MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2 chromosome

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016603	ATAAAA	2	12	11949	11960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016603	TTTATT	2	12	57586	57597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016603	AATTTA	2	12	98817	98828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016603	AAAAGC	2	12	132460	132471	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016603	TTAATT	2	12	163277	163288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016603	TTTATT	2	12	165460	165471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016603	AATTAT	2	12	230199	230210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016603	TAAATA	2	12	233834	233845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016603	AAGTAA	2	12	255782	255793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016603	AAAATA	2	12	271024	271035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016603	AAAATT	2	12	298607	298618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016603	AAAAAT	2	12	308890	308901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016603	TAATTT	2	12	336019	336030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016603	TAAAAA	2	12	338287	338298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016603	ATAAAA	2	12	367207	367218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016603	TTTTTA	2	12	380203	380214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016603	TATTTA	2	12	386824	386835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016603	TGCTTT	2	12	446489	446500	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016603	CATTAA	2	12	457502	457513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016603	AACAAT	2	12	480244	480255	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016603	TTATTT	2	12	506702	506713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016603	ATAAAA	2	12	524475	524486	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016603	AAATTG	2	12	529759	529770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016603	TAAAAA	2	12	535786	535797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016603	TAAAAT	2	12	568511	568522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016603	GTCATT	2	12	580015	580026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016603	TAAAAA	2	12	582253	582264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016603	CCATAA	2	12	608963	608974	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016603	TTTAAA	2	12	700516	700527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016603	TTAAAT	2	12	702094	702105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016603	GATTTT	2	12	717111	717122	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016603	AAAATT	2	12	766560	766571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016603	AATATT	2	12	808794	808805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016603	TAAAAT	2	12	837733	837744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016603	AAACAA	2	12	842900	842911	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016603	TAAAAA	2	12	871685	871696	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016603	ATTTTA	2	12	871951	871962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016603	ATCTGT	2	12	900912	900923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016603	AAATAA	2	12	923580	923591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016603	ATAAAT	2	12	934352	934363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016603	TTTAAA	2	12	938163	938174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016603	TTATAT	2	12	946646	946657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016603	CTTGAG	2	12	957390	957401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016603	AGCTAT	2	12	972086	972097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016603	CAATTT	2	12	979678	979689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016603	TTATAA	2	12	1004058	1004069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016603	TAATAT	2	12	1052190	1052201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016603	ATTGTT	2	12	1062824	1062835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016603	ATTATC	2	12	1068081	1068092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016603	AGTTAA	2	12	1068363	1068374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016603	AAAAAC	2	12	1088590	1088601	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016603	GTTTTT	2	12	1089025	1089036	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016603	TAAATG	2	12	1096574	1096585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016603	TATATG	2	12	1175799	1175810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016603	AATTAA	2	12	1194802	1194813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016603	ACTTAT	2	12	1194865	1194876	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016603	GTTATT	2	12	1207008	1207019	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016603	TAAAAA	2	12	1218041	1218052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016603	TTTAAA	2	12	1223119	1223130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016603	ATCTTC	2	12	1239888	1239899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016603	ATTTTT	2	12	1242909	1242920	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016603	TTATCT	2	12	1246709	1246720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016603	AAATAT	2	12	1246730	1246741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016603	AAGCAA	2	12	1296913	1296924	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016603	TAAATA	2	12	1303532	1303543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016603	TATAAA	2	12	1324987	1324998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016603	ATTTAG	2	12	1353013	1353024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016603	AGTAAA	2	12	1367185	1367196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016603	TCCTTT	2	12	1369002	1369013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016603	GTTTAG	2	12	1377016	1377027	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016603	ATTTTT	2	12	1390889	1390900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016603	ATATTT	2	12	1402300	1402311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016603	TCCTTG	2	12	1437050	1437061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016603	AAAGTA	2	12	1476607	1476618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016603	TAATTT	2	12	1495857	1495868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016603	TTTATT	2	12	1509455	1509466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016603	TTAATT	2	12	1522736	1522747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016603	TTCTCT	2	12	1532563	1532574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016603	TAAAAA	2	12	1543725	1543736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016603	AATTAA	2	12	1547885	1547896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016603	AATAAA	2	12	1600056	1600067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016603	CAATAT	2	12	1614635	1614646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016603	ATTTTA	2	12	1628378	1628389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016603	TTTTTA	2	12	1658751	1658762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016603	ATTTAA	2	12	1664844	1664855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016603	GTAAAA	2	12	1681604	1681615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016603	AAATAT	2	12	1689153	1689164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016603	AATAAA	2	12	1692300	1692311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016603	AAAGAA	2	12	1707571	1707582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016603	AAATAA	2	12	1722844	1722855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016603	AAATTT	2	12	1723467	1723478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016603	TTTTAT	2	12	1758581	1758592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016603	AACATA	2	12	1764405	1764416	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016603	AAGATA	2	12	1765269	1765280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016603	AGTGCA	2	12	1808069	1808080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016603	TTGGCG	2	12	1843237	1843248	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016603	ATATAA	2	12	1857778	1857789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016603	AAAACA	2	12	1898667	1898678	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016603	CAATGT	2	12	1952545	1952556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016603	AATTTC	2	12	2001387	2001398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016603	TCATTT	2	12	2013254	2013265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016603	TATAAA	2	12	2029548	2029559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016603	CTTTTT	2	12	2042155	2042166	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016603	ATAAAT	2	12	2043158	2043169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016603	TCATTT	2	12	2068645	2068656	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016603	ATTTTT	2	12	2073777	2073788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016603	TAAAAA	2	12	2110453	2110464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016603	AAGATT	2	12	2115147	2115158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016603	AAAGTG	2	12	2186447	2186458	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016603	ATATAA	2	12	2198683	2198694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016603	GCTTCT	2	12	2226303	2226314	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016603	AACAAA	2	12	2269199	2269210	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016603	CTATAC	2	12	2343224	2343235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016603	TTATTT	2	12	2360225	2360236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016603	AATAAA	2	12	2365394	2365405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016603	AACCAA	2	12	2395289	2395300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016603	TAAAGA	2	12	2399277	2399288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016603	TGAATA	2	12	2400613	2400624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016603	GAAATA	2	12	2403152	2403163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016603	CTTTAT	2	12	2405239	2405250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016603	AAACCT	2	12	2431743	2431754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016603	AAAAAC	2	12	2444793	2444804	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016603	ATTAAA	2	12	2451851	2451862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016603	ATAAAA	2	12	2460655	2460666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016603	TTTTTC	2	12	2488068	2488079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016603	ATTGAC	2	12	2490192	2490203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016603	AGATTA	2	12	2544304	2544315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016603	TTTTTA	2	12	2550549	2550560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016603	GCTTAT	2	12	2603270	2603281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016603	GTTAAA	2	12	2604144	2604155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016603	TAAATT	2	12	2607091	2607102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016603	ATTTAA	2	12	2607538	2607549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016603	AAATTT	2	12	2627255	2627266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016603	AATTTA	2	12	2627433	2627444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016603	AAAAAC	2	12	2640163	2640174	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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142	NC_016603	TATTTT	2	12	2783890	2783901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_016603	ATTTTT	2	12	2937543	2937554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_016603	TAAATT	2	12	3038580	3038591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.