MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016587	TC	3	6	22328	22333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016587	CA	3	6	23891	23896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016587	TC	3	6	33320	33325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016587	CG	4	8	40441	40448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016587	CG	3	6	46922	46927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016587	GC	3	6	50290	50295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016587	TG	3	6	55673	55678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016587	AT	3	6	58289	58294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016587	CG	4	8	62577	62584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016587	TC	3	6	70573	70578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016587	GC	3	6	72711	72716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016587	AC	3	6	73035	73040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016587	CG	4	8	80164	80171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016587	CG	3	6	80746	80751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016587	AT	3	6	96885	96890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016587	GC	4	8	101303	101310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016587	TG	3	6	103552	103557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016587	CA	3	6	107760	107765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016587	TG	3	6	107936	107941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016587	TC	3	6	108487	108492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016587	CA	3	6	108772	108777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016587	CA	3	6	111207	111212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016587	CG	3	6	114162	114167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016587	CG	4	8	115265	115272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016587	GC	3	6	118761	118766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016587	TG	3	6	119077	119082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016587	AT	3	6	119534	119539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016587	GC	3	6	120106	120111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016587	CG	3	6	124196	124201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016587	TG	3	6	128361	128366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016587	AC	3	6	128938	128943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016587	CG	3	6	133000	133005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016587	GA	3	6	136453	136458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016587	GA	3	6	140810	140815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016587	GC	3	6	147973	147978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016587	AT	3	6	158925	158930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016587	GC	3	6	164266	164271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016587	CT	3	6	176056	176061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016587	GA	4	8	182899	182906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016587	AT	3	6	182930	182935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016587	GA	3	6	182954	182959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016587	CG	3	6	183056	183061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016587	GC	3	6	205630	205635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016587	CG	3	6	205703	205708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016587	AT	3	6	224340	224345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016587	CG	3	6	226323	226328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016587	CG	3	6	226511	226516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016587	AG	3	6	227209	227214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016587	TC	4	8	227353	227360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016587	CG	3	6	227556	227561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016587	CA	3	6	227649	227654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016587	AG	3	6	227699	227704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016587	TC	3	6	230680	230685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016587	AG	3	6	247912	247917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016587	GC	3	6	250199	250204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016587	TG	3	6	263332	263337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016587	CG	3	6	263730	263735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016587	GC	3	6	263807	263812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016587	GC	3	6	264045	264050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016587	CG	4	8	267691	267698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016587	CG	3	6	268378	268383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016587	GC	3	6	268457	268462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016587	GC	3	6	268470	268475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016587	CG	4	8	270824	270831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016587	GA	3	6	287860	287865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016587	CG	3	6	294231	294236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016587	GA	3	6	296613	296618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016587	TG	3	6	314336	314341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016587	GA	3	6	317979	317984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016587	GC	3	6	318724	318729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016587	AG	3	6	321868	321873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016587	GA	3	6	324180	324185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016587	GC	3	6	325393	325398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016587	CG	3	6	328058	328063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016587	CG	3	6	328075	328080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016587	TC	3	6	328857	328862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016587	GA	3	6	328900	328905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016587	GC	3	6	328917	328922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016587	TC	3	6	332770	332775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016587	AG	3	6	332857	332862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016587	AG	3	6	335853	335858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016587	CT	3	6	336283	336288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016587	CG	3	6	339366	339371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016587	CG	3	6	339381	339386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016587	AG	3	6	345165	345170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016587	CT	3	6	349333	349338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016587	GC	3	6	353086	353091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016587	GC	3	6	353182	353187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016587	GC	3	6	353771	353776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016587	GC	3	6	356467	356472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016587	CA	3	6	376811	376816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016587	TG	3	6	377015	377020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016587	GA	3	6	377039	377044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016587	GC	3	6	388528	388533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016587	CG	3	6	388757	388762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016587	CG	3	6	393185	393190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016587	AG	3	6	400984	400989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016587	CG	3	6	410130	410135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016587	GC	3	6	412989	412994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016587	GC	3	6	423611	423616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016587	CG	3	6	427492	427497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016587	GC	3	6	438503	438508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016587	GC	4	8	445873	445880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016587	CG	3	6	447516	447521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016587	AT	3	6	447615	447620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016587	GC	3	6	452898	452903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016587	GA	3	6	454088	454093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016587	GA	3	6	456109	456114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016587	CG	3	6	458041	458046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016587	CA	3	6	464196	464201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016587	CG	3	6	465475	465480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016587	TC	4	8	469723	469730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016587	CA	3	6	473696	473701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016587	TG	3	6	473872	473877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016587	GA	3	6	474114	474119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016587	AT	3	6	478135	478140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016587	AT	3	6	479446	479451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016587	AT	3	6	484863	484868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016587	CT	3	6	484943	484948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016587	GC	3	6	491099	491104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016587	GA	3	6	494056	494061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016587	TC	3	6	514951	514956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016587	TG	3	6	515116	515121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016587	AT	3	6	515129	515134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016587	CG	4	8	515165	515172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016587	GC	3	6	515994	515999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016587	GT	3	6	520668	520673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016587	GT	3	6	523206	523211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016587	CG	3	6	524429	524434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016587	CT	3	6	527001	527006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016587	AG	3	6	527163	527168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016587	CG	3	6	529224	529229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016587	AG	3	6	532348	532353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016587	AT	3	6	532453	532458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016587	GT	3	6	532480	532485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016587	TA	3	6	533663	533668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016587	GC	3	6	541332	541337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016587	CG	3	6	541805	541810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016587	GC	3	6	542096	542101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016587	GA	3	6	542835	542840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016587	AG	3	6	549638	549643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016587	GT	3	6	549646	549651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016587	CG	3	6	559946	559951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016587	CG	3	6	560139	560144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016587	CG	4	8	597930	597937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016587	GA	3	6	600129	600134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016587	CG	3	6	601464	601469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016587	AT	3	6	603710	603715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016587	GC	3	6	606648	606653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016587	AG	3	6	607755	607760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016587	CT	3	6	608454	608459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016587	CG	3	6	611770	611775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_016587	CG	4	8	619273	619280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016587	GC	3	6	619340	619345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_016587	CG	3	6	619972	619977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_016587	GC	3	6	619981	619986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_016587	GT	3	6	630309	630314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016587	CG	3	6	641458	641463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_016587	CG	3	6	643390	643395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.