MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p4

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016596	GAGGGT	2	12	15862	15873	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016596	CGGCAC	2	12	22123	22134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016596	GAGGGT	2	12	42969	42980	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016596	CCAGCC	2	12	50993	51004	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016596	ACCCTC	2	12	55479	55490	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016596	AGGGTG	2	12	83388	83399	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016596	TTGCTG	2	12	155767	155778	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016596	ATGCCG	2	12	157910	157921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016596	CCGCTT	2	12	200607	200618	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016596	CCTCGA	2	12	263152	263163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016596	ATGGCG	2	12	263498	263509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016596	GCACCA	2	12	263529	263540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016596	TCCACC	2	12	263675	263686	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016596	ACCCTC	2	12	269030	269041	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016596	GCCCGC	2	12	301867	301878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016596	ACATGG	2	12	302920	302931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016596	TCCGGC	2	12	327168	327179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016596	TCGCCA	2	12	327529	327540	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016596	GCAGCG	2	12	328531	328542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016596	CCCTTC	2	12	362017	362028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016596	GCCACG	2	12	402278	402289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016596	GTTCCG	2	12	434666	434677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016596	CGATGC	2	12	443406	443417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016596	CGGCGT	2	12	444274	444285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016596	CGATGA	2	12	444523	444534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016596	GCGTGC	2	12	452204	452215	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016596	CCCGCG	2	12	477439	477450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016596	CGACGC	2	12	479002	479013	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016596	CGAATT	2	12	527554	527565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016596	GCGCTC	2	12	529053	529064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016596	GTTGGT	2	12	529248	529259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016596	CGAAGC	2	12	530499	530510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016596	AAAAAG	2	12	540190	540201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016596	TCCTGC	2	12	552401	552412	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016596	GGTCGG	2	12	552778	552789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016596	CCCGGC	2	12	556469	556480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016596	CGAGGT	2	12	584252	584263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016596	CCATCG	2	12	593139	593150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016596	CGCCAT	2	12	593152	593163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016596	GGTCAC	2	12	621645	621656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016596	TTTCGA	2	12	660737	660748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016596	GGCGCG	2	12	683686	683697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.