MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p2

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016618	CCCG	2	8	2138	2145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_016618	CCGC	2	8	2342	2349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016618	TCCC	2	8	9450	9457	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016618	GGGA	2	8	9500	9507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016618	CCCA	2	8	15020	15027	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016618	ACAG	2	8	26468	26475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016618	TCCC	2	8	29605	29612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016618	GGAG	2	8	29625	29632	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016618	AGGG	2	8	29667	29674	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016618	GCTG	2	8	31148	31155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016618	GGCC	2	8	31328	31335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016618	GCCC	2	8	31455	31462	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_016618	AAGG	2	8	36179	36186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016618	ACCC	2	8	37977	37984	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016618	CCTT	2	8	41023	41030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016618	TCCT	2	8	41097	41104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016618	GGAA	2	8	52489	52496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016618	CCAC	2	8	55885	55892	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_016618	GGGT	2	8	63381	63388	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016618	GTGG	2	8	63394	63401	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016618	AGGC	2	8	66476	66483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016618	CCGG	2	8	71369	71376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016618	GCGG	2	8	71426	71433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016618	GCCC	2	8	71505	71512	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016618	CGCC	2	8	72132	72139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016618	CAGC	2	8	72247	72254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016618	GGCC	2	8	72273	72280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016618	ACCG	2	8	72581	72588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016618	TCCA	2	8	72620	72627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016618	GGAA	2	8	74657	74664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016618	GCGG	2	8	77354	77361	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016618	CCCG	2	8	77387	77394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_016618	CAAT	2	8	77414	77421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016618	TGGG	2	8	77973	77980	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016618	AGCG	2	8	78585	78592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016618	GGAA	2	8	78866	78873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016618	CGAA	2	8	79038	79045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016618	CCGG	2	8	87145	87152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016618	GGCG	2	8	87184	87191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016618	TCCT	2	8	88643	88650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016618	GAAT	2	8	89331	89338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016618	CGGA	2	8	89385	89392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016618	CGGG	2	8	91360	91367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016618	AATT	2	8	94048	94055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016618	AATC	2	8	94081	94088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016618	GACT	2	8	100641	100648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016618	CCGG	2	8	102591	102598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016618	GCCC	2	8	102654	102661	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016618	GTCC	2	8	102695	102702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016618	CACG	2	8	107300	107307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016618	CGGT	2	8	109151	109158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016618	GCCG	2	8	109477	109484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016618	AAAT	3	12	110948	110959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016618	GCAT	2	8	121874	121881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016618	CGGC	3	12	123488	123499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016618	CGGG	2	8	124307	124314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016618	CTCC	2	8	125743	125750	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_016618	TGCC	2	8	125776	125783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016618	TCAT	2	8	126886	126893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016618	ACGG	2	8	135631	135638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016618	TTGG	2	8	135716	135723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016618	GACG	2	8	136751	136758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016618	AGGA	2	8	138360	138367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016618	GCCG	2	8	140120	140127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016618	CGGT	2	8	140215	140222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016618	TGGC	2	8	140392	140399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016618	TTGT	2	8	147610	147617	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016618	GTTT	2	8	156613	156620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016618	GCCA	2	8	159787	159794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016618	GACG	2	8	162174	162181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016618	CTGC	2	8	166213	166220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016618	AGCA	2	8	169576	169583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016618	TCGG	2	8	171116	171123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016618	TCCC	2	8	178969	178976	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_016618	AGGG	2	8	178991	178998	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016618	AGGG	2	8	187588	187595	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016618	CCCG	2	8	187668	187675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_016618	AGGG	2	8	192073	192080	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016618	CTGG	2	8	192666	192673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016618	CTTC	2	8	193963	193970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016618	CGGC	2	8	198130	198137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016618	GCGT	2	8	199083	199090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016618	CTTT	2	8	199155	199162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016618	GGCC	2	8	199718	199725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016618	CGGG	2	8	201157	201164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016618	CTTT	2	8	201188	201195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016618	GCCC	2	8	201956	201963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_016618	CTTC	2	8	202171	202178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016618	GACG	2	8	207125	207132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016618	CTTC	2	8	209562	209569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016618	CCGG	2	8	223424	223431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016618	CCGA	2	8	248941	248948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016618	CTGG	2	8	249113	249120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016618	GACC	2	8	250234	250241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016618	CCGC	2	8	252133	252140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_016618	GGCC	2	8	252218	252225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016618	TCCC	2	8	253183	253190	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_016618	TCCC	2	8	253196	253203	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_016618	TTTG	2	8	254200	254207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016618	TCGT	2	8	263148	263155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016618	GCCG	2	8	268320	268327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016618	TCGC	2	8	268528	268535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016618	CTGT	2	8	272517	272524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016618	GTTC	2	8	273023	273030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016618	CCCT	2	8	273164	273171	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_016618	CCCA	3	12	273977	273988	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_016618	TCCG	2	8	277471	277478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016618	GACG	2	8	277754	277761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016618	CGGC	2	8	277930	277937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016618	CCAG	2	8	287783	287790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016618	CTTC	2	8	289193	289200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016618	GGGC	2	8	289204	289211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016618	GGGC	2	8	289966	289973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016618	ATGC	2	8	297787	297794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016618	CCGT	2	8	301497	301504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016618	CCCT	2	8	301660	301667	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_016618	CGGG	2	8	308533	308540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016618	GACC	2	8	317962	317969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016618	CGTG	2	8	317981	317988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016618	CAGG	2	8	318288	318295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016618	TTGA	2	8	320438	320445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016618	GGTC	2	8	320456	320463	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016618	GGGA	2	8	321676	321683	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016618	GACG	2	8	328712	328719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016618	TCCC	2	8	330472	330479	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_016618	CGCC	2	8	330518	330525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_016618	TTCC	2	8	332449	332456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016618	GAGG	2	8	335381	335388	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016618	TCGG	2	8	337911	337918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016618	GATC	2	8	339477	339484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016618	TCTT	2	8	339604	339611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016618	GTGC	2	8	344903	344910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016618	TTCC	2	8	344960	344967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016618	AGGC	2	8	345376	345383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016618	GGCA	2	8	347815	347822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016618	CGGT	2	8	347825	347832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016618	CCAT	2	8	348116	348123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016618	GCGG	2	8	353713	353720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016618	CTGC	2	8	356883	356890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016618	GGGC	2	8	367812	367819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016618	GCGG	2	8	367887	367894	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016618	GGGC	2	8	367962	367969	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016618	GCGG	2	8	374255	374262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016618	GACA	2	8	376886	376893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016618	GGCG	2	8	380206	380213	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016618	GCCC	2	8	381176	381183	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_016618	GGGC	2	8	389624	389631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016618	CGCC	2	8	389737	389744	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_016618	CCGA	2	8	389754	389761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016618	AGGC	2	8	392119	392126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016618	CGCC	2	8	392271	392278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_016618	CGGT	2	8	393274	393281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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345	NC_016618	GCCG	2	8	864644	864651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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349	NC_016618	CGCC	2	8	873566	873573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.