MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p6

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016597	GGCG	2	8	149	156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016597	AAGG	2	8	697	704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016597	CCGT	2	8	898	905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016597	CTAC	2	8	22703	22710	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016597	CGCC	2	8	23143	23150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016597	CGCC	2	8	24877	24884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016597	AATG	2	8	34164	34171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016597	GAAA	2	8	34185	34192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016597	CGGC	2	8	36189	36196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016597	TTCA	2	8	36198	36205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016597	GAAG	2	8	45398	45405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016597	GCAT	2	8	46756	46763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016597	GCCG	2	8	48338	48345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016597	GCCC	2	8	48359	48366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016597	CGGC	2	8	48481	48488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016597	CGGC	2	8	64638	64645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016597	CCGT	2	8	64733	64740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016597	CAGC	2	8	67776	67783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016597	CACC	2	8	67790	67797	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_016597	CGCA	2	8	70353	70360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016597	GGCC	2	8	72667	72674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016597	GGAA	2	8	72702	72709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016597	CGGA	2	8	74467	74474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016597	CCCG	2	8	77083	77090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016597	GGCA	2	8	82878	82885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016597	CAAA	2	8	82996	83003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016597	GGGA	2	8	85459	85466	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016597	TAAC	2	8	86408	86415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016597	ATGC	2	8	86441	86448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016597	GGAT	2	8	86511	86518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016597	TTCG	2	8	86678	86685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016597	CGCC	2	8	88747	88754	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_016597	GCGG	2	8	89492	89499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016597	TCGA	2	8	90086	90093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016597	TGCT	2	8	92465	92472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016597	CGGA	2	8	93030	93037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016597	CCGG	2	8	93097	93104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016597	CCCG	2	8	103756	103763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_016597	TGGA	2	8	103935	103942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016597	AGCC	2	8	107545	107552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016597	CGCC	2	8	120587	120594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_016597	GGGC	2	8	120609	120616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016597	TCGC	2	8	120666	120673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016597	CTGC	2	8	120683	120690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016597	CCGT	2	8	124867	124874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016597	CGGG	2	8	124909	124916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016597	AGGA	2	8	127828	127835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016597	GTCC	2	8	127961	127968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016597	CTTT	2	8	129705	129712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016597	CATC	2	8	129871	129878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016597	CATG	2	8	129947	129954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016597	AAGA	2	8	130014	130021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016597	TTCT	2	8	130163	130170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016597	CCGT	2	8	131817	131824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016597	CGAT	2	8	134598	134605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016597	CCGG	2	8	137479	137486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016597	AAGG	2	8	137548	137555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016597	TAAA	2	8	137889	137896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016597	TCGA	2	8	140420	140427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016597	TTTC	2	8	141643	141650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016597	GAAA	2	8	141909	141916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016597	CAAG	2	8	142146	142153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016597	CTAT	2	8	142314	142321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016597	GAAG	2	8	153212	153219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016597	CAAG	2	8	153306	153313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016597	ATTG	2	8	153712	153719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016597	GAAG	2	8	153844	153851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016597	GACA	2	8	155128	155135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016597	ATAG	2	8	155180	155187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.