MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016594	CCAGAT	2	12	12064	12075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016594	CGCCAC	2	12	22139	22150	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016594	TTCTTA	2	12	41512	41523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016594	CCCCGA	2	12	116304	116315	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016594	CTCCCC	2	12	140457	140468	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
6	NC_016594	CGTGAA	2	12	189180	189191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016594	TCTCGA	2	12	231362	231373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016594	CGGGAA	2	12	321839	321850	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016594	CACCCT	2	12	324124	324135	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016594	ACCCTC	2	12	346071	346082	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016594	TTCTCG	2	12	357576	357587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016594	GGTGCC	2	12	357737	357748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016594	GCGTCG	2	12	358131	358142	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016594	CACCCT	2	12	391222	391233	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016594	GCCGCA	2	12	391759	391770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016594	GCGCTC	2	12	418011	418022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016594	CGGCAT	2	12	419548	419559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016594	GGGGCT	3	18	419632	419649	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016594	TGGTCG	2	12	419829	419840	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016594	GGGTGC	2	12	420045	420056	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016594	GTGGCG	2	12	436184	436195	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016594	AGGACC	2	12	440105	440116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016594	CTTTTC	2	12	477603	477614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016594	CACCCT	2	12	489689	489700	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016594	ACGCCG	2	12	505152	505163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016594	GCGCTC	2	12	553038	553049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016594	AGGCGG	2	12	580783	580794	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016594	GACTCT	2	12	631851	631862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016594	TGGCCC	2	12	658424	658435	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016594	CGGCCA	2	12	666914	666925	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016594	CACCCT	2	12	694486	694497	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016594	GATCAT	2	12	792077	792088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016594	GATGGC	2	12	872872	872883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016594	GTGCCG	2	12	872924	872935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016594	CACCCT	2	12	882420	882431	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016594	ACCGGA	2	12	888845	888856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016594	CAGGGC	2	12	934433	934444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016594	TCGACC	2	12	961806	961817	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016594	GGCCCG	2	12	987645	987656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016594	AGGTCG	2	12	990312	990323	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016594	TGCCGA	2	12	990580	990591	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016594	CACCGG	2	12	991340	991351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016594	TCGTCC	2	12	992251	992262	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016594	TCGCGG	2	12	992647	992658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016594	CGTTTT	2	12	1006803	1006814	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016594	GCCGGC	2	12	1013510	1013521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016594	TCCTTG	2	12	1057438	1057449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016594	GATGTG	2	12	1071334	1071345	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016594	CAAGCT	2	12	1078368	1078379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016594	CTTTAT	2	12	1088061	1088072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016594	GTGCGG	2	12	1098178	1098189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016594	GCACAA	2	12	1126148	1126159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016594	AGGGTG	2	12	1147760	1147771	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016594	ACGCGC	2	12	1150235	1150246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016594	CCGGCG	2	12	1180325	1180336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016594	GCCCGA	2	12	1181020	1181031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016594	GTCGAG	2	12	1181068	1181079	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016594	GGTGAA	2	12	1194448	1194459	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016594	CGCCAG	2	12	1195278	1195289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016594	GAGGGT	2	12	1208538	1208549	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016594	ACCCTC	2	12	1213048	1213059	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016594	CGATCC	2	12	1215622	1215633	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016594	CGGTGG	2	12	1216590	1216601	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016594	CACGCC	2	12	1216915	1216926	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016594	CAGGGG	2	12	1265108	1265119	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016594	GATGGG	2	12	1267619	1267630	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016594	CTTCAC	2	12	1297847	1297858	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016594	GCTTTT	2	12	1302636	1302647	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016594	GTCCAT	2	12	1312868	1312879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016594	GAGGGT	2	12	1362463	1362474	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016594	CGCGCA	2	12	1369206	1369217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016594	CCGCGC	2	12	1369612	1369623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016594	TCCGCC	2	12	1369754	1369765	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016594	GGTGCC	2	12	1369984	1369995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016594	CGGGCG	2	12	1402839	1402850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016594	GGCTCA	2	12	1412784	1412795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016594	GGGGGT	2	12	1417506	1417517	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016594	CCCTGG	2	12	1426768	1426779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016594	GGCGCG	2	12	1442889	1442900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016594	GGAAAA	2	12	1451031	1451042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016594	GGAAAA	2	12	1453823	1453834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016594	TTCTCA	2	12	1454591	1454602	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016594	GGGCGA	2	12	1487411	1487422	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016594	ACGGCG	2	12	1487434	1487445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016594	GGCGAC	2	12	1487493	1487504	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016594	CGGTGA	2	12	1487582	1487593	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016594	ACCGTC	2	12	1488312	1488323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016594	TCGCCG	2	12	1488724	1488735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016594	GGGGCC	2	12	1490178	1490189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016594	TCGGCC	2	12	1490469	1490480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016594	GTGGCG	2	12	1501938	1501949	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016594	CGGGGC	2	12	1502338	1502349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016594	GCACCG	2	12	1502664	1502675	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016594	GGCGAC	2	12	1502903	1502914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016594	CTATGG	2	12	1503703	1503714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016594	ACCGCG	2	12	1527405	1527416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016594	AGACCG	2	12	1538078	1538089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016594	TCTCCC	2	12	1585278	1585289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016594	CCGTTC	2	12	1591253	1591264	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016594	CCAGCG	2	12	1607363	1607374	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016594	AAGGGT	2	12	1611014	1611025	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016594	GGCCGG	2	12	1663936	1663947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016594	CGGTGC	2	12	1704221	1704232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016594	GAACAA	2	12	1704256	1704267	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016594	TGGAGA	2	12	1729008	1729019	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016594	GCCAGG	2	12	1743222	1743233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016594	GCCGTG	2	12	1743307	1743318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016594	CCGGCC	2	12	1765898	1765909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.