MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p1

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016594	CGGGG	2	10	2252	2261	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016594	TCCCG	2	10	4496	4505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016594	AAGGG	2	10	5892	5901	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016594	CGGCG	2	10	11683	11692	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016594	GCCGG	2	10	12034	12043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016594	GAAGA	2	10	12963	12972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016594	CCCTT	2	10	31170	31179	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016594	GCAGC	2	10	38216	38225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016594	CCGCC	2	10	40848	40857	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_016594	TCTTT	2	10	41452	41461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016594	AAAAG	2	10	44662	44671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016594	CGCGG	2	10	44681	44690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016594	GCCGC	2	10	46013	46022	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_016594	GCGCC	3	15	46806	46820	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_016594	GGAGC	2	10	46992	47001	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016594	CGCGC	2	10	56310	56319	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_016594	CCGCT	2	10	60347	60356	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016594	AGGGG	2	10	68777	68786	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016594	CATCG	2	10	85081	85090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016594	GGGAA	2	10	94882	94891	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016594	CGCAG	2	10	99407	99416	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016594	AAAGG	2	10	110405	110414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016594	AGCCA	2	10	111670	111679	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016594	GGTTT	2	10	112411	112420	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016594	CCGGA	2	10	114793	114802	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016594	TCGGA	2	10	114873	114882	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016594	GCGCC	2	10	115862	115871	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016594	GGTGC	2	10	117626	117635	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016594	TCCCC	2	10	132484	132493	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30	NC_016594	CCCTG	2	10	135213	135222	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016594	AATTT	2	10	144789	144798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016594	GATTG	2	10	150516	150525	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016594	GTGAA	2	10	155477	155486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016594	TGGTT	2	10	162033	162042	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016594	TTTAT	2	10	162972	162981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016594	GCGCC	2	10	192912	192921	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_016594	CCGCC	2	10	192937	192946	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_016594	GATTG	2	10	199223	199232	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016594	TCCGG	2	10	206026	206035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016594	CTCCG	2	10	206046	206055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_016594	GTGCC	2	10	220399	220408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016594	TGGTT	2	10	224541	224550	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016594	GCCGG	2	10	225455	225464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016594	GGCGG	2	10	233489	233498	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016594	GACGG	2	10	259865	259874	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016594	GGAGG	2	10	262210	262219	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016594	CGCGG	2	10	270320	270329	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016594	CCCTC	2	10	272867	272876	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
49	NC_016594	CCCAC	2	10	273711	273720	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
50	NC_016594	TGGGG	2	10	281739	281748	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016594	CGGCG	2	10	301954	301963	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016594	GCTCC	2	10	313938	313947	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016594	CACCG	2	10	313979	313988	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_016594	ATCAA	2	10	314022	314031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016594	TTTGC	2	10	314152	314161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016594	GACCG	2	10	321755	321764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016594	GCCCG	2	10	332279	332288	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016594	TTCCG	2	10	337146	337155	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016594	CCGCC	2	10	337972	337981	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_016594	AAGGA	2	10	339410	339419	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016594	GCCGG	2	10	353795	353804	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016594	GCATA	2	10	356049	356058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016594	CGGCG	2	10	357853	357862	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016594	CCGCC	2	10	378740	378749	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_016594	CTGCC	2	10	379033	379042	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_016594	CGGGA	2	10	391266	391275	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016594	GCCCA	2	10	391725	391734	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_016594	GGCCG	2	10	392514	392523	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016594	CCGCC	2	10	395070	395079	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_016594	GCCGC	2	10	407689	407698	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_016594	CCCCT	2	10	413746	413755	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_016594	CCCCT	2	10	416254	416263	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_016594	GCAGG	2	10	417151	417160	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016594	CGCGC	2	10	419749	419758	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016594	GATCA	2	10	429352	429361	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016594	CCTGC	2	10	430585	430594	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_016594	CGCCC	2	10	432156	432165	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
78	NC_016594	CCCAC	2	10	434389	434398	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NC_016594	ACCGG	2	10	436087	436096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016594	CCCCG	2	10	464453	464462	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
81	NC_016594	CGGCC	2	10	465563	465572	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_016594	GCCGC	2	10	470239	470248	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_016594	ACCGC	2	10	478149	478158	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_016594	CCCTC	2	10	483904	483913	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
85	NC_016594	TCCCG	2	10	489615	489624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_016594	TGCGG	2	10	497747	497756	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016594	CCGTC	2	10	517180	517189	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_016594	CGGAG	2	10	545501	545510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016594	GGGCC	2	10	557821	557830	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016594	CCTGA	2	10	558596	558605	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016594	GCACC	2	10	567884	567893	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_016594	TTGAC	2	10	588563	588572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016594	TCCCC	2	10	591340	591349	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_016594	GCCGC	2	10	594607	594616	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_016594	GGCCG	2	10	595773	595782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016594	CCGGC	2	10	598435	598444	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_016594	CAGCG	2	10	600401	600410	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016594	CGGCA	2	10	600646	600655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016594	CCCCG	2	10	611193	611202	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_016594	CGCAC	2	10	612864	612873	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_016594	GCACC	2	10	613204	613213	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_016594	CCCCG	2	10	613265	613274	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
103	NC_016594	TCGCC	2	10	614538	614547	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016594	CGCCA	2	10	614724	614733	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_016594	GCCCG	2	10	615916	615925	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_016594	GGCAA	2	10	619345	619354	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016594	CCCGC	2	10	626227	626236	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
