MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p6

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016597	CAG	2	6	30	35	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016597	GGC	2	6	65	70	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016597	CGT	2	6	131	136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016597	GGCG	2	8	149	156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016597	CGG	3	9	215	223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016597	ATC	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016597	CAT	2	6	276	281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016597	CGG	2	6	300	305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016597	ATG	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016597	CCG	2	6	331	336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016597	TCGCGG	2	12	343	354	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016597	CCT	2	6	437	442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016597	GCC	2	6	461	466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016597	GCC	2	6	492	497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016597	ATC	2	6	508	513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016597	CG	5	10	534	543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016597	CGT	2	6	558	563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016597	CGA	2	6	566	571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016597	GCA	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016597	CT	3	6	637	642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016597	AAGG	2	8	697	704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016597	CGC	3	9	708	716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016597	GGC	2	6	720	725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016597	GAC	2	6	729	734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016597	CAC	2	6	775	780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016597	TGA	2	6	845	850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016597	GGC	2	6	856	861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016597	GA	3	6	870	875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016597	GTT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016597	CCGT	2	8	898	905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016597	CG	3	6	932	937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016597	CGC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016597	CGG	2	6	6682	6687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016597	A	6	6	6762	6767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016597	TCG	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016597	GC	3	6	7365	7370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016597	CG	3	6	7371	7376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016597	CGG	2	6	16544	16549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016597	GCC	2	6	16696	16701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016597	CGG	2	6	16738	16743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016597	CCG	2	6	16755	16760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016597	CGGAC	2	10	16781	16790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016597	CGG	2	6	16819	16824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016597	TTG	2	6	17848	17853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016597	TCC	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016597	CGA	2	6	17875	17880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016597	GCC	2	6	17921	17926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016597	CAT	2	6	18035	18040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016597	GGC	2	6	18122	18127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016597	GTC	2	6	18150	18155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016597	CCG	2	6	18172	18177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016597	CCT	2	6	18210	18215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016597	C	6	6	18224	18229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_016597	CCG	2	6	20420	20425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016597	GCC	2	6	21687	21692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016597	CTAC	2	8	22703	22710	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016597	CCG	2	6	22758	22763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016597	CG	3	6	22822	22827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016597	CA	3	6	22935	22940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016597	TGT	2	6	22994	22999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016597	G	6	6	23040	23045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016597	GGC	2	6	23053	23058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016597	CGG	2	6	23110	23115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016597	CGCC	2	8	23143	23150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_016597	TCC	2	6	23156	23161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016597	GAG	2	6	23175	23180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016597	CGC	2	6	23194	23199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016597	CGA	2	6	24833	24838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016597	CCG	2	6	24845	24850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016597	CGCC	2	8	24877	24884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_016597	GTC	2	6	32275	32280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016597	ACC	2	6	32315	32320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016597	CCG	2	6	32331	32336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016597	GGC	2	6	32343	32348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016597	GCC	2	6	32362	32367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016597	GAT	2	6	34104	34109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016597	CTT	2	6	34143	34148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016597	AATG	2	8	34164	34171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016597	GAAA	2	8	34185	34192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016597	CAA	2	6	34255	34260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016597	CGC	2	6	34305	34310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016597	AGGAA	2	10	34335	34344	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016597	A	6	6	36145	36150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016597	CGGC	2	8	36189	36196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016597	TTCA	2	8	36198	36205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016597	TCT	2	6	36267	36272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016597	TGT	2	6	36303	36308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016597	GCG	2	6	36316	36321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016597	CGG	2	6	36331	36336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016597	CCG	2	6	37677	37682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016597	GCC	2	6	40486	40491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016597	AAG	2	6	40501	40506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016597	CGC	2	6	40517	40522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016597	CCG	2	6	40556	40561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016597	GAAG	2	8	45398	45405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016597	AG	3	6	45461	45466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016597	GCAT	2	8	46756	46763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016597	CG	3	6	46777	46782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016597	CGC	2	6	46812	46817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016597	TGG	2	6	46818	46823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016597	GC	3	6	47000	47005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016597	CCA	2	6	47047	47052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016597	CCG	2	6	47055	47060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016597	TGG	2	6	47074	47079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016597	GGCGCG	2	12	48242	48253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016597	AGC	2	6	48273	48278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016597	GCA	2	6	48298	48303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016597	GCA	2	6	48310	48315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016597	GCCG	2	8	48338	48345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016597	GCCC	2	8	48359	48366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016597	CA	3	6	48368	48373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016597	CTT	2	6	48378	48383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016597	ACC	2	6	48401	48406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016597	GC	4	8	48473	48480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016597	CGGC	2	8	48481	48488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016597	GC	3	6	48487	48492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016597	CGG	2	6	48497	48502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016597	GCC	2	6	48512	48517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016597	GGC	2	6	48518	48523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016597	GCCTG	2	10	48527	48536	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016597	GGA	2	6	50105	50110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016597	GGC	2	6	50115	50120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016597	A	6	6	51421	51426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016597	CTC	2	6	51428	51433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016597	CGC	2	6	51478	51483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016597	GAG	2	6	51485	51490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016597	GAA	2	6	51492	51497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016597	GGA	2	6	53347	53352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016597	GCC	2	6	54136	54141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016597	C	6	6	54164	54169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_016597	G	6	6	54206	54211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016597	CAT	2	6	54277	54282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016597	GCC	2	6	54428	54433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016597	GGC	2	6	54434	54439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016597	CCT	2	6	54493	54498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016597	AAG	2	6	55909	55914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016597	CGC	2	6	56263	56268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016597	GC	3	6	57439	57444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016597	CG	3	6	57451	57456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016597	GC	3	6	57461	57466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016597	CT	3	6	58309	58314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016597	GGC	2	6	58320	58325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016597	GAT	2	6	58411	58416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016597	GC	3	6	60795	60800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016597	CTG	2	6	60851	60856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016597	GC	3	6	60864	60869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016597	CTT	2	6	60911	60916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016597	CAG	2	6	60930	60935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_016597	TCC	2	6	155518	155523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
430	NC_016597	TGC	2	6	155606	155611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_016597	TCG	2	6	159526	159531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_016597	CGG	2	6	167021	167026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_016597	GC	3	6	167069	167074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
434	NC_016597	ACG	2	6	167138	167143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_016597	TGG	2	6	167151	167156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
436	NC_016597	G	6	6	167193	167198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
437	NC_016597	GC	3	6	167249	167254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
438	NC_016597	G	6	6	167352	167357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.