MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	GCC	2	6	762	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016619	CTG	2	6	779	784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016619	GCC	2	6	812	817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016619	CAC	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016619	TCC	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016619	AGG	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016619	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016619	ATG	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016619	AGC	3	9	2161	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016619	AGA	2	6	6601	6606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016619	GTG	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016619	GCG	2	6	10658	10663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016619	GCA	2	6	10671	10676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016619	GCC	2	6	13293	13298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016619	CTC	2	6	18277	18282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016619	CGG	2	6	18293	18298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016619	AGA	2	6	18393	18398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016619	GTG	2	6	19076	19081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016619	GAG	2	6	19120	19125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016619	CAT	2	6	19154	19159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016619	TCT	2	6	19179	19184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016619	GAT	2	6	19188	19193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016619	CCA	2	6	20357	20362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016619	GGC	2	6	20420	20425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016619	CCA	2	6	21054	21059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016619	CAT	2	6	23682	23687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016619	ATC	2	6	23727	23732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016619	ATG	2	6	23741	23746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016619	TCC	2	6	23770	23775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016619	GGC	2	6	23794	23799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016619	GCG	2	6	23831	23836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016619	GAG	2	6	23842	23847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016619	GTT	3	9	24299	24307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016619	GTT	2	6	24407	24412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016619	TCC	2	6	27887	27892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016619	TTC	2	6	28731	28736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016619	GCC	2	6	28763	28768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016619	GCC	2	6	28778	28783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016619	GAC	2	6	28814	28819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016619	GTC	2	6	28839	28844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016619	GGC	2	6	28864	28869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016619	GAC	2	6	33190	33195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016619	AAT	2	6	33930	33935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016619	GAT	2	6	33939	33944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016619	CGC	2	6	34790	34795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016619	CAG	2	6	34941	34946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016619	GCT	2	6	35049	35054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016619	CAG	2	6	35071	35076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016619	GGA	2	6	35288	35293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016619	TGT	2	6	36348	36353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016619	AGG	2	6	36484	36489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016619	GCT	2	6	38363	38368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016619	CAT	2	6	38799	38804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016619	CAG	2	6	40046	40051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016619	GGC	2	6	40079	40084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016619	AGC	2	6	40085	40090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016619	TGT	2	6	41101	41106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016619	TGA	2	6	41131	41136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016619	CGC	2	6	41147	41152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016619	GAT	2	6	41291	41296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016619	TGC	2	6	41363	41368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016619	TGA	2	6	41717	41722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016619	CCG	2	6	41739	41744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016619	AGC	2	6	41868	41873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016619	CTT	2	6	41901	41906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016619	GCG	2	6	42095	42100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016619	TGC	2	6	42332	42337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016619	CAA	2	6	42449	42454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016619	TGT	2	6	42474	42479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016619	AGC	2	6	42483	42488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016619	ATC	2	6	42600	42605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016619	TGT	2	6	42642	42647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016619	CTG	2	6	42669	42674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016619	GCA	2	6	42789	42794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016619	ACA	2	6	42860	42865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016619	CTG	2	6	42896	42901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016619	GCA	2	6	42921	42926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016619	TGG	2	6	42930	42935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016619	ATA	2	6	42965	42970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016619	CCG	2	6	43085	43090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016619	TGG	2	6	43158	43163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016619	CCT	2	6	43759	43764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016619	CAG	2	6	43811	43816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016619	TAT	2	6	43963	43968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016619	CAT	2	6	43971	43976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016619	GTT	2	6	44087	44092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016619	GCG	2	6	44219	44224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016619	AAT	2	6	44276	44281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016619	CAT	2	6	44299	44304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016619	GCA	2	6	44381	44386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016619	TCC	2	6	44390	44395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016619	ACC	2	6	44718	44723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016619	ATA	2	6	44775	44780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016619	GAA	2	6	44803	44808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016619	GAT	2	6	45086	45091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016619	CCA	2	6	45115	45120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016619	CGC	2	6	45685	45690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_016619	TCA	2	6	45744	45749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016619	CGG	2	6	45790	45795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016619	CCG	2	6	48192	48197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016619	CCG	2	6	48251	48256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016619	GGA	2	6	48307	48312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016619	CCA	2	6	48321	48326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016619	CCG	2	6	48370	48375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016619	CCG	2	6	48407	48412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016619	CGC	2	6	48475	48480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016619	GAC	2	6	48551	48556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016619	GGA	2	6	48601	48606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016619	CGA	2	6	48720	48725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016619	GAG	2	6	48769	48774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016619	TGG	2	6	48785	48790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016619	CGC	2	6	48843	48848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016619	CGG	2	6	48856	48861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016619	GAC	2	6	48919	48924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016619	GGA	2	6	48969	48974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016619	TGG	2	6	49038	49043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016619	GTG	2	6	49111	49116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016619	GCG	3	9	49119	49127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016619	GCC	2	6	49158	49163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016619	CCG	2	6	50457	50462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016619	GCC	2	6	50463	50468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016619	CCG	2	6	50485	50490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016619	TGC	2	6	52429	52434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016619	ACC	2	6	52443	52448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016619	CGG	2	6	52508	52513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016619	GAT	2	6	52553	52558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016619	CGG	2	6	52628	52633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016619	CGT	2	6	52729	52734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016619	CCT	2	6	52807	52812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016619	CGC	2	6	52845	52850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016619	GTA	2	6	53575	53580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016619	CGG	2	6	53712	53717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016619	GCA	2	6	53726	53731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016619	AGG	2	6	53892	53897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016619	TGT	2	6	53916	53921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016619	TAA	2	6	54151	54156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016619	CTG	2	6	54490	54495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016619	CGC	2	6	54499	54504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016619	GAG	2	6	54852	54857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016619	TGG	2	6	55403	55408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_016619	CGT	2	6	166904	166909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_016619	CCA	2	6	166941	166946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_016619	ATC	2	6	166983	166988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_016619	ATG	2	6	166998	167003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
413	NC_016619	CCG	2	6	168006	168011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_016619	TGC	2	6	168020	168025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_016619	CGG	2	6	168033	168038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_016619	ATC	2	6	168324	168329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_016619	CAC	2	6	168373	168378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
418	NC_016619	AGA	2	6	168696	168701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
419	NC_016619	GAT	2	6	185588	185593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
420	NC_016619	CGA	2	6	185671	185676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_016619	GTG	2	6	185729	185734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
422	NC_016619	GCC	2	6	186165	186170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_016619	CGC	2	6	186279	186284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_016619	CAT	2	6	191149	191154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_016619	TGC	2	6	191245	191250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_016619	CTT	2	6	191307	191312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_016619	TCT	2	6	191332	191337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_016619	GTC	2	6	191435	191440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_016619	GAC	2	6	191456	191461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_016619	GGC	3	9	191495	191503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_016619	GGA	2	6	191561	191566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
436	NC_016619	CGG	2	6	191581	191586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.