108	NC_016594	AGGGG	2	10	640739	640748	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016594	GCAGC	2	10	641165	641174	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016594	GCTGG	2	10	645891	645900	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016594	CTGGG	2	10	646340	646349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016594	TTTCG	2	10	646692	646701	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016594	CTTCC	2	10	653261	653270	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_016594	CGGGG	2	10	653291	653300	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016594	CCCTT	2	10	688798	688807	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016594	CGGGA	2	10	694530	694539	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016594	ACAGA	2	10	722831	722840	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016594	CCCAC	2	10	724355	724364	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_016594	CCGCA	2	10	724896	724905	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_016594	TGGCC	2	10	729652	729661	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016594	GCCGC	2	10	747662	747671	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016594	CGCTG	2	10	762098	762107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_016594	CTTGG	2	10	763851	763860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016594	TCAGG	2	10	774617	774626	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016594	CGCGG	2	10	781560	781569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016594	GTGCC	2	10	791650	791659	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016594	TCGGG	2	10	795230	795239	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016594	TCCCT	2	10	796662	796671	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_016594	ACCAT	2	10	797763	797772	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016594	CACAC	2	10	798650	798659	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_016594	GCGCC	2	10	804241	804250	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_016594	GCCGG	2	10	817553	817562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016594	TCCCC	2	10	817708	817717	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_016594	TTCTC	2	10	817834	817843	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016594	CGACG	2	10	843772	843781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016594	CGCGG	2	10	848297	848306	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016594	CCCTC	2	10	864593	864602	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_016594	CAGCG	2	10	872348	872357	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_016594	CGGGC	2	10	872580	872589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016594	CAGGA	2	10	873320	873329	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016594	GGAAT	2	10	875858	875867	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016594	CGCCC	2	10	876047	876056	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
143	NC_016594	GGGCG	2	10	876077	876086	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016594	CCGTC	2	10	876090	876099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_016594	GGCGT	2	10	880731	880740	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016594	AGTAG	2	10	885924	885933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016594	CCGCG	2	10	891689	891698	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_016594	GGAGC	2	10	891859	891868	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_016594	GGAGG	2	10	898044	898053	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016594	CCGGC	2	10	902773	902782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
151	NC_016594	CCGCG	2	10	907923	907932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_016594	CCAGA	2	10	909504	909513	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_016594	GGACG	2	10	910061	910070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016594	CTGAC	2	10	913548	913557	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_016594	CACGA	2	10	913949	913958	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_016594	CCGAA	2	10	914842	914851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_016594	GAAGT	2	10	928900	928909	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016594	TTTTC	2	10	934540	934549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_016594	ACGTC	2	10	942628	942637	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_016594	CCCGG	2	10	948794	948803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
161	NC_016594	AGGTC	2	10	951986	951995	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_016594	CGCTG	2	10	954016	954025	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_016594	AGGGG	2	10	958817	958826	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016594	CGGCG	2	10	961717	961726	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_016594	TCCGC	2	10	962102	962111	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
166	NC_016594	GGGGT	2	10	972833	972842	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016594	AGGGG	2	10	972876	972885	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016594	GGGAC	2	10	977341	977350	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_016594	AGGGG	2	10	983310	983319	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016594	GATCG	2	10	987923	987932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_016594	GCCGG	2	10	988646	988655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
173	NC_016594	GCACC	2	10	991979	991988	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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175	NC_016594	CCGGG	2	10	1005527	1005536	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_016594	TTCCG	2	10	1041862	1041871	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_016594	CCGGA	2	10	1069601	1069610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_016594	GTCCG	2	10	1071250	1071259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_016594	CCCGG	2	10	1081731	1081740	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_016594	GGTCA	2	10	1100743	1100752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_016594	TCCGT	2	10	1110163	1110172	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_016594	TCCCC	2	10	1110914	1110923	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
195	NC_016594	GGACC	2	10	1111981	1111990	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
196	NC_016594	AGGGG	2	10	1119131	1119140	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016594	AATGA	2	10	1126075	1126084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_016594	CCTAT	2	10	1129668	1129677	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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203	NC_016594	GGTTG	2	10	1151290	1151299	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_016594	CCGTC	2	10	1298966	1298975	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
224	NC_016594	CCGCG	2	10	1302378	1302387	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
225	NC_016594	GCCGG	2	10	1312158	1312167	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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232	NC_016594	CCGGT	2	10	1363584	1363593	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_016594	TTCGG	2	10	1578672	1578681	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_016594	TCGTG	2	10	1579565	1579574	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_016594	AGGGG	2	10	1585263	1585272	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_016594	CCGAC	2	10	1607450	1607459	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
286	NC_016594	CGGCG	2	10	1607756	1607765	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
287	NC_016594	GGGGA	2	10	1650262	1650271	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016594	TTTCG	2	10	1658916	1658925	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
289	NC_016594	GCGCG	2	10	1675724	1675733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
290	NC_016594	CCGCC	2	10	1677886	1677895	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
291	NC_016594	GAGAC	2	10	1692067	1692076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
292	NC_016594	ACCAA	2	10	1696196	1696205	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_016594	ACCCG	2	10	1703130	1703139	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
294	NC_016594	GTGCG	2	10	1708736	1708745	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
295	NC_016594	AAGTA	2	10	1713524	1713533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016594	TTGGT	2	10	1713678	1713687	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
297	NC_016594	GACGC	2	10	1716896	1716905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
298	NC_016594	ATCGG	2	10	1728682	1728691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
299	NC_016594	GAACT	2	10	1729088	1729097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
300	NC_016594	AGGGG	2	10	1733542	1733551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
301	NC_016594	CGGGG	2	10	1733603	1733612	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
302	NC_016594	CGGTC	2	10	1742970	1742979	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
303	NC_016594	AGGCG	2	10	1743510	1743519	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
304	NC_016594	GAAGG	2	10	1743701	1743710	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
305	NC_016594	CGGAC	2	10	1757007	1757016	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.