MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p4

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016596	AGCA	2	8	1329	1336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016596	GAGG	2	8	5663	5670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016596	CGCC	2	8	13839	13846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016596	GCGG	2	8	14012	14019	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016596	ACCC	2	8	14101	14108	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016596	GTTC	2	8	14130	14137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016596	GCGG	2	8	14681	14688	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016596	CCGC	2	8	15311	15318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016596	GAGG	2	8	15835	15842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016596	CCCG	2	8	15914	15921	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_016596	CGCA	2	8	15959	15966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016596	TCCC	2	8	22015	22022	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_016596	GGCG	2	8	22461	22468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016596	GCGG	2	8	22595	22602	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016596	CGGC	2	8	22877	22884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016596	GCCC	2	8	22918	22925	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_016596	GGGA	2	8	33653	33660	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016596	CGTC	2	8	35269	35276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016596	GAGG	2	8	42941	42948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016596	CCCG	2	8	43021	43028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_016596	CAGG	2	8	47576	47583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016596	GGTC	2	8	49576	49583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016596	CCGG	2	8	50940	50947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016596	CCCT	2	8	55509	55516	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016596	CCCT	2	8	59818	59825	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016596	CCTC	2	8	59858	59865	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016596	GGGC	2	8	65040	65047	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016596	GGAT	2	8	65065	65072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016596	AGGC	2	8	69382	69389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016596	GGGC	2	8	69428	69435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016596	GGAT	2	8	79444	79451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016596	CGGC	2	8	82220	82227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016596	CCAA	2	8	96270	96277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016596	CCGG	2	8	98791	98798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016596	GGGA	2	8	102090	102097	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016596	AGGG	2	8	102149	102156	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016596	CGGT	2	8	105601	105608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016596	GCCG	2	8	105649	105656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016596	GAAG	2	8	111393	111400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016596	CGCC	2	8	111468	111475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016596	CCCT	2	8	121311	121318	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_016596	CTCC	2	8	121351	121358	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_016596	GGGA	2	8	121372	121379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016596	GGGA	2	8	122903	122910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016596	TCGC	2	8	129331	129338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016596	TCCC	2	8	131086	131093	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_016596	TGGT	2	8	131570	131577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016596	CAAG	2	8	132450	132457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016596	CGCT	2	8	132524	132531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016596	TCGC	2	8	146271	146278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016596	CAAC	2	8	158070	158077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016596	GGCC	2	8	158094	158101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016596	GGCT	2	8	158217	158224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016596	GATT	2	8	166958	166965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016596	GGCG	2	8	175273	175280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016596	CGTT	2	8	181590	181597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016596	ATGA	2	8	181653	181660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016596	GATC	2	8	186908	186915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016596	CCCG	2	8	188458	188465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_016596	GGGA	2	8	198854	198861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016596	GCCG	2	8	198945	198952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016596	TGTT	2	8	199063	199070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016596	GAAC	2	8	199408	199415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016596	GTGA	2	8	199751	199758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016596	GGCC	2	8	200258	200265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016596	GAAT	2	8	200365	200372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016596	CCGG	2	8	200521	200528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016596	TGGC	2	8	200561	200568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016596	CGAA	2	8	215078	215085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016596	GAGT	2	8	215510	215517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016596	TGAG	2	8	215534	215541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016596	GGCA	2	8	217170	217177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016596	ACGT	2	8	217294	217301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016596	GCCC	2	8	220968	220975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_016596	GGGC	2	8	220993	221000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016596	TTTC	2	8	222073	222080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016596	CCTC	2	8	222248	222255	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_016596	CCGG	2	8	225907	225914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016596	TTGA	2	8	245911	245918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016596	CTGA	2	8	246766	246773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016596	CAAA	2	8	246849	246856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016596	CATA	2	8	246881	246888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016596	AAAG	2	8	247226	247233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016596	CCTG	2	8	247520	247527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016596	GCCT	2	8	247540	247547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016596	GATG	3	12	247642	247653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016596	TTGG	2	8	248247	248254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016596	CCGG	3	12	250047	250058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016596	TCCG	2	8	251161	251168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016596	CGGG	2	8	251600	251607	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016596	TGAT	2	8	254522	254529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016596	