	1061760	1061771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016622	GAGGGA	2	12	1072205	1072216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016622	GTCGCC	2	12	1073746	1073757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016622	ATTTCA	2	12	1087647	1087658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016622	AACGGC	2	12	1101026	1101037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016622	GGGGGT	2	12	1169067	1169078	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016622	CGTTTT	2	12	1170128	1170139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016622	TCGCCG	2	12	1190513	1190524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016622	CGGGTC	2	12	1212745	1212756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016622	CGGGGC	2	12	1263042	1263053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016622	ATCCGC	2	12	1288944	1288955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016622	CCGGCC	2	12	1331153	1331164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016622	CGCCTT	2	12	1344626	1344637	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016622	TGAGCG	2	12	1360955	1360966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016622	TGGGGA	2	12	1382834	1382845	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016622	TCTCAG	2	12	1422746	1422757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016622	ACCAAA	2	12	1423267	1423278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016622	AAAAGG	2	12	1423937	1423948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016622	CCCCCT	2	12	1453455	1453466	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_016622	TCCCCC	2	12	1502645	1502656	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_016622	ACCGGA	2	12	1503053	1503064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016622	CTTTTG	2	12	1515057	1515068	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016622	CGGACG	2	12	1518669	1518680	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016622	TTACGT	2	12	1522075	1522086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016622	GCGGCC	2	12	1569345	1569356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016622	TCTCTT	2	12	1647450	1647461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016622	GACCGG	2	12	1688305	1688316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016622	CGGTTC	2	12	1766452	1766463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016622	CAAATG	2	12	1783950	1783961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016622	ATCGCC	2	12	1831988	1831999	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016622	CTTCCG	2	12	1845543	1845554	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016622	CGGGCG	2	12	1850454	1850465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016622	GGTCGA	2	12	1878162	1878173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016622	TCGCCG	2	12	1880386	1880397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016622	GCCCCG	2	12	1897689	1897700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016622	GGTGGA	2	12	1900515	1900526	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016622	GCCGGG	2	12	1901923	1901934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016622	ATGGCG	2	12	1902812	1902823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016622	GGCGAG	2	12	1908613	1908624	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016622	TATTCT	2	12	1921997	1922008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016622	CGAAAC	2	12	1930647	1930658	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016622	AGCAGG	2	12	1958755	1958766	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016622	CGGCGC	2	12	1962246	1962257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016622	GGGCGA	2	12	1962533	1962544	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016622	GCGGCA	2	12	1963282	1963293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016622	CGGTCG	2	12	1971173	1971184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016622	CGAAAG	2	12	2029790	2029801	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016622	GGGAAC	2	12	2084789	2084800	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016622	CAAAGC	2	12	2090062	2090073	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016622	GCGTCG	2	12	2102076	2102087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016622	CGCAAA	2	12	2113527	2113538	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016622	GTCGCG	2	12	2133178	2133189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016622	GTCGCT	2	12	2147271	2147282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016622	CGGTAT	2	12	2160857	2160868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016622	TTCCCC	2	12	2174075	2174086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016622	AGCGCC	2	12	2175835	2175846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016622	ATTTTT	2	12	2243048	2243059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016622	CGAAGG	2	12	2245841	2245852	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016622	CGGTCG	2	12	2260024	2260035	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016622	ATCGCG	2	12	2260071	2260082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016622	TTCCGC	2	12	2348789	2348800	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016622	GCTCCC	2	12	2364045	2364056	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016622	CCATGC	2	12	2394742	2394753	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016622	CCCCTC	2	12	2420137	2420148	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_016622	CCGGGT	2	12	2421786	2421797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016622	TCCCCC	2	12	2424865	2424876	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_016622	CGATGA	2	12	2431791	2431802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016622	CGCCCC	2	12	2529170	2529181	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_016622	GGATCG	2	12	2544647	2544658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016622	ATGACG	2	12	2554285	2554296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016622	CGAATG	2	12	2561945	2561956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016622	TTCCAG	2	12	2570860	2570871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016622	CGCTCC	2	12	2579999	2580010	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016622	CGGCCG	2	12	2592917	2592928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016622	ACGGTC	2	12	2612480	2612491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016622	GCCGCT	2	12	2623053	2623064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016622	TGACGT	2	12	2627588	2627599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016622	ATCCTG	2	12	2636719	2636730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016622	TTCCGT	2	12	2656766	2656777	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016622	GGGGAC	2	12	2667662	2667673	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016622	TCTCCC	2	12	2678129	2678140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016622	CGGCTG	2	12	2723073	2723084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016622	AGGCGG	2	12	2723089	2723100	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016622	GGCGGA	2	12	2723261	2723272	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016622	TCCCGA	2	12	2740537	2740548	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016622	CCCCCG	2	12	2760940	2760951	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
125	NC_016622	GACCGC	2	12	2764997	2765008	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016622	GCCGCT	2	12	2765629	2765640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016622	CGCCAT	2	12	2765764	2765775	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016622	CGCTGG	2	12	2766081	2766092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016622	GCTGGA	2	12	2767108	2767119	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016622	TCCCGC	2	12	2784284	2784295	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016622	GAACCC	2	12	2883881	2883892	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016622	TCCGGG	2	12	2949438	2949449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016622	TGTCAG	2	12	2950626	2950637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.