CCGC	2	8	254530	254537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_016596	CCCG	2	8	254593	254600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_016596	GAAT	2	8	255876	255883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016596	CGTT	2	8	260802	260809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016596	GCCC	2	8	260822	260829	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_016596	GCCG	2	8	264055	264062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016596	GGAG	2	8	268933	268940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016596	GCGG	2	8	268981	268988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016596	CCCT	2	8	269062	269069	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_016596	GGGC	2	8	270387	270394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016596	TGCC	2	8	272376	272383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016596	GCGG	2	8	272408	272415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016596	CGGT	2	8	274160	274167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016596	GTGG	2	8	281545	281552	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016596	CGGC	2	8	281682	281689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016596	CCAC	2	8	281748	281755	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_016596	CGGA	2	8	293381	293388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016596	CGCC	2	8	297031	297038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_016596	CCGC	2	8	300665	300672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016596	CCGA	2	8	300940	300947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016596	GGGC	2	8	301657	301664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016596	GACG	2	8	302000	302007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016596	GGCG	2	8	302069	302076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016596	TCGG	2	8	302358	302365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016596	TGCT	2	8	303366	303373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016596	GGTT	2	8	310746	310753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016596	CCCT	2	8	319352	319359	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_016596	AAAG	2	8	320268	320275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016596	TCCG	2	8	321419	321426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016596	ACAT	2	8	323211	323218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016596	CGGG	2	8	327731	327738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016596	CCGC	2	8	327902	327909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_016596	CGCC	2	8	328102	328109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_016596	GGAG	2	8	328437	328444	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016596	CAAA	2	8	330757	330764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016596	TCCC	2	8	331739	331746	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_016596	TCCA	2	8	339827	339834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016596	TCCG	2	8	348952	348959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016596	CGCC	2	8	354440	354447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_016596	GGGA	2	8	354593	354600	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016596	CTTT	2	8	356401	356408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016596	CCCG	2	8	360275	360282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_016596	CTGA	2	8	360299	360306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016596	GGCT	2	8	360908	360915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016596	GGGC	2	8	374145	374152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016596	GCCG	2	8	378205	378212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016596	GCCG	2	8	381334	381341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016596	GCCC	2	8	385346	385353	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016596	TCCG	2	8	388549	388556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016596	GCCC	2	8	395885	395892	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_016596	GTAC	2	8	396808	396815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016596	TGTC	2	8	403285	403292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016596	ACCC	2	8	403353	403360	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_016596	CGTT	2	8	403846	403853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016596	ATTG	2	8	404644	404651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016596	GAAA	2	8	404686	404693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016596	AAGA	2	8	409861	409868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016596	ATTA	2	8	409925	409932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016596	ACTG	2	8	410174	410181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016596	GGGA	2	8	422359	422366	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016596	AGGG	2	8	422403	422410	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016596	CGGC	2	8	423784	423791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016596	GGAA	2	8	425390	425397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016596	AGGA	2	8	433500	433507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016596	GCCG	2	8	434600	434607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_016596	CATA	2	8	434640	434647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_016596	CCAC	2	8	443638	443645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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160	NC_016596	AGGT	2	8	443919	443926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016596	ACCA	2	8	443993	444000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_016596	GCGG	3	12	444065	444076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
163	NC_016596	GCCG	2	8	444415	444422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_016596	GGGC	2	8	447887	447894	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_016596	GCCG	2	8	456560	456567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_016596	CATC	2	8	459640	459647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_016596	GACC	2	8	459709	459716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_016596	TACT	2	8	461503	461510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_016596	AGCC	2	8	461567	461574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_016596	AGGA	2	8	462607	462614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016596	CGGA	2	8	464251	464258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_016596	AGGG	2	8	467647	467654	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016596	AGGC	2	8	477104	477111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_016596	CGGC	2	8	478787	478794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_016596	TCGG	2	8	485639	485646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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184	NC_016596	GGGA	2	8	495613	495620	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_016596	TCCC	2	8	520766	520773	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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198	NC_016596	GGGA	2	8	520791	520798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_016596	CGGG	2	8	684726	684733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_016596	CTGA	2	8	689430	689437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
292	NC_016596	GGCC	2	8	690194	690201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.